More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0584 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0251  GTPase ObgE  96.02 
 
 		 353 aa  659    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0584  GTPase ObgE  100 
 
 		 353 aa  714    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0157  GTPase ObgE  94.89 
 
 		 353 aa  654    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0157  GTPase ObgE  88.67 
 
 		 349 aa  609  1e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.526376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0423  GTPase ObgE  87.68 
 
 		 356 aa  595  1e-169  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0517  GTPase ObgE  86.03 
 
 		 358 aa  592  1e-168  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0442  GTPase ObgE  84.36 
 
 		 358 aa  587  1e-166  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2055  GTP-binding protein Obg/CgtA  74.93 
 
 		 344 aa  489  1e-137  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346924  normal  0.815959 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0105  GTP-binding protein Obg/CgtA  76.07 
 
 		 342 aa  481  1e-135  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.578942 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4918  GTP-binding protein Obg/CgtA  71.43 
 
 		 344 aa  471  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.217297  normal  0.622557 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4410  GTP-binding protein Obg/CgtA  74.85 
 
 		 344 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4873  GTP-binding protein Obg/CgtA  74.85 
 
 		 344 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0700899 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3280  GTP-binding protein Obg/CgtA  75.46 
 
 		 346 aa  462  1e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0275403 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4726  GTP-binding protein Obg/CgtA  69.14 
 
 		 342 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0890343  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0415  GTP-binding protein Obg/CgtA  73.29 
 
 		 348 aa  458  9.999999999999999e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.345643 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4213  GTP-binding protein Obg/CgtA  72.7 
 
 		 343 aa  456  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.398083  normal  0.148496 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4198  GTPase ObgE  70.96 
 
 		 364 aa  436  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.501209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3874  GTPase ObgE  70.36 
 
 		 364 aa  432  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00849027 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1480  GTP-binding protein Obg/CgtA  69.04 
 
 		 348 aa  431  1e-120  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3458  GTPase ObgE  70.25 
 
 		 349 aa  429  1e-119  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1054  GTPase ObgE  68.69 
 
 		 341 aa  426  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.87865  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1845  GTPase ObgE  67.65 
 
 		 341 aa  424  1e-117  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1778  GTPase ObgE  67.65 
 
 		 371 aa  424  1e-117  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3187  GTPase ObgE  64.49 
 
 		 350 aa  420  1e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4056  GTPase ObgE  64.49 
 
 		 343 aa  421  1e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.747306 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0317  GTPase ObgE  65.03 
 
 		 339 aa  416  9.999999999999999e-116  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0233  GTPase ObgE  66.87 
 
 		 332 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4712  GTPase ObgE  62.25 
 
 		 354 aa  412  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.224685 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1240  GTPase ObgE  60.34 
 
 		 391 aa  414  1e-114  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.155825  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2789  small GTP-binding protein  66.77 
 
 		 351 aa  412  1e-114  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3802  GTPase ObgE  64.57 
 
 		 359 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.499409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1203  GTPase ObgE  62.86 
 
 		 348 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0486766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3009  GTPase ObgE  69 
 
 		 336 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3514  GTPase ObgE  64 
 
 		 342 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3822  GTPase ObgE  64 
 
 		 342 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4282  GTPase ObgE  70.73 
 
 		 366 aa  400  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.358429  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1466  GTPase ObgE  63.88 
 
 		 345 aa  399  9.999999999999999e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.913357  normal  0.0387806 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3895  GTPase ObgE  59.43 
 
 		 345 aa  395  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2283  GTPase ObgE  64.11 
 
 		 344 aa  377  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.79982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1705  GTPase ObgE  60.79 
 
 		 348 aa  376  1e-103  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.074389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1145  GTPase ObgE  57.83 
 
 		 352 aa  371  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  51.41 
 
 		 387 aa  326  5e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2007  GTP-binding protein Obg/CgtA  52.68 
 
 		 356 aa  315  9.999999999999999e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.339199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0543  GTPase ObgE  53.23 
 
 		 340 aa  310  2e-83  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0248  GTPase ObgE  52.89 
 
 		 392 aa  309  5e-83  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3208  GTPase ObgE  49.71 
 
 		 347 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0490  GTPase ObgE  50.95 
 
 		 340 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.831388  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4180  GTPase ObgE  54.76 
 
 		 354 aa  307  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4333  GTPase ObgE  54.76 
 
 		 354 aa  307  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4311  GTPase ObgE  54.46 
 
 		 354 aa  306  3e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1010  GTPase ObgE  53.14 
 
 		 402 aa  306  4.0000000000000004e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000125239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1010  GTPase ObgE  52.4 
 
 		 338 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4326  GTPase ObgE  52.07 
 
 		 353 aa  306  5.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.524865 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  54.05 
 
 		 417 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0799  GTP-binding protein, GTP1/Obg family  55.26 
 
 		 407 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0703  GTPase ObgE  51.34 
 
 		 407 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.718504 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  53.5 
 
 		 338 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312232  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  57.34 
 
 		 338 aa  302  7.000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0493  GTPase ObgE  52.92 
 
 		 340 aa  301  8.000000000000001e-81  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.750349  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.45 
 
 		 426 aa  301  2e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000264035  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3619  GTPase ObgE  51.78 
 
 		 392 aa  301  2e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000171752  normal  0.293815 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4858  GTPase ObgE  52.79 
 
 		 407 aa  300  3e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4495  GTPase ObgE  48.6 
 
 		 408 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.589803  normal  0.496901 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5260  GTPase ObgE  51.24 
 
 		 338 aa  298  8e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.281751 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3680  GTPase ObgE  50.58 
 
 		 406 aa  298  1e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.96249 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2956  GTPase ObgE  53.5 
 
 		 365 aa  298  1e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.49 
 
 		 434 aa  298  1e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3104  GTPase ObgE  53.03 
 
 		 365 aa  298  1e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0690  GTPase ObgE  51.09 
 
 		 408 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2248  GTPase ObgE  54.55 
 
 		 345 aa  297  2e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0000169157  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2820  GTPase ObgE  53.19 
 
 		 366 aa  297  2e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0271751  normal  0.376646 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3673  GTPase ObgE  53.64 
 
 		 357 aa  297  2e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.291643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0722  GTPase ObgE  51.09 
 
 		 408 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320956 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0959  GTPase ObgE  51.71 
 
 		 343 aa  297  2e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2217  GTPase ObgE  50.6 
 
 		 353 aa  297  2e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000677684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0306  GTPase ObgE  51.34 
 
 		 338 aa  297  2e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00590808  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2537  GTPase ObgE  52.25 
 
 		 428 aa  296  3e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53833  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0912  GTPase ObgE  52.25 
 
 		 432 aa  296  4e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0722  GTPase ObgE  50.78 
 
 		 408 aa  296  5e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.91341 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2655  GTPase ObgE  52.08 
 
 		 364 aa  295  6e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.031606  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40770  GTPase ObgE  55.3 
 
 		 405 aa  295  6e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3952  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.72 
 
 		 350 aa  295  6e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3065  GTPase ObgE  52.08 
 
 		 364 aa  295  8e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.72259  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0524  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.63 
 
 		 390 aa  294  2e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000179136  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4390  GTPase ObgE  49.54 
 
 		 329 aa  293  2e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4216  GTPase ObgE  52.42 
 
 		 362 aa  294  2e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.862872  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4453  GTPase ObgE  49.54 
 
 		 329 aa  293  2e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.584179 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0513  hypothetical protein  51.67 
 
 		 370 aa  293  3e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.609745  normal  0.0660512 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4505  GTPase ObgE  51.63 
 
 		 390 aa  293  3e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000250571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60445  GTPase ObgE  56 
 
 		 406 aa  293  3e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233536 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3660  GTPase ObgE  51.18 
 
 		 390 aa  293  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0449011  normal  0.0890894 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3493  GTPase ObgE  51.18 
 
 		 390 aa  293  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5206  GTPase ObgE  56.33 
 
 		 406 aa  293  4e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.683682  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3598  GTPase ObgE  51.18 
 
 		 390 aa  293  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3562  GTPase ObgE  51.18 
 
 		 390 aa  293  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.238363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3491  GTPase ObgE  51.18 
 
 		 390 aa  293  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000240056  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0843  GTPase ObgE  52.12 
 
 		 379 aa  293  4e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.946123  normal  0.830278 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2581  GTPase ObgE  49.02 
 
 		 356 aa  292  6e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.96662e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2954  GTPase ObgE  52.58 
 
 		 338 aa  292  7e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3275  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.06 
 
 		 369 aa  290  2e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000381573 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>