71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1321 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1321  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 327 aa  675    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.918656 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1220  Alpha/beta hydrolase  85.93 
 
 		 327 aa  590  1e-168  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.438077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1405  alpha/beta hydrolase fold  69.16 
 
 		 331 aa  481  1e-135  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.301031  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0258  alpha/beta hydrolase fold  62.94 
 
 		 329 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.125918  normal  0.242066 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4013  Alpha/beta hydrolase  55.1 
 
 		 317 aa  345  6e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.377921  normal  0.0298464 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3768  alpha/beta hydrolase fold  54.08 
 
 		 317 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0122064 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1697  alpha/beta hydrolase fold  55.29 
 
 		 317 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0294365  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1259  hypothetical protein  51.7 
 
 		 316 aa  310  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909105  normal  0.0175405 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6447  putative alpha/beta hydrolase fold  50.79 
 
 		 322 aa  308  6.999999999999999e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.794257 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4635  putative alpha/beta hydrolase fold protein  51.74 
 
 		 343 aa  301  1e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.709746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4268  putative alpha/beta hydrolase fold  51.21 
 
 		 342 aa  299  4e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.489115  normal  0.522453 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4783  putative alpha/beta hydrolase fold  51.9 
 
 		 342 aa  299  4e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.878297 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2882  alpha/beta hydrolase fold  50 
 
 		 342 aa  272  5.000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.652094  normal  0.31238 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5702  alpha/beta hydrolase fold  46.95 
 
 		 342 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11841  hitchhiker  0.00380393 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0565  alpha/beta hydrolase fold  38.46 
 
 		 321 aa  162  8.000000000000001e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2807  alpha/beta hydrolase fold protein  32.04 
 
 		 311 aa  119  7e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.16124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2969  alpha/beta hydrolase fold protein  33.71 
 
 		 327 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.248343  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2157  alpha/beta hydrolase fold protein  33.06 
 
 		 293 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.048331  hitchhiker  0.0048272 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2474  alpha/beta hydrolase fold protein  32.02 
 
 		 340 aa  99.8  6e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.680809  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4130  alpha/beta hydrolase fold  33.05 
 
 		 289 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000608421 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0898  alpha/beta hydrolase fold protein  31.23 
 
 		 320 aa  94.4  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2288  Alpha/beta hydrolase fold  27.18 
 
 		 296 aa  90.1  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.906188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1914  alpha/beta hydrolase fold  30.86 
 
 		 289 aa  89  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000204003  unclonable  0.0000086861 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0512  alpha/beta hydrolase fold protein  29.62 
 
 		 318 aa  88.2  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.106161  normal  0.950535 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0937  alpha/beta hydrolase fold protein  24.35 
 
 		 300 aa  80.1  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0495  alpha/beta hydrolase fold  34.38 
 
 		 327 aa  79.3  0.00000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0656  Alpha/beta hydrolase fold  26.16 
 
 		 299 aa  72.8  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.198236  decreased coverage  0.00768241 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3531  alpha/beta hydrolase fold protein  25.23 
 
 		 329 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.290128  normal  0.539158 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3223  Alpha/beta hydrolase fold  27.48 
 
 		 300 aa  69.3  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1638  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  28.07 
 
 		 298 aa  69.3  0.00000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3663  alpha/beta hydrolase fold  24.58 
 
 		 304 aa  66.6  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30576  normal  0.0729234 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3062  hypothetical protein  25.73 
 
 		 288 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2276  alpha/beta hydrolase fold protein  23.72 
 
 		 305 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0234  hypothetical protein  27.27 
 
 		 330 aa  58.2  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.833519 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  27.71 
 
 		 265 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2242  alpha/beta hydrolase fold  26.87 
 
 		 301 aa  50.4  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.545637  normal  0.560868 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06730  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  32.39 
 
 		 343 aa  49.7  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  25.81 
 
 		 314 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.143754 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1778  alpha/beta hydrolase fold  34.78 
 
 		 366 aa  48.9  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0401666  normal  0.253947 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3466  alpha/beta hydrolase fold protein  35.24 
 
 		 390 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  31.48 
 
 		 309 aa  47.8  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4676  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  22.98 
 
 		 331 aa  47.8  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.318593  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3822  alpha/beta hydrolase fold  30.08 
 
 		 308 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  22.86 
 
 		 262 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4590  alpha/beta hydrolase fold protein  30.65 
 
 		 327 aa  47.4  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.775489  normal  0.0737458 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1028  hypothetical protein  24.87 
 
 		 318 aa  46.6  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3797  alpha/beta hydrolase fold protein  31.78 
 
 		 248 aa  47  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  42.11 
 
 		 308 aa  46.6  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4130  alpha/beta hydrolase fold protein  30.08 
 
 		 301 aa  45.8  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0269  hypothetical protein  25.89 
 
 		 293 aa  45.4  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3801  alpha/beta hydrolase fold protein  32.04 
 
 		 267 aa  45.1  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11921  Alpha/beta hydrolase fold  26.56 
 
 		 310 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0537  dihydrolipoamide acetyltransferase, putative  25.21 
 
 		 292 aa  45.1  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.169084  normal  0.40861 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4026  alpha/beta hydrolase fold protein  31.58 
 
 		 298 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4562  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 260 aa  44.3  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0675  alpha/beta hydrolase fold  27.56 
 
 		 290 aa  43.9  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0467323 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22090  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  38.57 
 
 		 285 aa  44.3  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00622193 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13190  lysophospholipase  31.03 
 
 		 262 aa  43.9  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0607698  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1448  Alpha/beta hydrolase fold  27.68 
 
 		 286 aa  43.9  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2535  alpha/beta hydrolase fold  23.57 
 
 		 344 aa  43.1  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.36 
 
 		 370 aa  43.1  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1097  alpha/beta hydrolase fold protein  25.35 
 
 		 299 aa  42.7  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11931  Alpha/beta hydrolase fold  26.06 
 
 		 299 aa  43.1  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1121  alpha/beta hydrolase fold protein  30.7 
 
 		 322 aa  43.1  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0626  Alpha/beta hydrolase fold  26.9 
 
 		 308 aa  43.1  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.434824 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1269  hypothetical protein  25.13 
 
 		 285 aa  42.7  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2782  alpha/beta hydrolase fold protein  32.69 
 
 		 325 aa  42.7  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0931  alpha/beta hydrolase fold  22.5 
 
 		 274 aa  42.7  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  27.5 
 
 		 278 aa  42.7  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_4818  predicted protein  31.78 
 
 		 280 aa  42.7  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0396  alpha/beta hydrolase fold protein  31.21 
 
 		 255 aa  42.7  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.075233 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>