263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0532 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0532  lipolytic enzyme, G-D-S-L  100 
 
 		 211 aa  417  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.245304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0284  lipolytic protein  91.5 
 
 		 202 aa  360  7.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0286898 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0190  lipolytic protein G-D-S-L family  79.21 
 
 		 204 aa  320  8e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00452588  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0197  lipolytic enzyme, G-D-S-L  74.49 
 
 		 204 aa  303  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0389  multifunctional acyl-CoA thioesterase I  67.46 
 
 		 210 aa  271  5.000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157176  normal  0.482234 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0416  lysophospholipase L1 and related esterase  70.53 
 
 		 251 aa  269  2e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.36171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0548  lipolytic enzyme, G-D-S-L  69.95 
 
 		 227 aa  249  2e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.386484  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1776  lipolytic protein G-D-S-L family  58.91 
 
 		 240 aa  237  9e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4475  lipolytic protein G-D-S-L family  61.86 
 
 		 218 aa  234  7e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4363  lipolytic protein G-D-S-L family  60.21 
 
 		 216 aa  231  6e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3994  GDSL family lipase  60.21 
 
 		 216 aa  231  8.000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0481069  normal  0.616956 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5471  GDSL family lipase  60.61 
 
 		 257 aa  228  7e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.750957  normal  0.0594421 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3073  GDSL family lipase  57.37 
 
 		 213 aa  223  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0097  GDSL family lipase  53.08 
 
 		 239 aa  221  4.9999999999999996e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.221693  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1759  GDSL family lipase  55.72 
 
 		 213 aa  218  6e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.740812  normal  0.107758 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3731  lipolytic protein G-D-S-L family  53.59 
 
 		 214 aa  216  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0083  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  56.59 
 
 		 241 aa  214  7e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4054  lipolytic protein G-D-S-L family  53.11 
 
 		 214 aa  214  9e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0085  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  56.04 
 
 		 241 aa  213  9.999999999999999e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.68478  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1392  GDSL family lipase  53.55 
 
 		 226 aa  213  1.9999999999999998e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1014  GDSL family lipase  54.27 
 
 		 255 aa  211  5.999999999999999e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.271835  normal  0.127972 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3650  lipolytic protein  56.54 
 
 		 201 aa  207  7e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3350  lipolytic enzyme, G-D-S-L  56.22 
 
 		 226 aa  206  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0831  GDSL family lipase  55.56 
 
 		 248 aa  204  7e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.386587  normal  0.0593626 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1921  lipolytic protein G-D-S-L family  55.14 
 
 		 198 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4178  esterase  51.65 
 
 		 255 aa  190  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0335834  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0413  putative acyl-CoA thioesterase precursor  50.75 
 
 		 240 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3955  hypothetical protein  47.83 
 
 		 211 aa  180  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0133158 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2677  lipolytic protein  49.21 
 
 		 233 aa  178  4e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0490394  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2415  lipase/acylhydrolase, putative  48.07 
 
 		 219 aa  174  8e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.30697  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2220  lipolytic protein G-D-S-L family  49.19 
 
 		 214 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3286  GDSL family lipase  45.89 
 
 		 208 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3601  GDSL family lipase  45.89 
 
 		 208 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.105176  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0540  lipolytic protein G-D-S-L family  45.69 
 
 		 252 aa  171  6.999999999999999e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621057  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3685  lipolytic enzyme, G-D-S-L  47.85 
 
 		 228 aa  169  3e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2111  lipolytic protein G-D-S-L family  43.85 
 
 		 223 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3805  GDSL family lipase  50.27 
 
 		 209 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0188199 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1931  lipolytic protein G-D-S-L family  46.63 
 
 		 210 aa  161  8.000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.403169 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1673  lipolytic protein G-D-S-L family  43.33 
 
 		 216 aa  159  4e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0516704  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1278  GDSL family lipase  46.93 
 
 		 223 aa  158  5e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.398687  normal  0.0389661 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2107  lipolytic protein G-D-S-L family  44.39 
 
 		 223 aa  157  8e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0087  GDSL family lipase  43.01 
 
 		 266 aa  151  5e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0074  GDSL family lipase  42.54 
 
 		 234 aa  150  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0776828 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2113  lipolytic protein  42 
 
 		 270 aa  147  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5710  lipolytic protein G-D-S-L family  42.54 
 
 		 249 aa  144  9e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2116  Arylesterase  42.86 
 
 		 212 aa  144  9e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.234069  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2434  lipolytic enzyme, G-D-S-L  42.47 
 
 		 270 aa  144  1e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2269  lipolytic enzyme, G-D-S-L  38.35 
 
 		 225 aa  142  4e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00077116  normal  0.478679 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1973  arylesterase  43.33 
 
 		 208 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1912  Arylesterase  40.57 
 
 		 224 aa  139  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2068  arylesterase  40.45 
 
 		 205 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.05326  normal  0.272976 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1942  GDSL family lipase  41.84 
 
 		 222 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1919  GDSL family lipase  41.84 
 
 		 222 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2289  arylesterase  41.36 
 
 		 208 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.85039  normal  0.194441 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6500  lipolytic protein G-D-S-L family  38.81 
 
 		 237 aa  137  8.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1599  lipolytic protein G-D-S-L family  38.55 
 
 		 222 aa  137  8.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0429  arylesterase  40.1 
 
 		 202 aa  137  1e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2268  acyl-CoA thioesterase I  41.01 
 
 		 201 aa  136  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00244622  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2130  acyl-CoA thioesterase I  43.48 
 
 		 232 aa  136  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0925332  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1355  GDSL family lipase  43.48 
 
 		 184 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.260429  normal  0.647908 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1530  Lysophospholipase  41.45 
 
 		 202 aa  135  4e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.177051 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1717  esterase signal peptide protein  42.31 
 
 		 216 aa  135  5e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1907  arylesterase  41.85 
 
 		 225 aa  135  5e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0973047  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2141  GDSL family lipase  43.72 
 
 		 192 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.336589  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1837  lysophospholipase  41.3 
 
 		 201 aa  134  8e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.761054  normal  0.074561 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5220  lipolytic protein  41.85 
 
 		 224 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.698487  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1152  lipolytic enzyme, G-D-S-L  44.71 
 
 		 227 aa  134  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.398188  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1384  arylesterase  43.41 
 
 		 201 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.015235  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6160  lipolytic enzyme, G-D-S-L  41.85 
 
 		 184 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2242  Arylesterase  43.32 
 
 		 200 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0186506  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1017  lysophospholipase  40.1 
 
 		 214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1660  arylesterase  39.89 
 
 		 209 aa  132  3e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2298  acyl-CoA thioesterase I  41.94 
 
 		 201 aa  132  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.014502  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1044  arylesterase  39.23 
 
 		 213 aa  132  3e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2311  acyl-CoA thioesterase I  42.93 
 
 		 226 aa  132  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.328666  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2468  acyl-CoA thioesterase I  42.93 
 
 		 232 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1219  acyl-CoA thioesterase, putative  42.93 
 
 		 226 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27160  acyl-CoA thioesterase I precursor  41.94 
 
 		 201 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.112792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3360  acyl-CoA thioesterase I  42.93 
 
 		 226 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.323811  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1451  acyl-CoA thioesterase I  42.93 
 
 		 210 aa  132  5e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0796987  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2558  lysophospholipase  40.45 
 
 		 201 aa  132  5e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000043201  hitchhiker  0.000000000000180449 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2349  acyl-CoA thioesterase I  42.93 
 
 		 226 aa  132  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0342974  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1944  acyl-CoA thioesterase, putative  42.93 
 
 		 210 aa  132  5e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0267  lipolytic protein G-D-S-L family  39.71 
 
 		 215 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.151639 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4014  lipolytic protein  38.81 
 
 		 201 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000555437  normal  0.540801 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2898  arylesterase  38.22 
 
 		 190 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0179811  hitchhiker  0.000609296 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1696  arylesterase  37.44 
 
 		 198 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.122865  normal  0.277119 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1863  Lysophospholipase  40.88 
 
 		 205 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000017765 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2318  GDSL family lipase  40.11 
 
 		 201 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0286486  hitchhiker  0.0000364152 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0724  arylesterase  41.21 
 
 		 215 aa  129  3e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000311622  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1250  arylesterase  38.55 
 
 		 208 aa  129  3e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0285  arylesterase precursor  38.86 
 
 		 206 aa  128  6e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.751719  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0700  lipolytic enzyme, G-D-S-L  44.51 
 
 		 237 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.948885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3451  arylesterase  39.89 
 
 		 201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0041909  hitchhiker  0.0000215675 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1068  Arylesterase  33.8 
 
 		 255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1920  arylesterase  39.57 
 
 		 199 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320229  hitchhiker  0.00000000000011785 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2747  lysophospholipase L1-like protein  36.61 
 
 		 195 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0938  arylesterase  41.04 
 
 		 219 aa  125  4.0000000000000003e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.279693  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23070  Arylesterase protein  41.34 
 
 		 198 aa  125  4.0000000000000003e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.803817  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1815  acyl-CoA thioesterase I precursor  40.49 
 
 		 216 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>