More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0531 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0531  ABC transporter related  100 
 
 		 246 aa  488  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.328993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0285  ABC transporter related  96.34 
 
 		 246 aa  457  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.664514  normal  0.0597012 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0191  ABC transporter related  88.26 
 
 		 247 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00111007  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0198  ABC transporter related  84.06 
 
 		 251 aa  408  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0415  ABC transporter, ATPase subunit  85.17 
 
 		 240 aa  395  1e-109  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.35006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0388  putative ABC transporter, ATP-binding protein  88.34 
 
 		 235 aa  392  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.771085  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5470  ABC transporter related  76.5 
 
 		 231 aa  328  4e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0589089  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1777  ABC transporter related  76.5 
 
 		 231 aa  328  7e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1758  ABC transporter related  71.67 
 
 		 241 aa  325  3e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.101671 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4474  ABC transporter related  74.65 
 
 		 227 aa  325  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1015  ABC transporter related  75.11 
 
 		 228 aa  322  3e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.5301  normal  0.120325 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3993  ABC transporter related  72.44 
 
 		 260 aa  320  9.000000000000001e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.222107  normal  0.622959 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4362  ABC transporter related  72.44 
 
 		 230 aa  320  9.999999999999999e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0549  ABC transporter related  91.76 
 
 		 174 aa  313  1.9999999999999998e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.855134  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1920  ABC transporter related  70 
 
 		 235 aa  312  2.9999999999999996e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3732  ABC transporter related  68.66 
 
 		 235 aa  305  5.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.624286  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4055  ABC transporter related  68.2 
 
 		 235 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3074  ABC transporter related  68.98 
 
 		 239 aa  303  2.0000000000000002e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0830  ABC transporter related  73.39 
 
 		 237 aa  303  2.0000000000000002e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.229113  normal  0.204664 
 
 
-
 
NC_004310  BR0086  ABC transporter, ATP-binding protein  67.59 
 
 		 242 aa  295  6e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.475163  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0084  ABC transporter, ATP-binding protein  67.59 
 
 		 242 aa  295  6e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3351  ABC transporter related  65.62 
 
 		 230 aa  291  5e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0098  ABC transporter related  66.36 
 
 		 242 aa  291  5e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1393  ABC transporter related  64.6 
 
 		 230 aa  290  1e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4180  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  73.85 
 
 		 211 aa  288  8e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.603113  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1151  ABC transporter related  63.89 
 
 		 230 aa  271  7e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3651  ABC transporter component  61.33 
 
 		 237 aa  266  2e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1672  ABC transporter related  60.93 
 
 		 217 aa  266  2e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0501975  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0699  ABC transporter related  59.91 
 
 		 233 aa  264  1e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.664628  normal  0.709936 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2270  ABC transporter related  61.01 
 
 		 234 aa  255  4e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00112546  normal  0.490957 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2678  ABC transporter  66.06 
 
 		 234 aa  252  4.0000000000000004e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00869869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0125  ABC transporter related  62.96 
 
 		 228 aa  251  6e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.207988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1251  ABC transporter related  55.8 
 
 		 228 aa  249  3e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.799033  normal  0.890973 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0412  ATPase  55.66 
 
 		 249 aa  248  9e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2221  ABC transporter related  55.75 
 
 		 252 aa  246  3e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3287  ABC transporter related  64.35 
 
 		 229 aa  243  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1930  ABC transporter related  58.82 
 
 		 258 aa  243  1.9999999999999999e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304098  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3686  ABC transporter related  65.15 
 
 		 202 aa  242  3e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3602  ABC efflux transporter, ATPase subunit  63.89 
 
 		 229 aa  240  1e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.258305  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27150  ABC transporter ATP-binding protein  56.31 
 
 		 227 aa  239  4e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.358472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2297  ABC transporter ATP-binding protein  55.86 
 
 		 227 aa  238  5e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101815  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2241  ABC transporter related  57.62 
 
 		 234 aa  238  5e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0103221  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3956  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  62.04 
 
 		 229 aa  233  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0266851 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1400  ABC transporter, ATP-binding protein  56.81 
 
 		 219 aa  230  2e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2713  ABC transporter related  54.17 
 
 		 224 aa  228  5e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.889678  hitchhiker  0.0038315 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4034  ABC transporter related  51.77 
 
 		 236 aa  227  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.530357  normal  0.188181 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0541  ABC transporter related protein  53.57 
 
 		 233 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5709  ABC transporter related  53.66 
 
 		 224 aa  224  7e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0073  ABC transporter related  50.67 
 
 		 237 aa  223  2e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0776828 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0009  ABC transporter related protein  60.71 
 
 		 233 aa  222  4e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2567  ABC transporter related  47.86 
 
 		 249 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2270  ABC transporter related  53.24 
 
 		 250 aa  222  4.9999999999999996e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.42707  normal  0.355714 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1759  ABC transporter related  53.42 
 
 		 227 aa  221  6e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0432501  hitchhiker  0.0000000000939298 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1816  ABC transporter, ATP-binding protein  52.51 
 
 		 224 aa  221  8e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.932395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1604  ABC transporter related  53.24 
 
 		 242 aa  221  9e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3452  ABC transporter related  53.88 
 
 		 228 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0356163  hitchhiker  0.0000197884 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0428  ABC transporter, ATPase subunit  58.59 
 
 		 239 aa  219  1.9999999999999999e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1972  ABC transporter related  53.14 
 
 		 228 aa  219  1.9999999999999999e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3445  ABC transporter, ATP-binding protein  49.78 
 
 		 226 aa  219  1.9999999999999999e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.937681  hitchhiker  0.0000228782 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2317  ABC transporter ATP-binding protein  53.42 
 
 		 228 aa  219  3e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0467206  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1919  ABC transporter related  52.25 
 
 		 227 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000203037  hitchhiker  0.000000000000141091 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1123  ABC transporter related  50.22 
 
 		 243 aa  218  7.999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0137163  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2619  ABC transporter related  52.53 
 
 		 239 aa  218  7.999999999999999e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.512871  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0550  ABC transporter related  51.58 
 
 		 224 aa  217  1e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0929666  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2367  ABC transporter related  50 
 
 		 249 aa  218  1e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2408  ABC transporter related  54.23 
 
 		 219 aa  217  1e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000980681 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1486  ABC transporter, ATP-binding protein  48.4 
 
 		 249 aa  217  1e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2208  ABC transporter related  48.61 
 
 		 227 aa  218  1e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.556988 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2402  ABC transporter-related protein  47.73 
 
 		 246 aa  216  2e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2897  ABC transporter related  46.12 
 
 		 246 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0555647  hitchhiker  0.000651722 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0685  ABC transporter, ATPase protein  57.87 
 
 		 235 aa  216  4e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.360664 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00446  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  51.36 
 
 		 228 aa  215  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3115  ABC transporter related protein  51.36 
 
 		 228 aa  215  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0534  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  51.36 
 
 		 228 aa  215  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0573  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  51.36 
 
 		 228 aa  215  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23060  ABC transporter ATP-binding protein  54.38 
 
 		 226 aa  215  5.9999999999999996e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0599  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  51.36 
 
 		 228 aa  215  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.962067 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6499  ABC transporter related protein  51.61 
 
 		 230 aa  215  5.9999999999999996e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00451  hypothetical protein  51.36 
 
 		 228 aa  215  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0430  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  51.36 
 
 		 228 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.811195  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3121  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  51.36 
 
 		 228 aa  215  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000114112 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0544  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  51.36 
 
 		 228 aa  214  7e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2927  ABC transporter, ATP-binding protein  47.39 
 
 		 253 aa  214  9e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3192  ABC transporter related protein  49.78 
 
 		 243 aa  214  9.999999999999999e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.110755  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2708  ABC transporter related  49.07 
 
 		 246 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4015  ABC transporter-like  54.21 
 
 		 227 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000527031  normal  0.545183 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2425  ABC transporter related  51.6 
 
 		 228 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2687  ABC transporter related  49.07 
 
 		 242 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2784  ABC transporter related  49.07 
 
 		 242 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.652474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0553  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  51.82 
 
 		 228 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0555  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  51.82 
 
 		 228 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1479  ABC transporter related  49.07 
 
 		 249 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1544  ABC transporter related  49.07 
 
 		 249 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0894147 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1679  ABC transporter related  49.07 
 
 		 242 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0801167 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1538  ABC transporter related  49.07 
 
 		 249 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136068 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0570  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  51.82 
 
 		 228 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.661781 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0560  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  51.82 
 
 		 228 aa  212  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2309  ABC transporter ATP-binding protein  47.79 
 
 		 237 aa  212  3.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0709631  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0614  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  51.82 
 
 		 228 aa  212  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3413  ABC transporter related  48.72 
 
 		 237 aa  211  7e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.363302  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>