More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0891 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0891  phosphate transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 274 aa  567  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5263  phosphate transporter ATP-binding protein  93.8 
 
 		 273 aa  531  1e-150  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0779  phosphate transporter ATP-binding protein  91.24 
 
 		 274 aa  518  1e-146  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.18086 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4920  phosphate transporter ATP-binding protein  87.32 
 
 		 275 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.506329 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0638  phosphate transporter ATP-binding protein  84.31 
 
 		 272 aa  484  1e-136  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0509  phosphate transporter ATP-binding protein  83.64 
 
 		 273 aa  476  1e-133  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.518327 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1989  phosphate transporter ATP-binding protein  88.93 
 
 		 266 aa  474  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0836  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  79.44 
 
 		 260 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00992429 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3411  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  75.58 
 
 		 258 aa  413  1e-114  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.30355 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4242  phosphate transporter ATP-binding protein  72.91 
 
 		 269 aa  401  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2341  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  71.71 
 
 		 271 aa  402  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.113454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4079  phosphate transporter ATP-binding protein  72.91 
 
 		 269 aa  401  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4185  phosphate transporter ATP-binding protein  72.91 
 
 		 269 aa  401  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4063  phosphate transporter ATP-binding protein  72.91 
 
 		 269 aa  401  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7425  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  69.14 
 
 		 270 aa  400  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4135  phosphate transporter ATP-binding protein  72.91 
 
 		 269 aa  401  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0659059  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03609  phosphate transporter subunit  72.11 
 
 		 257 aa  397  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4242  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  72.11 
 
 		 257 aa  397  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1715  phosphate transporter ATP-binding protein  74.19 
 
 		 263 aa  397  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.141839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4236  phosphate transporter ATP-binding protein  72.11 
 
 		 257 aa  397  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4089  phosphate transporter ATP-binding protein  72.11 
 
 		 257 aa  397  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.85473 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4140  phosphate transporter ATP-binding protein  72.91 
 
 		 257 aa  399  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5154  phosphate transporter ATP-binding protein  72.11 
 
 		 257 aa  397  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.550814 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3940  phosphate transporter ATP-binding protein  72.11 
 
 		 257 aa  397  9.999999999999999e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4203  phosphate transporter ATP-binding protein  72.11 
 
 		 257 aa  397  9.999999999999999e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1929  phosphate transporter ATP-binding protein  73.2 
 
 		 305 aa  397  9.999999999999999e-111  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0381146  normal  0.0357892 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4269  phosphate transporter ATP-binding protein  72.11 
 
 		 257 aa  397  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6687  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  72.11 
 
 		 270 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.523672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0015  phosphate transporter ATP-binding protein  73.09 
 
 		 258 aa  397  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.426365  normal  0.139833 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03553  hypothetical protein  72.11 
 
 		 257 aa  397  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1489  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  72.29 
 
 		 260 aa  394  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4587  phosphate transporter ATP-binding protein  72.98 
 
 		 257 aa  396  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1192  phosphate transporter ATP-binding protein  68.77 
 
 		 282 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.270941  normal  0.470836 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4194  phosphate transporter ATP-binding protein  71.89 
 
 		 258 aa  394  1e-109  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.256725  hitchhiker  0.00751177 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4266  phosphate transporter ATP-binding protein  72.98 
 
 		 257 aa  396  1e-109  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5183  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  72.11 
 
 		 271 aa  394  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2222  phosphate transporter ATP-binding protein  73.2 
 
 		 264 aa  394  1e-109  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.150141 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1180  phosphate transporter ATP-binding protein  68.77 
 
 		 282 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5255  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  72.51 
 
 		 271 aa  395  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.273698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2023  phosphate transporter ATP-binding protein  73.79 
 
 		 263 aa  396  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.157085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1599  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  75.92 
 
 		 278 aa  395  1e-109  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4234  phosphate transporter ATP-binding protein  71.89 
 
 		 258 aa  394  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4002  phosphate transporter ATP-binding protein  72.69 
 
 		 258 aa  397  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4168  phosphate transporter ATP-binding protein  71.89 
 
 		 258 aa  394  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2203  phosphate transporter ATP-binding protein  72.69 
 
 		 260 aa  395  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.574176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2369  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  72.29 
 
 		 260 aa  394  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4716  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  72.11 
 
 		 271 aa  394  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.309342 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1294  phosphate transporter ATP-binding protein  72.29 
 
 		 282 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2811  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  73.09 
 
 		 261 aa  391  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0783  phosphate transporter ATP-binding protein  72.29 
 
 		 280 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.431594  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2164  phosphate transporter ATP-binding protein  73.09 
 
 		 262 aa  393  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.13557  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4915  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  72.29 
 
 		 260 aa  391  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.508237  normal  0.341234 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1139  phosphate transport system permease protein 1  73.06 
 
 		 260 aa  391  1e-108  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.89911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1621  phosphate transporter ATP-binding protein  72.29 
 
 		 282 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4446  phosphate transporter ATP-binding protein  68.77 
 
 		 282 aa  393  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1488  phosphate transporter ATP-binding protein  72.29 
 
 		 282 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4211  phosphate transporter ATP-binding protein  71.49 
 
 		 258 aa  390  1e-108  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2770  phosphate transporter ATP-binding protein  72.29 
 
 		 282 aa  392  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.13521  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0577  phosphate transporter ATP-binding protein  72.29 
 
 		 282 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0618048  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2182  phosphate transporter ATP-binding protein  73.09 
 
 		 262 aa  393  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.508405  normal  0.137715 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1518  phosphate transporter ATP-binding protein  72.29 
 
 		 282 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2267  phosphate transporter ATP-binding protein  72.69 
 
 		 303 aa  394  1e-108  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2017  phosphate transporter ATP-binding protein  68.4 
 
 		 282 aa  391  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0574  phosphate transporter ATP-binding protein  72.29 
 
 		 282 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.149562  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2629  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  71.31 
 
 		 260 aa  392  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.119732  normal  0.10241 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1532  phosphate transporter ATP-binding protein  72.58 
 
 		 263 aa  390  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.207162  normal  0.97409 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1156  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  71.49 
 
 		 255 aa  390  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.206732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1439  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  71.49 
 
 		 255 aa  390  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0822  phosphate transporter ATP-binding protein  67.66 
 
 		 282 aa  388  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1274  phosphate transporter ATP-binding protein  67.66 
 
 		 282 aa  388  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1303  phosphate transporter ATP-binding protein  67.66 
 
 		 282 aa  388  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348683  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2855  phosphate transporter ATP-binding protein  67.54 
 
 		 282 aa  387  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0200  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  66.67 
 
 		 274 aa  387  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0885  phosphate transporter ATP-binding protein  67.91 
 
 		 282 aa  387  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.850781  normal  0.0377374 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1269  phosphate transporter ATP-binding protein  67.54 
 
 		 282 aa  386  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.237624  normal  0.121063 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3272  phosphate transporter ATP-binding protein  73.06 
 
 		 265 aa  387  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.143231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2686  phosphate transporter ATP-binding protein  73.06 
 
 		 265 aa  387  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0630967  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2314  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  69.88 
 
 		 259 aa  386  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.422428  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1794  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  69.84 
 
 		 295 aa  386  1e-106  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0186801  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3537  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  66.91 
 
 		 292 aa  382  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.88144 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2255  phosphate transporter ATP-binding protein  69.88 
 
 		 263 aa  382  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0688488  normal  0.650517 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1290  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  72.73 
 
 		 261 aa  382  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0580  phosphate ABC transporter permease  68.95 
 
 		 259 aa  378  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2949  phosphate transporter ATP-binding protein  68.9 
 
 		 267 aa  378  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2830  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  69.32 
 
 		 278 aa  372  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.730487  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1308  phosphate transporter ATP-binding protein  67.6 
 
 		 276 aa  364  1e-100  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.43291 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00535  phosphate transporter ATP-binding protein  67.2 
 
 		 276 aa  365  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.328186  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1275  phosphate transport ATP-binding protein  71.77 
 
 		 261 aa  366  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1285  phosphate transporter ATP-binding protein  66.4 
 
 		 284 aa  357  9.999999999999999e-98  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0744  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  66.4 
 
 		 254 aa  357  9.999999999999999e-98  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121752  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1349  phosphate transporter ATP-binding protein  66.4 
 
 		 284 aa  357  9.999999999999999e-98  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.112011  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3266  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  64.26 
 
 		 259 aa  349  3e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.198153  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3103  phosphate transporter ATP-binding protein  64.26 
 
 		 259 aa  349  3e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0127377  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1335  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  68.15 
 
 		 268 aa  340  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21550  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  63.75 
 
 		 253 aa  337  9e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0381  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  63.6 
 
 		 260 aa  337  9e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0977682  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1013  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  64.26 
 
 		 251 aa  335  3.9999999999999995e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0621  phosphate transporter ATP-binding protein  64 
 
 		 261 aa  335  5.999999999999999e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1101  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  58.27 
 
 		 292 aa  335  5.999999999999999e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0114  phosphate ABC transporter permease  63.31 
 
 		 252 aa  334  1e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>