More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0401 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0401  glutathione synthetase  100 
 
 		 313 aa  636    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0419  glutathione synthetase  95.21 
 
 		 313 aa  608  1e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0324  glutathione synthetase  92.33 
 
 		 313 aa  592  1e-168  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.581413  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0319  glutathione synthetase  86.26 
 
 		 313 aa  561  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0145  glutathione synthetase  84.35 
 
 		 313 aa  551  1e-156  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0180  glutathione synthetase  84.62 
 
 		 313 aa  546  1e-154  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0117  glutathione synthetase  84.35 
 
 		 317 aa  538  9.999999999999999e-153  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.376363  normal  0.217444 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0872  glutathione synthetase  71.06 
 
 		 318 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0342772  hitchhiker  0.000771754 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0338  glutathione synthetase  70.93 
 
 		 315 aa  466  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.541659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0722  glutathione synthetase  72.35 
 
 		 318 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3126  glutathione synthetase  69.65 
 
 		 314 aa  457  1e-127  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1113  glutathione synthetase  70.61 
 
 		 317 aa  457  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.68632  normal  0.482887 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0939  glutathione synthetase  68.28 
 
 		 320 aa  447  1e-125  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0625904  normal  0.13486 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0901  glutathione synthetase  68.28 
 
 		 320 aa  449  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.382175 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0876  glutathione synthetase  67.09 
 
 		 320 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2798  glutathione synthetase  67.41 
 
 		 340 aa  435  1e-121  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3546  glutathione synthetase  62.7 
 
 		 315 aa  408  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0361  glutathione synthetase  63.55 
 
 		 315 aa  408  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.871301  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4600  glutathione synthetase  63.87 
 
 		 315 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0572283 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4337  glutathione synthetase  63.23 
 
 		 315 aa  403  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.326757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3585  glutathione synthetase  58.15 
 
 		 316 aa  394  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.676094  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0783  glutathione synthetase  59.62 
 
 		 312 aa  389  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2131  glutathione synthetase  59.29 
 
 		 312 aa  386  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.144728  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2047  glutathione synthetase  59.29 
 
 		 312 aa  386  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00139246  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1229  glutathione synthetase  57.56 
 
 		 312 aa  384  1e-105  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3690  glutathione synthetase  57.56 
 
 		 318 aa  358  7e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0298114  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1815  glutathione synthetase  55.45 
 
 		 316 aa  356  1.9999999999999998e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150956  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3589  glutathione synthetase  55.77 
 
 		 312 aa  357  1.9999999999999998e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0462  glutathione synthetase  55.13 
 
 		 314 aa  356  2.9999999999999997e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2025  glutathione synthetase  55.31 
 
 		 317 aa  356  2.9999999999999997e-97  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0573  glutathione synthetase  56.55 
 
 		 315 aa  356  2.9999999999999997e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.230424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2081  glutathione synthetase  54.78 
 
 		 315 aa  355  6.999999999999999e-97  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.144639  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0901  glutathione synthetase  54.37 
 
 		 314 aa  353  2.9999999999999997e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0178  glutathione synthetase  56.37 
 
 		 317 aa  352  4e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.232344 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3960  glutathione synthetase  54.98 
 
 		 316 aa  352  5e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0473  glutathione synthetase  54.17 
 
 		 314 aa  345  5e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.031905 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0261  glutathione synthetase  53.75 
 
 		 317 aa  343  2e-93  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.377294 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0450  glutathione synthetase  53.4 
 
 		 311 aa  342  5.999999999999999e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.319329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2829  glutathione synthetase  51.26 
 
 		 315 aa  325  6e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.520333  normal  0.703083 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0322  glutathione synthetase  51.24 
 
 		 334 aa  310  2e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.720886  normal  0.322708 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3016  glutathione synthetase  48.08 
 
 		 316 aa  304  2.0000000000000002e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2670  glutathione synthetase  47.12 
 
 		 312 aa  276  2e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3063  glutathione synthetase  47.12 
 
 		 312 aa  276  2e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2905  glutathione synthetase  48.34 
 
 		 310 aa  261  8e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2401  glutathione synthetase  45.48 
 
 		 313 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1287  glutathione synthetase  42.17 
 
 		 318 aa  253  4.0000000000000004e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01601  glutathione synthetase  43.73 
 
 		 316 aa  247  2e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.622323  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4828  glutathione synthetase  43.93 
 
 		 322 aa  246  3e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03573  glutathione synthetase  40.19 
 
 		 316 aa  246  4e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4135  glutathione synthetase  40.51 
 
 		 316 aa  245  4.9999999999999997e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0908035 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4026  glutathione synthetase  42.44 
 
 		 316 aa  246  4.9999999999999997e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0220005  hitchhiker  0.00142352 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3342  glutathione synthetase  41.99 
 
 		 319 aa  245  6.999999999999999e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3973  glutathione synthetase  40.51 
 
 		 316 aa  245  8e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0838  glutathione synthetase  41.99 
 
 		 319 aa  244  9e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.014661  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3162  glutathione synthetase  40.51 
 
 		 317 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00627108  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002462  glutathione synthetase  40.19 
 
 		 316 aa  243  1.9999999999999999e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0410  glutathione synthetase  41.56 
 
 		 318 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.197255  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0548  glutathione synthetase  40.51 
 
 		 328 aa  242  6e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0542  glutathione synthetase  40.26 
 
 		 317 aa  242  6e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0836  glutathione synthetase  41.67 
 
 		 319 aa  242  7e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3214  glutathione synthetase  41.23 
 
 		 318 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2831  glutathione synthetase  41.23 
 
 		 318 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.718105  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0655  glutathione synthetase  41.23 
 
 		 318 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1404  glutathione synthetase  41.23 
 
 		 318 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0490  glutathione synthetase  41.23 
 
 		 318 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1825  glutathione synthetase  41.19 
 
 		 321 aa  241  1e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0471  glutathione synthetase  41.23 
 
 		 318 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.379108  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0188  glutathione synthetase  41.23 
 
 		 318 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.582135  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0020  glutathione synthetase  40.19 
 
 		 318 aa  241  1e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0831  glutathione synthetase  40.19 
 
 		 315 aa  241  2e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4323  glutathione synthetase  39.94 
 
 		 315 aa  240  2e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0833  glutathione synthetase  39.87 
 
 		 317 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000643207  hitchhiker  0.000000523615 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0808  glutathione synthetase  39.87 
 
 		 317 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000233048  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3333  glutathione synthetase  39.87 
 
 		 315 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0352151  normal  0.850506 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0840  glutathione synthetase  40.19 
 
 		 317 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00539981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0599  glutathione synthetase  39.23 
 
 		 317 aa  239  4e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.625296  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3090  glutathione synthetase  42.44 
 
 		 315 aa  239  5e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.381079 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3527  glutathione synthetase  39.55 
 
 		 317 aa  239  5e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.182234  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0689  glutathione synthetase  39.87 
 
 		 315 aa  239  5e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00688489  normal  0.665368 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3445  glutathione synthetase  39.87 
 
 		 315 aa  239  5e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0224721  hitchhiker  0.00475797 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2324  glutathione synthetase  43.22 
 
 		 323 aa  238  8e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2975  glutathione synthetase  40.19 
 
 		 319 aa  238  9e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2338  glutathione synthetase  42.72 
 
 		 322 aa  238  1e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0106  glutathione synthetase  41.27 
 
 		 321 aa  238  1e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0534673  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6192  glutathione synthetase  43.51 
 
 		 318 aa  238  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2078  glutathione synthetase  41.27 
 
 		 321 aa  238  1e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00378779  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3225  glutathione synthetase  39.23 
 
 		 315 aa  238  1e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00267386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3766  glutathione synthetase  39.94 
 
 		 317 aa  238  1e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.725262  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03170  glutathione synthetase  41.85 
 
 		 318 aa  238  1e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.358999  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0440  glutathione synthetase  43.18 
 
 		 318 aa  237  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.735138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0528  glutathione synthetase  41.16 
 
 		 318 aa  236  4e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05310  glutathione synthetase  40.97 
 
 		 317 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0507  glutathione synthetase  40.97 
 
 		 317 aa  235  7e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0471  glutathione synthetase  40.89 
 
 		 317 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0574  glutathione synthetase  40.84 
 
 		 316 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000193905  normal  0.212613 
 
 
-
 
NC_002978  WD0322  glutathione synthetase  38.02 
 
 		 309 aa  234  2.0000000000000002e-60  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3635  glutathione synthase  40.26 
 
 		 317 aa  234  2.0000000000000002e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.404738  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0545  glutathione synthetase  40.06 
 
 		 317 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0301988  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1152  glutathione synthetase  40.63 
 
 		 320 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2918  glutathione synthetase  40.91 
 
 		 318 aa  233  3e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>