More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0487 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0487  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 259 aa  533  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.254321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0333  twin-arginine translocation pathway signal  91.09 
 
 		 259 aa  494  1e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0223  oxidoreductase molybdopterin binding  86.05 
 
 		 259 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.613741  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0242  twin-arginine translocation pathway signal  80.31 
 
 		 259 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.297118  normal  0.0333661 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3598  oxidoreductase, molybdopterin binding  78.46 
 
 		 261 aa  437  9.999999999999999e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0338  putative oxidoreductase molybdopterin binding  78.99 
 
 		 260 aa  424  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.0092485  normal  0.0273242 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2177  putative oxidoreductase, molybdopterin binding  60.4 
 
 		 258 aa  323  2e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.60597 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6764  oxidoreductase molybdopterin binding  58.57 
 
 		 257 aa  322  4e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6422  oxidoreductase molybdopterin binding  59.26 
 
 		 263 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.603539  normal  0.600006 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1201  oxidoreductase molybdopterin binding protein  58.7 
 
 		 259 aa  320  1.9999999999999998e-86  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1510  oxidoreductase molybdopterin binding  57.49 
 
 		 262 aa  318  3.9999999999999996e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.832441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2666  oxidoreductase molybdopterin binding  58.06 
 
 		 263 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0620  hypothetical protein  60.08 
 
 		 257 aa  310  1e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3134  oxidoreductase molybdopterin binding  58.43 
 
 		 263 aa  306  3e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0541  oxidoreductase, molybdopterin binding  56.08 
 
 		 263 aa  304  1.0000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding  56.08 
 
 		 263 aa  303  2.0000000000000002e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2990  oxidoreductase molybdopterin binding  57.41 
 
 		 263 aa  302  4.0000000000000003e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1533  oxidoreductase, molybdopterin-binding  56.97 
 
 		 263 aa  300  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2840  oxidoreductase, molybdopterin-binding  56.57 
 
 		 263 aa  300  1e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1405  oxidoreductase, molybdopterin-binding  56.97 
 
 		 263 aa  300  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1518  oxidoreductase, molybdopterin binding  60.33 
 
 		 263 aa  298  4e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0486  oxidoreductase, molybdopterin-binding  56.57 
 
 		 263 aa  298  4e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1201  oxidoreductase, molybdopterin-binding  56.57 
 
 		 263 aa  298  4e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.463291  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0666  oxidoreductase, molybdopterin-binding  56.57 
 
 		 263 aa  298  4e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.540729  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1400  oxidoreductase, molybdopterin-binding  56.57 
 
 		 263 aa  298  6e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1198  oxidoreductase molybdopterin binding  57.26 
 
 		 262 aa  298  7e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0452128  normal  0.688101 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3085  oxidoreductase, molybdopterin-binding  56.57 
 
 		 263 aa  298  8e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1752  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  59.83 
 
 		 258 aa  297  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175218  normal  0.213675 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1108  oxidoreductase molybdopterin binding  56.45 
 
 		 262 aa  296  2e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5020  oxidoreductase molybdopterin binding  57.77 
 
 		 258 aa  296  3e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.159564 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1108  oxidoreductase, molybdopterin binding  56.45 
 
 		 262 aa  295  5e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906624  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4930  oxidoreductase molybdopterin binding  58.95 
 
 		 258 aa  292  4e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.73484  normal  0.226199 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0744  oxidoreductase, molybdopterin binding  55.65 
 
 		 262 aa  291  5e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1225  oxidoreductase, molybdopterin binding  55.65 
 
 		 262 aa  291  5e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4334  oxidoreductase, molybdopterin binding  55.24 
 
 		 262 aa  290  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.868418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2592  oxidoreductase, molybdopterin binding  59.52 
 
 		 262 aa  288  7e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.938521  normal  0.743537 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0309  oxidoreductase molybdopterin binding  58.09 
 
 		 263 aa  288  7e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.261244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0297  oxidoreductase molybdopterin binding  58.09 
 
 		 263 aa  287  1e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1697  oxidoreductase molybdopterin binding  56.96 
 
 		 249 aa  275  6e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2751  oxidoreductase molybdopterin binding  55.14 
 
 		 249 aa  273  2.0000000000000002e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0587289 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3371  oxidoreductase, molybdopterin binding  51.01 
 
 		 256 aa  271  7e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0860075  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3725  oxidoreductase molybdopterin binding  52.67 
 
 		 255 aa  268  8e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0961  oxidoreductase molybdopterin binding  52.03 
 
 		 263 aa  266  2e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3286  oxidoreductase molybdopterin binding  52.84 
 
 		 241 aa  262  4.999999999999999e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18954  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1495  oxidoreductase molybdopterin binding  51.69 
 
 		 255 aa  258  6e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64540  hypothetical protein  55.35 
 
 		 255 aa  258  1e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5604  hypothetical protein  55.35 
 
 		 255 aa  256  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3600  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  55.14 
 
 		 215 aa  255  6e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4897  oxidoreductase molybdopterin binding  53.71 
 
 		 241 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00490947  decreased coverage  0.000741335 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2994  oxidoreductase, molybdopterin binding  50.21 
 
 		 239 aa  238  5.999999999999999e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2568  oxidoreductase molybdopterin binding  37.7 
 
 		 258 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0385834  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0018  oxidoreductase, molybdopterin-binding  36.05 
 
 		 262 aa  158  1e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3628  oxidoreductase molybdopterin binding  40.52 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0640094 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0015  oxidoreductase, molybdopterin-binding  35.66 
 
 		 262 aa  156  4e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.642429  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4816  oxidoreductase molybdopterin binding  34.92 
 
 		 258 aa  155  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.553663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1560  oxidoreductase molybdopterin binding  37.23 
 
 		 234 aa  153  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1638  oxidoreductase molybdopterin binding  37.66 
 
 		 234 aa  152  5e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.934019  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2311  molybdopterin-binding oxidoreductase  37.66 
 
 		 234 aa  151  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0958  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.86 
 
 		 240 aa  150  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2349  hypothetical protein  35.86 
 
 		 256 aa  145  5e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.672728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1625  oxidoreductase molybdopterin binding  38.66 
 
 		 256 aa  143  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.464814  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0491  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.53 
 
 		 256 aa  140  3e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.727181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0563  oxidoreductase, molybdopterin binding  37.19 
 
 		 251 aa  139  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1812  oxidoreductase, molybdopterin binding  36.4 
 
 		 249 aa  139  6e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.218509  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0864  oxidoreductase molybdopterin binding  34.92 
 
 		 259 aa  137  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4106  oxidoreductase molybdopterin binding  31.37 
 
 		 262 aa  135  8e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3845  oxidoreductase molybdopterin binding  34.05 
 
 		 247 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.624438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4154  oxidoreductase molybdopterin binding  34.06 
 
 		 247 aa  133  3e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3309  oxidoreductase molybdopterin binding  32.13 
 
 		 315 aa  132  6e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.62654 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3632  oxidoreductase molybdopterin binding  32.13 
 
 		 315 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.363586 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4302  oxidoreductase molybdopterin binding  32.89 
 
 		 247 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4164  oxidoreductase molybdopterin binding  36.88 
 
 		 234 aa  123  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.430302 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4346  oxidoreductase, molybdopterin binding  36.73 
 
 		 233 aa  122  5e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.315393  normal  0.221875 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1008  oxidoreductase molybdopterin binding  29.97 
 
 		 319 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.700197  normal  0.289957 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.33 
 
 		 501 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3509  oxidoreductase molybdopterin binding  38.69 
 
 		 318 aa  101  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3943  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.72 
 
 		 253 aa  100  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  30.77 
 
 		 495 aa  98.2  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0908687  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0382  oxidoreductase molybdopterin binding  29.9 
 
 		 228 aa  96.7  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.761682 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0290  oxidoreductase molybdopterin binding  35.58 
 
 		 374 aa  96.3  5e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0650  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.21 
 
 		 237 aa  91.3  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0972302  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0316  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.09 
 
 		 517 aa  91.3  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0362  oxidoreductase, molybdopterin binding  28.48 
 
 		 200 aa  90.9  2e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.659486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0663  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.99 
 
 		 229 aa  90.5  3e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000387868  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4244  oxidoreductase molybdopterin binding protein  25.88 
 
 		 266 aa  89.7  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.978688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5386  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.97 
 
 		 243 aa  88.2  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.406653  normal  0.237779 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0349  putative sulfite oxidase subunit YedY  28.74 
 
 		 331 aa  88.2  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0106094 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2724  putative sulfite oxidase subunit YedY  32.12 
 
 		 331 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0383  putative sulfite oxidase subunit YedY  32.12 
 
 		 331 aa  87.8  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0362  putative sulfite oxidase subunit YedY  32.12 
 
 		 331 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.24616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3571  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.79 
 
 		 232 aa  87.4  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0284  putative sulfite oxidase subunit YedY  31.61 
 
 		 331 aa  87.4  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.212861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0667  putative sulfite oxidase subunit YedY  32.28 
 
 		 332 aa  87.4  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00975982 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0938  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.46 
 
 		 199 aa  87  3e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.378305  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2804  putative sulfite oxidase subunit YedY  28.74 
 
 		 331 aa  87  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.321388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3482  putative sulfite oxidase subunit YedY  32.12 
 
 		 331 aa  86.7  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2409  oxidoreductase molybdopterin binding  30.72 
 
 		 230 aa  86.7  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00600031  normal  0.457141 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1785  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.13 
 
 		 200 aa  86.3  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3033  putative sulfite oxidase subunit YedY  30.48 
 
 		 331 aa  86.3  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3608  putative sulfite oxidase subunit YedY  31.09 
 
 		 331 aa  85.9  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0264425  hitchhiker  0.0000000362399 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>