More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0251 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0251  PfkB  100 
 
 		 333 aa  675    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0581  PfkB  90.39 
 
 		 333 aa  598  1e-170  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0461  PfkB domain protein  89.49 
 
 		 333 aa  595  1e-169  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0457  PfkB  81.08 
 
 		 333 aa  555  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0036  pfkB family carbohydrate kinase  78.25 
 
 		 333 aa  528  1e-149  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564268  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0010  PfkB  80.72 
 
 		 333 aa  526  1e-148  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00317456  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0218  PfkB  80.48 
 
 		 333 aa  520  1e-146  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1165  PfkB domain protein  62.35 
 
 		 335 aa  422  1e-117  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188666 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2565  ribokinase-like domain-containing protein  63.14 
 
 		 333 aa  411  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.650274  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0169  carbohydrate kinase  57.62 
 
 		 330 aa  395  1e-109  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0162  carbohydrate kinase  57.62 
 
 		 330 aa  395  1e-109  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.98466  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0215  ribokinase-like domain-containing protein  61.03 
 
 		 333 aa  392  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.26013  normal  0.0979989 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0178  ribokinase-like domain-containing protein  56.84 
 
 		 331 aa  386  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.613115  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1639  ribokinase-like domain-containing protein  59.09 
 
 		 331 aa  381  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.487738  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4021  PfkB  58.48 
 
 		 330 aa  380  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737193  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1260  PfkB domain protein  60 
 
 		 331 aa  380  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5108  PfkB domain protein  56.12 
 
 		 337 aa  370  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4645  ribokinase-like domain-containing protein  56.12 
 
 		 337 aa  370  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5186  PfkB domain protein  57.01 
 
 		 337 aa  370  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.430634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1228  ribokinase-like domain-containing protein  55.73 
 
 		 337 aa  361  1e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3378  ribokinase-like domain-containing protein  54.57 
 
 		 330 aa  356  2.9999999999999997e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.463525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0121  ribokinase-like domain-containing protein  56.13 
 
 		 328 aa  355  6.999999999999999e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.02163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0316  pfkB family carbohydrate kinase  52.91 
 
 		 330 aa  355  8.999999999999999e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.930013  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0149  PfkB  56.36 
 
 		 407 aa  354  1e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.029935  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3532  ribokinase-like domain-containing protein  54.63 
 
 		 337 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal  0.851243 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4407  PfkB domain protein  52.6 
 
 		 330 aa  350  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4087  PfkB domain protein  51.99 
 
 		 330 aa  348  5e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5046  ribokinase-like domain-containing protein  53.5 
 
 		 329 aa  337  1.9999999999999998e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07411  carbohydrate kinase  50.15 
 
 		 342 aa  322  7e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2989  ribokinase-like domain-containing protein  50.15 
 
 		 338 aa  316  4e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0690  carbohydrate kinase PfkB family  50.46 
 
 		 338 aa  314  9.999999999999999e-85  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0151  PfkB  51.83 
 
 		 331 aa  314  1.9999999999999998e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1307  PfkB domain protein  49.69 
 
 		 338 aa  310  2.9999999999999997e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.887451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2872  PfkB  49.38 
 
 		 332 aa  307  2.0000000000000002e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1668  carbohydrate kinase PfkB family  48.93 
 
 		 337 aa  298  6e-80  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1030  pfkB family carbohydrate kinase  50.76 
 
 		 330 aa  297  2e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.577037  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2691  ribokinase-like domain-containing protein  50.76 
 
 		 330 aa  296  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.272607  normal  0.270933 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05061  carbohydrate kinase  43.38 
 
 		 348 aa  286  4e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0313242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0198  ribokinase-like domain-containing protein  51.99 
 
 		 330 aa  285  7e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0506  carbohydrate kinase-like  41.69 
 
 		 334 aa  285  8e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05621  carbohydrate kinase  41.8 
 
 		 333 aa  285  9e-76  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05321  carbohydrate kinase  41.49 
 
 		 333 aa  283  3.0000000000000004e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0559209  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05691  carbohydrate kinase  40 
 
 		 338 aa  282  5.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0990225  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1838  carbohydrate kinase  42.68 
 
 		 335 aa  281  1e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05631  carbohydrate kinase  42.38 
 
 		 335 aa  276  5e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.577343 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2022  ribokinase-like domain-containing protein  49.37 
 
 		 330 aa  268  8e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2452  PfkB  41.9 
 
 		 330 aa  260  3e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.826037  normal  0.155331 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1671  PfkB  42.07 
 
 		 331 aa  253  4.0000000000000004e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.276087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3022  PfkB domain protein  43.64 
 
 		 333 aa  249  6e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.523599  normal  0.417909 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2872  ribokinase-like domain-containing protein  39.88 
 
 		 335 aa  221  9.999999999999999e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2568  ribokinase-like domain-containing protein  42.01 
 
 		 333 aa  218  7.999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0562  PfkB domain protein  40.88 
 
 		 328 aa  213  2.9999999999999995e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3284  PfkB  37.31 
 
 		 336 aa  203  3e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.469583  normal  0.0441315 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0819  cell division protein FtsA  35.44 
 
 		 328 aa  185  9e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000392808  normal  0.759534 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1494  PfkB domain protein  35.74 
 
 		 331 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0243607  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3284  ribokinase-like domain-containing protein  34.55 
 
 		 330 aa  181  1e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000189129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2764  PfkB  36.05 
 
 		 370 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.040802  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1084  PfkB domain protein  34.29 
 
 		 327 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1113  PfkB domain protein  34.29 
 
 		 327 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.941643 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1845  ribokinase-like domain-containing protein  32.05 
 
 		 341 aa  161  1e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000273033  unclonable  0.000000000472438 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0494  PfkB domain protein  35.83 
 
 		 360 aa  158  2e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1910  carbohydrate kinase  31.89 
 
 		 339 aa  154  1e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.0000000000000704659  hitchhiker  0.00127543 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2200  PfkB  32.51 
 
 		 339 aa  154  2e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000468276  decreased coverage  0.00888496 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2854  ribokinase-like domain-containing protein  33.76 
 
 		 328 aa  149  7e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000011716  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0055  ribokinase-like domain-containing protein  33.96 
 
 		 334 aa  145  8.000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.747338  normal  0.368725 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7068  PfkB  33.33 
 
 		 297 aa  96.7  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  34.6 
 
 		 303 aa  96.3  6e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50659  predicted protein  28.49 
 
 		 347 aa  94.4  3e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  30.85 
 
 		 317 aa  93.6  4e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24440  sugar kinase, ribokinase  32.1 
 
 		 288 aa  93.2  6e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.480444  normal  0.238886 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1498  PfkB domain protein  31.7 
 
 		 300 aa  91.7  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0902  PfkB domain protein  31.34 
 
 		 309 aa  90.5  4e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1755  PfkB domain protein  29.39 
 
 		 304 aa  90.1  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  31.85 
 
 		 305 aa  90.1  5e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2461  ribokinase-like domain-containing protein  32.16 
 
 		 316 aa  86.3  7e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1580  ribokinase-like domain-containing protein  28.91 
 
 		 309 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0863941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  29.93 
 
 		 307 aa  82  0.00000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2001  PfkB domain protein  26.29 
 
 		 321 aa  82.4  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  28.52 
 
 		 308 aa  80.5  0.00000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0692  carbohydrate kinase  28.14 
 
 		 304 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.19709  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18364  predicted protein  29.78 
 
 		 273 aa  78.6  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.132458 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1736  PfkB domain protein  28.78 
 
 		 304 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0189  PfkB family carbohydrate kinase  28.08 
 
 		 339 aa  77  0.0000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  30.43 
 
 		 304 aa  77  0.0000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0949  PfkB  30.43 
 
 		 301 aa  76.6  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6402  kinase, PfkB family  28.62 
 
 		 316 aa  75.9  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.223985  normal  0.0576873 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39540  sugar kinase, ribokinase  30.71 
 
 		 296 aa  75.1  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2385  PfkB domain-containing protein  28.68 
 
 		 297 aa  75.1  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.790997  normal  0.420761 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4122  PfkB  26.09 
 
 		 320 aa  75.1  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0500  inosine-guanosine kinase  26.96 
 
 		 434 aa  74.3  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0187048  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2413  PfkB domain protein  27.24 
 
 		 642 aa  73.9  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0416  PfkB  29.7 
 
 		 320 aa  73.9  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2483  PfkB domain protein  26.58 
 
 		 302 aa  72.8  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0970  carbohydrate kinase  29.6 
 
 		 314 aa  72.8  0.000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0070  ribokinase-like domain-containing protein  32.32 
 
 		 305 aa  72.8  0.000000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.60231  normal  0.104072 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2100  ribokinase  26.71 
 
 		 307 aa  72.8  0.000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0433  inosine-guanosine kinase  27.75 
 
 		 434 aa  72  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.355559  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0646  ribokinase-like domain-containing protein  25.61 
 
 		 328 aa  72.4  0.00000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1627  PfkB domain protein  30.08 
 
 		 309 aa  71.2  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.100578  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2014  PfkB domain protein  28.03 
 
 		 324 aa  71.6  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>