32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1069 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1069  hypothetical protein  100 
 
 		 85 aa  175  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0965  NifZ  84.52 
 
 		 85 aa  148  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.201713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5105  NifZ family protein  83.12 
 
 		 77 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4467  NifZ  73.61 
 
 		 76 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3640  NifZ family protein  65.28 
 
 		 79 aa  108  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.231555 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0402  NifZ family protein  68.92 
 
 		 82 aa  107  7.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0117  NifZ family protein  63.51 
 
 		 81 aa  103  7e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.788219 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5898  hypothetical protein  66.22 
 
 		 82 aa  103  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00590287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1252  NifZ family protein  56.76 
 
 		 84 aa  90.5  7e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.355595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1536  NifZ domain protein  56.76 
 
 		 83 aa  90.5  7e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0210  nifZ protein, putative  57.14 
 
 		 89 aa  89.7  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.000650031  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1410  NifZ protein, putative  53.52 
 
 		 92 aa  86.7  9e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1451  hypothetical protein  48.78 
 
 		 91 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00482298 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1580  NifZ family protein  55.41 
 
 		 103 aa  79.7  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.854887 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5106  NifZ family protein  37.97 
 
 		 99 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0964  NifZ  39.02 
 
 		 99 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.338549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1068  NifZ  38.55 
 
 		 99 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4468  NifZ  37.66 
 
 		 101 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0947  NifZ family protein  38.89 
 
 		 82 aa  54.3  0.0000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0285448  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3641  NifZ family protein  38.16 
 
 		 101 aa  49.7  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.175493 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3957  NifZ  32.1 
 
 		 95 aa  47  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000304465  hitchhiker  0.00212617 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4243  NifZ  33.33 
 
 		 88 aa  44.7  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2128  NifZ family protein  37.33 
 
 		 88 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.560071 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01680  nitrogen fixation protein NifZ  31.71 
 
 		 159 aa  43.9  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4479  NifZ  32.43 
 
 		 119 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.248929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2368  NifZ family protein  32 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.464814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1803  NifZ family protein  32 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.250711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1775  NifZ family protein  32 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6872  NifZ family protein  32.88 
 
 		 116 aa  41.2  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.253487 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7776  NifZ family protein  29.33 
 
 		 122 aa  40.4  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.357027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1394  NifZ  31.43 
 
 		 151 aa  40.4  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0463497  normal  0.159008 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7745  NifZ family protein  29.33 
 
 		 140 aa  40  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>