More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1083 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007958  RPD_1083  HesB/YadR/YfhF  100 
 
 
106 aa  216  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0979  HesB/YadR/YfhF  94.34 
 
 
106 aa  207  5e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.29141 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5091  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  90.57 
 
 
106 aa  196  6e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4453  HesB/YadR/YfhF  80.19 
 
 
106 aa  181  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0483  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  66.98 
 
 
107 aa  140  4e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3583  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  63.21 
 
 
106 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0213074 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4021  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  58.49 
 
 
106 aa  128  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0106  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  58.49 
 
 
106 aa  125  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.809451 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0532  hypothetical protein  58.1 
 
 
106 aa  122  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0361463  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2184  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  58.1 
 
 
106 aa  122  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.24202 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5909  Iron-binding protein IscA (iron-sulfur cluster assembly protein)  59.05 
 
 
107 aa  122  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01610  Nitrogen fixation Fe-S cluster assembly protein IscAnif  56.19 
 
 
107 aa  120  6e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3622  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  56.19 
 
 
106 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.246464 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1255  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  55.24 
 
 
106 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2271  HesB/YadR/YfhF  51.43 
 
 
110 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.563165  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1560  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  54.29 
 
 
106 aa  108  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3589  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  49.04 
 
 
127 aa  107  6e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200335 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1509  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  50.48 
 
 
122 aa  103  6e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00886553  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1227  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  50.48 
 
 
122 aa  103  6e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000951684 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3939  HesB/YadR/YfhF  47.22 
 
 
123 aa  102  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0246542 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3630  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.71 
 
 
127 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3562  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.71 
 
 
127 aa  101  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.558968  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0954  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.12 
 
 
133 aa  100  4e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.557942  normal  0.360876 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2652  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.57 
 
 
105 aa  101  4e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.758195  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3478  HesB/YadR/YfhF  44.76 
 
 
127 aa  100  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1823  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.08 
 
 
119 aa  100  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3032  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.62 
 
 
121 aa  100  7e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1795  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.08 
 
 
119 aa  100  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4257  HesB/YadR/YfhF  45.37 
 
 
123 aa  100  9e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0639  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.27 
 
 
109 aa  99.4  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.248132  normal  0.354977 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3121  HesB/YadR/YfhF  43.27 
 
 
120 aa  99.4  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.105861  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5075  hesB/yadR/yfhF family protein  44.76 
 
 
117 aa  98.2  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4805  hesB/yadR/yfhF family protein  44.76 
 
 
130 aa  98.6  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4646  hypothetical protein  44.76 
 
 
130 aa  98.6  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4666  hypothetical protein  44.76 
 
 
130 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5044  hesB/yadR/yfhF family protein  44.76 
 
 
117 aa  98.2  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5169  hesB/yadR/yfhF family protein  44.76 
 
 
117 aa  98.2  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4803  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.4 
 
 
121 aa  98.2  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.901063 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0482  HesB/YadR/YfhF  45.28 
 
 
123 aa  98.2  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.239223  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2733  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.86 
 
 
139 aa  98.2  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5078  hesB/yadR/yfhF family protein  44.76 
 
 
117 aa  98.2  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1797  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.27 
 
 
120 aa  98.6  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.654159  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0167  hesB/yadR/yfhF family protein  44.76 
 
 
117 aa  97.8  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2279  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.81 
 
 
130 aa  97.4  5e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000000652366  hitchhiker  0.00000000102221 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4755  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.81 
 
 
117 aa  97.8  5e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5073  hesB/yadR/yfhF family protein  44.76 
 
 
130 aa  97.4  6e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2887  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.76 
 
 
120 aa  97.4  6e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1303  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.86 
 
 
116 aa  97.1  7e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00012282 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3154  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.19 
 
 
115 aa  97.1  7e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.889922  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3544  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.81 
 
 
117 aa  97.1  7e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2181  HesB/YadR/YfhF  47.12 
 
 
122 aa  96.7  9e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0323  HesB/YadR/YfhF  43.27 
 
 
140 aa  96.3  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000000123552  hitchhiker  0.00657769 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0827  HesB family protein  44.23 
 
 
113 aa  96.3  1e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0389955  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1343  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.95 
 
 
124 aa  95.5  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.388172  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6870  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  49.06 
 
 
206 aa  95.5  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0629  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.23 
 
 
110 aa  95.9  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2772  HesB/YadR/YfhF  42.86 
 
 
141 aa  95.5  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4144  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.18 
 
 
116 aa  95.5  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0915367  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3304  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.19 
 
 
120 aa  95.9  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.181185 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0620  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.23 
 
 
110 aa  95.9  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.779082  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46030  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.23 
 
 
116 aa  94.7  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3536  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.23 
 
 
120 aa  95.1  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0677815  hitchhiker  0.00231818 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0594  HesB/YadR/YfhF  44.23 
 
 
110 aa  95.1  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2109  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  52.38 
 
 
124 aa  94.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00107266 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1664  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.23 
 
 
121 aa  94.4  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.138511 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2191  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.27 
 
 
111 aa  94.7  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.757462  normal  0.0205433 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1285  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.19 
 
 
117 aa  94.4  5e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.257084 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1235  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.86 
 
 
116 aa  94.4  5e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.014396  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1041  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.81 
 
 
117 aa  93.2  9e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1413  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.95 
 
 
118 aa  93.6  9e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0526  HesB domain-containing protein  43.27 
 
 
119 aa  92.8  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.255563  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0349  HesB/YadR/YfhF  42.72 
 
 
113 aa  92  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1011  HesB/YadR/YfhF  41.35 
 
 
116 aa  91.7  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.752752  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2494  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  50 
 
 
121 aa  91.7  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.686511  normal  0.176727 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0535  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.31 
 
 
121 aa  92  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110729  normal  0.812504 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12232  hypothetical protein  43.27 
 
 
118 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000227512  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0940  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.23 
 
 
119 aa  90.9  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0204493  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0959  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.23 
 
 
119 aa  90.9  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0861768  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1463  FeS assembly scaffold SufA  43.27 
 
 
130 aa  90.9  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0458373 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3146  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.27 
 
 
120 aa  90.9  5e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3701  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.16 
 
 
130 aa  90.5  6e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14110  Iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.31 
 
 
118 aa  90.9  6e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3261  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.35 
 
 
122 aa  90.5  7e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.347724  normal  0.0260089 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3258  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.27 
 
 
122 aa  90.5  7e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0083346  hitchhiker  0.0000911572 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0653  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.31 
 
 
116 aa  90.1  9e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.8310399999999997e-21  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0806  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.27 
 
 
116 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106738  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1513  HesB/YadR/YfhF  40.95 
 
 
107 aa  89.4  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5101  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.14 
 
 
116 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000105722  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0240  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  53.75 
 
 
120 aa  89.4  1e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4770  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.12 
 
 
132 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00616694  normal  0.727621 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1883  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.1 
 
 
119 aa  89.7  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.324909  hitchhiker  0.0039414 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2522  scaffold protein for iron-sulphur cluster assembly  44.34 
 
 
108 aa  90.1  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08510  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.27 
 
 
116 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.64455  hitchhiker  0.000000019455 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0748  HesB/YadR/YfhF family protein  43.27 
 
 
130 aa  89  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00160104  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0605  HesB/YadR/YfhF family protein  43.14 
 
 
116 aa  89  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2452  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  49.4 
 
 
121 aa  89  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.162096 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4568  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.14 
 
 
116 aa  89  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.420029  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0951  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.9 
 
 
106 aa  88.6  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.031021 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0886  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.9 
 
 
106 aa  88.6  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.62045  normal  0.0717209 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2665  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.31 
 
 
117 aa  89.4  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.840353  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>