178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0910 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0910  filamentation induced by cAMP protein Fic  100 
 
 		 564 aa  1162    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.555407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0908  hypothetical protein  41.7 
 
 		 503 aa  392  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.207571  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1736  filamentation induced by cAMP protein Fic  40.73 
 
 		 502 aa  373  1e-102  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00739697  normal  0.272754 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1647  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.16 
 
 		 502 aa  375  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.887162  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0597  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.16 
 
 		 512 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1039  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.17 
 
 		 516 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1534  filamentation induced by cAMP protein Fic  39.38 
 
 		 537 aa  317  3e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0431591 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6486  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.84 
 
 		 514 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.761112 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0890  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.81 
 
 		 555 aa  276  1.0000000000000001e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0367824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2096  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.06 
 
 		 479 aa  257  3e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0353  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.77 
 
 		 495 aa  246  9e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49750  filamentation induced by cAMP protein  33.18 
 
 		 509 aa  243  5e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2025  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.86 
 
 		 507 aa  229  9e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.509627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2666  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.24 
 
 		 496 aa  225  1e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.939916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0276  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.85 
 
 		 498 aa  226  1e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4531  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.28 
 
 		 514 aa  225  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.139108 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2191  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.14 
 
 		 508 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.154961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2022  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.74 
 
 		 505 aa  214  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.486943 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0424  hypothetical protein  31.64 
 
 		 512 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00863334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1899  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.24 
 
 		 511 aa  213  5.999999999999999e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.669104  normal  0.246162 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1561  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.79 
 
 		 536 aa  212  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2182  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.73 
 
 		 513 aa  211  3e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.108003  normal  0.0333314 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2478  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.14 
 
 		 526 aa  209  8e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.321663  normal  0.723541 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0051  hypothetical protein  28.09 
 
 		 519 aa  202  9.999999999999999e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7027  putative filamentation induced by cAMP protein Fic  30.38 
 
 		 537 aa  195  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0133469  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6074  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.54 
 
 		 544 aa  189  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0607  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.66 
 
 		 412 aa  76.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0601  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.06 
 
 		 408 aa  72.4  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0593  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.18 
 
 		 412 aa  72.4  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33230  hypothetical protein  37.17 
 
 		 408 aa  68.6  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0154  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.13 
 
 		 393 aa  66.2  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0242065 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3978  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.43 
 
 		 422 aa  66.2  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3761  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.22 
 
 		 430 aa  64.3  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.651271  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5504  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.79 
 
 		 394 aa  64.3  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0732622  normal  0.099278 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4178  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.7 
 
 		 368 aa  63.9  0.000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.130851  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22590  hypothetical protein  34.48 
 
 		 429 aa  62  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22980  hypothetical protein  29.15 
 
 		 406 aa  61.6  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.249401  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1798  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.37 
 
 		 427 aa  60.1  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000000635308  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4488  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.64 
 
 		 380 aa  59.3  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05510  hypothetical protein  34.58 
 
 		 394 aa  59.3  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0010  hypothetical protein  32.29 
 
 		 383 aa  57.8  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2737  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.36 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0264056  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3251  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.79 
 
 		 393 aa  57.4  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0798212  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1541  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.86 
 
 		 364 aa  57  0.0000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6016  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.4 
 
 		 343 aa  57  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00688605 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3019  filamentation induced by cAMP protein Fic  42.47 
 
 		 403 aa  56.6  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2529  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.21 
 
 		 402 aa  57  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0723  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.63 
 
 		 373 aa  56.6  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.43274  hitchhiker  0.00000454462 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2194  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.33 
 
 		 400 aa  56.2  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1471  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.93 
 
 		 369 aa  56.2  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4188  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.17 
 
 		 381 aa  55.1  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.635354  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25050  hypothetical protein  34.62 
 
 		 397 aa  54.7  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1002  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.77 
 
 		 531 aa  54.7  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1635  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.85 
 
 		 326 aa  54.3  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0044  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.96 
 
 		 419 aa  53.9  0.000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.203132 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0828  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.33 
 
 		 509 aa  53.9  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3067  filamentation induced by cAMP protein Fic  35 
 
 		 374 aa  53.5  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0823  Fic family protein  36.46 
 
 		 389 aa  53.1  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0937  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.41 
 
 		 368 aa  53.1  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0190  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.61 
 
 		 384 aa  53.1  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1314  Fic family protein  28.78 
 
 		 359 aa  52.8  0.00002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.148349  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0980  hypothetical protein  37.89 
 
 		 367 aa  52.4  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0812833  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2127  filamentation induced by cAMP protein Fic  39.22 
 
 		 367 aa  52.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.296141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1182  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.68 
 
 		 374 aa  52.8  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3619  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.46 
 
 		 376 aa  52.8  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2057  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.5 
 
 		 377 aa  52.4  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3069  filamentation induced by cAMP protein Fic  35 
 
 		 309 aa  52.4  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0276  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.29 
 
 		 387 aa  52.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.475066  unclonable  0.0000132219 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3490  Fic family protein  36.46 
 
 		 376 aa  52.8  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2288  hypothetical protein  49.02 
 
 		 502 aa  52  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4664  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.05 
 
 		 376 aa  52  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.433809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2003  fic family protein  33.6 
 
 		 377 aa  52  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0278833  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2357  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.17 
 
 		 371 aa  52  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1955  filamentation induced by cAMP protein Fic  22.51 
 
 		 333 aa  52  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.484154  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3472  filamentation induced by cAMP protein Fic  22.51 
 
 		 333 aa  52  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0909  hypothetical protein  36.76 
 
 		 328 aa  52  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.27357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2264  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.04 
 
 		 384 aa  52  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1095  filamentation induced by cAMP protein (Fic) family protein  31.31 
 
 		 374 aa  51.6  0.00004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.298399  normal  0.261915 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4212  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.45 
 
 		 424 aa  51.6  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.515355  normal  0.918692 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2494  hypothetical protein  31.01 
 
 		 342 aa  51.2  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1731  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.34 
 
 		 380 aa  50.8  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3261  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.46 
 
 		 502 aa  50.8  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.464971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3312  hypothetical protein  36.56 
 
 		 376 aa  50.8  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00970462  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2641  Fic family protein  25.49 
 
 		 328 aa  50.4  0.00008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000103829  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3413  hypothetical protein  35.05 
 
 		 371 aa  50.4  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0523  Fic family protein  35.35 
 
 		 376 aa  50.4  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3955  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.25 
 
 		 384 aa  50.4  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0416  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.65 
 
 		 336 aa  50.1  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0861  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.9 
 
 		 400 aa  50.1  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.244501 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1441  hypothetical protein  30.83 
 
 		 367 aa  49.7  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0810  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.03 
 
 		 267 aa  49.7  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0799  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.03 
 
 		 267 aa  49.7  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3972  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.28 
 
 		 385 aa  50.4  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2207  hypothetical protein  30.43 
 
 		 348 aa  49.7  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000284697  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1366  filamentation induced by cAMP protein Fic  39.68 
 
 		 371 aa  49.7  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2002  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.29 
 
 		 375 aa  50.1  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.733317  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2174  Fic family protein  30.43 
 
 		 348 aa  49.7  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2616  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.68 
 
 		 368 aa  48.9  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2152  filamentation induced by cAMP protein Fic  23.35 
 
 		 374 aa  49.3  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.164511  normal  0.297035 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2726  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.66 
 
 		 395 aa  49.3  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>