44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0708 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0708  hypothetical protein  100 
 
 		 192 aa  384  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0094  hypothetical protein  86.08 
 
 		 199 aa  337  5e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156875  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0402  hypothetical protein  76.96 
 
 		 191 aa  295  3e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0924782  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0036  hypothetical protein  69.23 
 
 		 209 aa  281  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0242  hypothetical protein  78.98 
 
 		 186 aa  266  2e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3627  hypothetical protein  65.79 
 
 		 182 aa  257  7e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.2314  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2807  hypothetical protein  71.07 
 
 		 182 aa  245  2e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.909719 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1227  hypothetical protein  47.26 
 
 		 227 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0152651 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0405  hypothetical protein  42.25 
 
 		 178 aa  138  4.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.188703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3484  hypothetical protein  44.9 
 
 		 227 aa  138  4.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.509717 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4489  hypothetical protein  30.56 
 
 		 203 aa  108  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4557  hypothetical protein  30.37 
 
 		 206 aa  108  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38864  decreased coverage  0.00129383 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3345  hypothetical protein  37.5 
 
 		 175 aa  107  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3069  putative signal peptide protein  36.67 
 
 		 167 aa  105  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0091  hypothetical protein  36.55 
 
 		 167 aa  104  9e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0080  hypothetical protein  37.24 
 
 		 167 aa  103  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.44123  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0077  hypothetical protein  36.55 
 
 		 204 aa  102  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.792313  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4170  hypothetical protein  35.17 
 
 		 169 aa  101  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107472  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1381  hypothetical protein  31.9 
 
 		 190 aa  101  8e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3373  hypothetical protein  36.5 
 
 		 173 aa  100  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.299059  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4048  hypothetical protein  34.97 
 
 		 169 aa  99  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5420  putative signal peptide protein  38.03 
 
 		 162 aa  98.6  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0854015 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5961  hypothetical protein  32.21 
 
 		 164 aa  99  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.796791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4507  hypothetical protein  30.41 
 
 		 241 aa  97.8  8e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3725  hypothetical protein  34.48 
 
 		 169 aa  97.8  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1364  hypothetical protein  35.95 
 
 		 169 aa  94  1e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.743667  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3314  hypothetical protein  32.87 
 
 		 177 aa  87  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.467918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0267  hypothetical protein  30.16 
 
 		 175 aa  87.4  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.228403 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2504  hypothetical protein  32.21 
 
 		 175 aa  84.3  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.941504  normal  0.567566 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0042  hypothetical protein  30 
 
 		 176 aa  77.8  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1383  hypothetical protein  28.57 
 
 		 176 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0051  hypothetical protein  28.57 
 
 		 176 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3291  hypothetical protein  28.95 
 
 		 227 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.531023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1101  hypothetical protein  31.97 
 
 		 167 aa  77  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0768247  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3614  hypothetical protein  28.95 
 
 		 227 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.693924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3491  hypothetical protein  29.22 
 
 		 225 aa  75.9  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.135183 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1697  putative signal peptide protein  30.07 
 
 		 165 aa  75.9  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0268  hypothetical protein  28.77 
 
 		 168 aa  74.7  0.0000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.225729 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3015  hypothetical protein  26.72 
 
 		 182 aa  70.9  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.407663 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0027  hypothetical protein  26.47 
 
 		 178 aa  67.4  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0707  hypothetical protein  28.17 
 
 		 166 aa  58.2  0.00000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.19385  normal  0.736244 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2793  hypothetical protein  24.31 
 
 		 162 aa  54.3  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.577158 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0638  hypothetical protein  23.12 
 
 		 192 aa  47.8  0.00009  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1065  hypothetical protein  24 
 
 		 165 aa  46.6  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0282386  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>