124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0721 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0160  major facilitator transporter  78.92 
 
 		 462 aa  701    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0083  major facilitator transporter  90.91 
 
 		 462 aa  827    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.339646  normal  0.26187 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0022  major facilitator transporter  77.32 
 
 		 463 aa  710    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0721  major facilitator transporter  100 
 
 		 465 aa  902    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0192  major facilitator transporter  79.73 
 
 		 469 aa  707    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0027  major facilitator superfamily MFS_1  84.52 
 
 		 465 aa  782    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.453112  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0322  major facilitator transporter  74.54 
 
 		 467 aa  634  1e-180  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.169916  normal  0.209035 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1429  major facilitator transporter  56.83 
 
 		 466 aa  496  1e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.218982  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1817  hypothetical protein  47.3 
 
 		 455 aa  406  1.0000000000000001e-112  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.404559  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4238  major facilitator superfamily MFS_1  46.58 
 
 		 462 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.239966 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3914  major facilitator superfamily MFS_1  45.34 
 
 		 462 aa  402  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.133818 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1085  major facilitator transporter  46.24 
 
 		 493 aa  396  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.445039  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4369  hypothetical protein  46.7 
 
 		 440 aa  384  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.486519  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3421  major facilitator transporter  46.44 
 
 		 466 aa  381  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.564111  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3188  major facilitator transporter  46.14 
 
 		 463 aa  375  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.988714 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3337  major facilitator superfamily (MFS) transporter  45.52 
 
 		 443 aa  375  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0343  major facilitator transporter  42.32 
 
 		 454 aa  344  2e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.911823 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1317  major facilitator transporter  39.57 
 
 		 474 aa  321  9.999999999999999e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.8065  hitchhiker  0.00000263926 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0020  major facilitator transporter  45.88 
 
 		 456 aa  318  1e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.482167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2937  major facilitator superfamily transporter  37.77 
 
 		 435 aa  301  2e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.413148  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2658  major facilitator transporter  41.92 
 
 		 469 aa  300  4e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.494745  normal  0.637588 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0030  major facilitator transporter  45.1 
 
 		 456 aa  289  6e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2130  major facilitator family transporter  37.5 
 
 		 435 aa  289  6e-77  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0193  transporter, MFS superfamily  37.5 
 
 		 460 aa  288  2e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1362  major facilitator transporter  44.42 
 
 		 456 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1316  major facilitator transporter  37.72 
 
 		 492 aa  280  6e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.387007  hitchhiker  0.0000142592 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3661  major facilitator transporter  41.27 
 
 		 426 aa  278  1e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1010  major facilitator transporter  37.74 
 
 		 429 aa  277  3e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0334  hypothetical protein  37.1 
 
 		 424 aa  276  6e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0315  hypothetical protein  36.2 
 
 		 424 aa  267  2.9999999999999995e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1842  major facilitator superfamily MFS_1  37.45 
 
 		 451 aa  267  4e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2662  major facilitator transporter  35.21 
 
 		 460 aa  265  8.999999999999999e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1522  major facilitator superfamily MFS_1  30.2 
 
 		 426 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.101861  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1654  major facilitator transporter  31.54 
 
 		 416 aa  196  6e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4202  hypothetical protein  31.74 
 
 		 479 aa  195  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.246317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0936  MFS transporter family protein  31.39 
 
 		 458 aa  191  2e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3661  major facilitator superfamily MFS_1  33.49 
 
 		 467 aa  192  2e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1624  major facilitator superfamily MFS_1  29.91 
 
 		 421 aa  189  8e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.767884  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1324  MFS transporter family protein  31.63 
 
 		 425 aa  189  1e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2368  major facilitator superfamily MFS_1  30.72 
 
 		 445 aa  188  2e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.854492  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0635  major facilitator superfamily MFS_1  32.03 
 
 		 456 aa  187  4e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.636916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1012  major facilitator superfamily MFS_1  29.95 
 
 		 428 aa  181  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.389524 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3874  major facilitator transporter  32.55 
 
 		 467 aa  180  5.999999999999999e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3166  major facilitator superfamily MFS_1  32.11 
 
 		 462 aa  177  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.704444  normal  0.18034 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1472  major facilitator superfamily MFS_1  28.64 
 
 		 419 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.905727  normal  0.384031 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0574  major facilitator superfamily MFS_1  32.32 
 
 		 440 aa  171  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1700  major facilitator superfamily MFS_1  29.29 
 
 		 472 aa  167  5e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0146  major facilitator superfamily MFS_1  28.38 
 
 		 414 aa  162  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.243784  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2546  major facilitator transporter  30.11 
 
 		 449 aa  161  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.146508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0568  major facilitator superfamily MFS_1  28.76 
 
 		 468 aa  157  3e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685546 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18980  major facilitator superfamily permease  29.75 
 
 		 440 aa  157  3e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.273601  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2069  major facilitator transporter  30.87 
 
 		 460 aa  152  2e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.692197  normal  0.259713 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25210  major facilitator superfamily permease  30.55 
 
 		 449 aa  150  4e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.302409  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4097  major facilitator superfamily transporter  30.72 
 
 		 443 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1274  putative integral membrane protein  28.41 
 
 		 430 aa  146  6e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22460  major facilitator superfamily MFS_1  28.02 
 
 		 421 aa  143  7e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5316  major facilitator superfamily MFS_1  29.19 
 
 		 572 aa  143  8e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01490  major facilitator superfamily permease  27.11 
 
 		 408 aa  140  3.9999999999999997e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0591182  normal  0.340851 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0586  major facilitator superfamily MFS_1  28.7 
 
 		 444 aa  136  7.000000000000001e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0179532 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1854  major facilitator superfamily permease/ BtlA-like  27.84 
 
 		 440 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000121925  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0297  major facilitator superfamily MFS_1  30.07 
 
 		 441 aa  134  3e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.321668  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2758  major facilitator transporter  28.26 
 
 		 447 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3786  major facilitator superfamily MFS_1  27.49 
 
 		 412 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1090  putative permease  26.16 
 
 		 425 aa  125  1e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0778903  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3637  major facilitator transporter  30.26 
 
 		 454 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.35063  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3710  major facilitator superfamily transporter  30.26 
 
 		 454 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.417195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3642  major facilitator transporter  30.26 
 
 		 454 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.266137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0379  major facilitator transporter  24.89 
 
 		 427 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000550837  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2708  major facilitator superfamily MFS_1  27.69 
 
 		 450 aa  120  7e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0342766  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2277  major facilitator superfamily MFS_1  25.89 
 
 		 469 aa  120  7e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.419016  normal  0.219783 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1904  major facilitator superfamily MFS_1  25.16 
 
 		 430 aa  120  7e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2301  major facilitator superfamily permease  29.34 
 
 		 453 aa  119  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.334509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1893  major facilitator superfamily MFS_1  27.93 
 
 		 458 aa  119  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.117856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2014  major facilitator transporter  26.09 
 
 		 426 aa  118  3e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.273868  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0507  hypothetical protein  23.56 
 
 		 427 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.130258  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0373  major facilitator transporter  23.61 
 
 		 427 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000110963  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0458  hypothetical protein  23.78 
 
 		 427 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000401747  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21750  major facilitator superfamily permease  25 
 
 		 474 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.109771  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2515  major facilitator superfamily MFS_1  27.95 
 
 		 433 aa  115  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0507  hypothetical protein  23.16 
 
 		 427 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0379  hypothetical protein  23.16 
 
 		 427 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000021693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0370  major facilitator superfamily permease  23.16 
 
 		 427 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.902830000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0367  major facilitator superfamily permease  23.16 
 
 		 427 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000714912  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0393  hypothetical protein  23.16 
 
 		 427 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00341624  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0437  hypothetical protein  23.16 
 
 		 427 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2713  major facilitator superfamily MFS_1  24.83 
 
 		 424 aa  114  5e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3164  major facilitator superfamily permease  28.11 
 
 		 453 aa  114  5e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5507  major facilitator superfamily permease/BtlA- like protein  26.69 
 
 		 451 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.462661  normal  0.0808457 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4866  hypothetical protein  23.23 
 
 		 427 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12530  leucine and alanine rich integral membrane protein  26.85 
 
 		 445 aa  111  3e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0104482 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1758  putative transporter  26.41 
 
 		 460 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0030  permease  24.89 
 
 		 437 aa  110  5e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000345375  normal  0.344284 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0387  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 437 aa  108  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0133748  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1801  major facilitator superfamily protein  25.74 
 
 		 448 aa  107  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.640412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2748  major facilitator transporter  23.57 
 
 		 439 aa  105  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437943  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0657  major facilitator transporter  29.38 
 
 		 449 aa  103  6e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.651323  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0390  major facilitator superfamily permease  27.96 
 
 		 446 aa  103  6e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.778281  normal  0.55351 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3202  major facilitator superfamily MFS_1  22.59 
 
 		 444 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1217  major facilitator superfamily MFS_1  25.83 
 
 		 432 aa  101  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1838  major facilitator superfamily MFS_1  26.77 
 
 		 439 aa  102  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.047376  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>