246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0753 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0753  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 400 aa  820    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0053  hypothetical protein  25.73 
 
 		 382 aa  76.3  0.0000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000565511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0631  glycosyltransferase protein  25.83 
 
 		 446 aa  67.4  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2187  glycosyl transferase family 2  32.46 
 
 		 343 aa  67.4  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.804947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2673  putative glycosyl transferase  37.04 
 
 		 280 aa  65.9  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.237365 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2297  putative glycosyl transferase  37.38 
 
 		 303 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.038696  normal  0.220934 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2348  putative glycosyl transferase  37.38 
 
 		 303 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3120  family 2 glycosyl transferase  33.33 
 
 		 329 aa  65.1  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2341  putative glycosyl transferase  37.38 
 
 		 280 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151265  normal  0.569311 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2455  putative glycosyl transferase  37.38 
 
 		 303 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0151212 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2240  putative glycosyl transferase  37.38 
 
 		 280 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0042  glycosyl transferase family 2  29.27 
 
 		 326 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0044  glycosyl transferase family 2  29.27 
 
 		 326 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1236  glycosyl transferase  35.29 
 
 		 302 aa  63.2  0.000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.215388 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01965  predicted glycosyl transferase  37.96 
 
 		 279 aa  62  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01954  hypothetical protein  37.96 
 
 		 279 aa  62  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1609  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 280 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00100883  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1598  glycosyl transferase family 2  37.04 
 
 		 279 aa  59.7  0.00000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2994  putative glycosyl transferase  37.04 
 
 		 279 aa  59.7  0.00000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00854526 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1582  putative glycosyl transferase  37.04 
 
 		 279 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2352  putative glycosyl transferase  36.11 
 
 		 279 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4968  glycosyl transferase family protein  33.98 
 
 		 338 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1003  putative glycosyl transferase  36.11 
 
 		 279 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1145  general glycosylation pathway protein  33.64 
 
 		 309 aa  58.2  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1270  general glycosylation pathway protein  33.64 
 
 		 309 aa  58.2  0.0000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.553122  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2950  glycosyl transferase family protein  31.73 
 
 		 376 aa  57.8  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.268496 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2980  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  27.59 
 
 		 317 aa  57  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.815971 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3285  glycosyl transferase family 2  32.67 
 
 		 296 aa  57  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.044685 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0593  general glycosylation pathway protein  32.73 
 
 		 309 aa  56.6  0.0000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.422601  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4247  glycosyl transferase family 2  34.65 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1152  glycosyl transferase family 2  31.63 
 
 		 370 aa  56.2  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.186653  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3099  glycosyl transferase family protein  25.37 
 
 		 303 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.122373  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44450  Glycosyl transferase, family 2 protein  35.92 
 
 		 340 aa  55.5  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1120  glycosyl transferase family protein  30.69 
 
 		 324 aa  54.7  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0838715 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 		 1252 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 		 1252 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1242  glycosyl transferase family 2  30.69 
 
 		 287 aa  54.3  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.012024 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1697  glycosyl transferase family protein  29.46 
 
 		 336 aa  53.9  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.591253  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0402  glycosyl transferase family 2  29.73 
 
 		 342 aa  53.1  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2168  glycosyl transferase family protein  34.65 
 
 		 360 aa  53.1  0.000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3103  glycosyl transferase family 2  29.7 
 
 		 338 aa  52.8  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0642  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  29.32 
 
 		 306 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1479  methyltransferase type 11  29.91 
 
 		 2046 aa  52.4  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.604446 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  32.43 
 
 		 1250 aa  52.4  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2567  glycosyl transferase family 2  30.25 
 
 		 295 aa  52.4  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.852695  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2585  glycosyl transferase family 2  35.64 
 
 		 264 aa  52.4  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3218  glycosyl transferase family protein  29.81 
 
 		 246 aa  52.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3536  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.58 
 
 		 851 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000936493 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3321  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.58 
 
 		 851 aa  52.4  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3284  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.58 
 
 		 851 aa  52.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0268448  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3236  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.58 
 
 		 851 aa  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1615  glycosyl transferase family 2  27.01 
 
 		 331 aa  52  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.665959  normal  0.16082 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  30.77 
 
 		 321 aa  52  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3582  group 2 family glycosyl transferase  24.58 
 
 		 851 aa  52.4  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  32.69 
 
 		 235 aa  52  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0603  glycosyl transferase family 2  30 
 
 		 282 aa  51.6  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0488  glycosyl transferase family protein  32.31 
 
 		 609 aa  51.6  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4597  glycosyl transferase family 2  29.36 
 
 		 307 aa  52  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  27.21 
 
 		 334 aa  52  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1217  general glycosylation pathway protein  30.17 
 
 		 320 aa  51.6  0.00003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2683  glycosyl transferase family protein  28.7 
 
 		 295 aa  51.6  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4680  glycosyl transferase family protein  31.86 
 
 		 367 aa  51.2  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.359899 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2026  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.12 
 
 		 853 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.739679  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2048  glycosyl transferase family protein  28.12 
 
 		 750 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2164  glycosyl transferase family 2  25 
 
 		 330 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0339  glycosyl transferase family 2  33.81 
 
 		 304 aa  50.8  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.479436  normal  0.396217 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1672  glycosyl transferase family 2  26.92 
 
 		 289 aa  50.4  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.365918  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1200  glycosyl transferase family 2  27.52 
 
 		 319 aa  50.4  0.00005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0281003  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  31.31 
 
 		 302 aa  50.4  0.00006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3336  glycosyl transferase family protein  26.87 
 
 		 1268 aa  50.4  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3187  glycosyl transferase family protein  24.04 
 
 		 320 aa  50.1  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.225557  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2504  glycosyl transferase family protein  29.29 
 
 		 373 aa  50.1  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.695425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2262  glycosyl transferase, group 2  29.73 
 
 		 386 aa  50.1  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0148  glycosyl transferase family protein  31.78 
 
 		 350 aa  50.1  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.341853  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0556  glycosyl transferase family protein  31.3 
 
 		 349 aa  49.7  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.532544  normal  0.84686 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0155  glycosyl transferase family 2  24.66 
 
 		 298 aa  49.7  0.00009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1948  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.21 
 
 		 853 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1565  glycosyl transferase family 2  29 
 
 		 970 aa  49.3  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000603283  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1122  glycosyl transferase family protein  28.85 
 
 		 364 aa  49.3  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0952  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 		 276 aa  49.7  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.768268 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0396  glycosyl transferase family protein  29.03 
 
 		 625 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1492  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 		 958 aa  49.7  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0878  glycosyl transferase family protein  29.03 
 
 		 625 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2216  glycosyl transferase family protein  28.81 
 
 		 378 aa  49.3  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3044  glycosyl transferase family protein  26.56 
 
 		 297 aa  49.3  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3057  glycosyl transferase family protein  35.19 
 
 		 318 aa  49.3  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2561  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.64 
 
 		 957 aa  48.1  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1967  glycosyl transferase family protein  29.9 
 
 		 300 aa  48.1  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1420  glycosyl transferase family protein  30.84 
 
 		 261 aa  48.5  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1049  glycosyl transferase family protein  27.62 
 
 		 295 aa  48.5  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.173501  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1450  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  31.37 
 
 		 134 aa  48.1  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.069354  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1391  glycosyl transferase family 2  33.64 
 
 		 209 aa  48.1  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.961124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14251  hypothetical protein  28 
 
 		 218 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.485314  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1428  hypothetical protein  27.7 
 
 		 346 aa  48.9  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.166911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3380  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.66 
 
 		 853 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.74419e-17 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8186  glycosyl transferase family 2  27.71 
 
 		 299 aa  48.9  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3874  glycosyl transferase family protein  34.38 
 
 		 313 aa  48.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0495804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3698  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 		 256 aa  48.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1547  glycosyl transferase family 2  28 
 
 		 326 aa  48.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0333  glycosyl transferase family protein  23.3 
 
 		 277 aa  48.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0642645  decreased coverage  0.00000584386 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>