More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1003 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_3040  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  66.67 
 
 		 815 aa  1062    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0561  putative adenylate/guanylate cyclase  65.69 
 
 		 817 aa  1063    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.436202 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0891  adenylate/guanylate cyclase  86.01 
 
 		 822 aa  1403    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.508191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1003  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  100 
 
 		 879 aa  1755    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.528155 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1885  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.55 
 
 		 792 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1887  adenylate/guanylate cyclase  60.24 
 
 		 403 aa  322  1.9999999999999998e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5295  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.7 
 
 		 873 aa  249  2e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00758089  normal  0.057217 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5659  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.37 
 
 		 680 aa  235  3e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0045  adenylate/guanylate cyclase  48.61 
 
 		 382 aa  229  1e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0055  sensor protein  33.02 
 
 		 717 aa  224  6e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.782355 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6425  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  53.4 
 
 		 588 aa  211  6e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2387  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  45.75 
 
 		 604 aa  203  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179199  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1100  putative adenylate/guanylate cyclase  36.11 
 
 		 479 aa  155  4e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  38.32 
 
 		 614 aa  147  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1173  ribosomal protein L19  34.58 
 
 		 460 aa  144  7e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000211521 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  34.88 
 
 		 611 aa  143  9.999999999999999e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1610  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  33.48 
 
 		 528 aa  141  6e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1821  adenylate/guanylate cyclase  33.87 
 
 		 738 aa  140  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0453734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  36.62 
 
 		 864 aa  137  7.000000000000001e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0289  adenylate/guanylate cyclase  31.85 
 
 		 526 aa  137  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4495  adenylate/guanylate cyclase  34.95 
 
 		 532 aa  137  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0629136  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  34.54 
 
 		 858 aa  136  1.9999999999999998e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3177  adenylate/guanylate cyclase with GAF and PAS/PAC sensors  35.62 
 
 		 971 aa  135  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1999  adenylate/guanylate cyclase  34.68 
 
 		 524 aa  134  6e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3361  adenylate/guanylate cyclase  34.95 
 
 		 529 aa  134  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 		 861 aa  133  2.0000000000000002e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0647  adenylate/guanylate cyclase  32.88 
 
 		 911 aa  132  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.707555  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3568  adenylate/guanylate cyclase  34.95 
 
 		 526 aa  132  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.456079 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1908  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain  31.23 
 
 		 518 aa  131  4.0000000000000003e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136997  normal  0.266082 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2161  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  32.88 
 
 		 1020 aa  131  5.0000000000000004e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0428251  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4465  adenylate/guanylate cyclase  37.83 
 
 		 561 aa  131  7.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.419976 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  32.7 
 
 		 860 aa  130  8.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32750  Adenylate cyclase protein  35.05 
 
 		 465 aa  130  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.811274  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1406  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  38.1 
 
 		 757 aa  130  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.9726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  33.73 
 
 		 859 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1908  hypothetical protein  34.74 
 
 		 446 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.798697  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2176  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  31.82 
 
 		 662 aa  129  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249495  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1643  adenylate/guanylate cyclase  37.04 
 
 		 536 aa  129  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.292421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  35.05 
 
 		 735 aa  129  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1823  putative adenylate/guanylate cyclase  33.8 
 
 		 462 aa  127  6e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.534836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22620  hypothetical protein  33.8 
 
 		 463 aa  127  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.438633  hitchhiker  0.00108909 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1658  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  35.74 
 
 		 577 aa  127  9e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.791017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4571  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain protein  25.65 
 
 		 546 aa  126  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.226096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0296  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  36.22 
 
 		 672 aa  125  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2694  putative PAS/PAC sensor protein  34.96 
 
 		 969 aa  126  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0176534  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0280  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  36.76 
 
 		 656 aa  125  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  32.42 
 
 		 665 aa  126  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1538  hypothetical protein  29.64 
 
 		 431 aa  125  3e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1077  adenylate cyclase  28.43 
 
 		 513 aa  125  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2124  adenylate/guanylate cyclase  36.54 
 
 		 516 aa  124  5e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0559  adenylate/guanylate cyclase  33.97 
 
 		 523 aa  124  5e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.855978  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1264  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  29.86 
 
 		 584 aa  124  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1295  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  29.86 
 
 		 584 aa  123  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1446  hypothetical protein  29.29 
 
 		 441 aa  122  3e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1969  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.49 
 
 		 696 aa  122  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0397866  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0343  transmembrane sensor-like domain-containing protein  36.76 
 
 		 638 aa  122  3e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0940  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  36.84 
 
 		 597 aa  121  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326683  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2619  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  36.56 
 
 		 658 aa  120  9e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.103266  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4585  adenylate/guanylate cyclase  33.18 
 
 		 744 aa  120  9e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0862409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4085  adenylate/guanylate cyclase  35.11 
 
 		 746 aa  120  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1344  adenylate/guanylate cyclase  30.22 
 
 		 794 aa  119  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1844  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  35.29 
 
 		 725 aa  119  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.266709 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0983  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  35.37 
 
 		 737 aa  119  3.9999999999999997e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1894  putative Chase2 sensor protein  32.16 
 
 		 729 aa  118  3.9999999999999997e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0276882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1597  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  39.9 
 
 		 981 aa  117  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000711164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1802  adenylate/guanylate cyclase  33.85 
 
 		 591 aa  117  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3398  adenylate/guanylate cyclase  31.78 
 
 		 662 aa  116  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.71233  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  32.31 
 
 		 1093 aa  115  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3621  putative adenylate/guanylate cyclase  36.59 
 
 		 607 aa  115  5e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0034  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  30.91 
 
 		 758 aa  115  5e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000015313  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0331  putative adenylate/guanylate cyclase  30.45 
 
 		 641 aa  114  9e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3884  adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 		 667 aa  114  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0015  putative adenylate/guanylate cyclase  34.18 
 
 		 284 aa  112  4.0000000000000004e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.391867  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2382  adenylate/guanylate cyclase  31.22 
 
 		 752 aa  112  4.0000000000000004e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  31.77 
 
 		 1207 aa  110  9.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18180  putative Chase2 sensor protein  32.24 
 
 		 582 aa  110  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000385352  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1662  adenylate/guanylate cyclase  30.21 
 
 		 472 aa  110  1e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.491568  hitchhiker  0.000617786 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  33.16 
 
 		 701 aa  110  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3755  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.94 
 
 		 678 aa  109  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5293  adenylate/guanylate cyclase  35.39 
 
 		 421 aa  109  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0545376  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3163  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  36.92 
 
 		 643 aa  109  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1477  putative adenylate/guanylate cyclase  30.18 
 
 		 903 aa  108  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.861008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0506  adenylate/guanylate cyclase  35.78 
 
 		 380 aa  108  6e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.149903  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  31.22 
 
 		 645 aa  107  8e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3663  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  35.32 
 
 		 723 aa  107  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93824  normal  0.384107 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1858  adenylate/guanylate cyclase  28.39 
 
 		 734 aa  107  9e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.88873  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1986  adenylate cyclase, putative  30.88 
 
 		 636 aa  107  1e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000955851  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  35.43 
 
 		 701 aa  107  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1110  adenylate/guanylate cyclase  28.87 
 
 		 348 aa  107  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0224811  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2543  adenylate/guanylate cyclase  26.88 
 
 		 712 aa  106  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000118563  normal  0.086844 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1064  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  33.88 
 
 		 1226 aa  105  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1131  adenylate cyclase  31.22 
 
 		 483 aa  105  3e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1135  adenylate cyclase  30.73 
 
 		 483 aa  105  4e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2169  adenylate/guanylate cyclase  34.74 
 
 		 756 aa  105  4e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0505849  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3360  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  34.83 
 
 		 723 aa  105  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3697  adenylate/guanylate cyclase  27.4 
 
 		 696 aa  105  5e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.61471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2253  adenylate cyclase  31.14 
 
 		 518 aa  105  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0171825 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1763  putative Chase2 sensor protein  33.66 
 
 		 725 aa  104  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.0880592 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  36.21 
 
 		 1134 aa  104  6e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8980  Adenylate cyclase family 3 (some protein contain HAMP domain)-like protein  32.43 
 
 		 684 aa  104  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>