More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0238 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007958  RPD_0238  apolipoprotein N-acyltransferase  100 
 
 
536 aa  1058  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0018  apolipoprotein N-acyltransferase  74.04 
 
 
535 aa  793  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.06922 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0594  apolipoprotein N-acyltransferase  86.38 
 
 
536 aa  902  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0472  apolipoprotein N-acyltransferase  78.88 
 
 
534 aa  833  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.44702 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0025  apolipoprotein N-acyltransferase  75.97 
 
 
541 aa  811  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0448  apolipoprotein N-acyltransferase  81.97 
 
 
536 aa  865  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0050  apolipoprotein N-acyltransferase  68.5 
 
 
536 aa  717  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1814  apolipoprotein N-acyltransferase  52.16 
 
 
540 aa  459  1e-128  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.136968  normal  0.226792 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0231  apolipoprotein N-acyltransferase  51.41 
 
 
556 aa  444  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.448877  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3532  apolipoprotein N-acyltransferase  51.2 
 
 
567 aa  445  1e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0212796  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3208  apolipoprotein N-acyltransferase  50.83 
 
 
567 aa  444  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.122216  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3178  apolipoprotein N-acyltransferase  51.67 
 
 
553 aa  431  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0696022  normal  0.0191984 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3621  apolipoprotein N-acyltransferase  46.09 
 
 
557 aa  429  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2893  apolipoprotein N-acyltransferase  48.67 
 
 
576 aa  426  1e-118  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.240841 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3403  apolipoprotein N-acyltransferase  51.2 
 
 
566 aa  424  1e-117  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.72267  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0635  apolipoprotein N-acyltransferase  47.64 
 
 
543 aa  421  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.578942 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0754  apolipoprotein N-acyltransferase  45.54 
 
 
532 aa  416  1e-115  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.411203  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0015  apolipoprotein N-acyltransferase  46.51 
 
 
534 aa  408  1e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.449034  normal  0.161189 
 
 
-
 
NC_004310  BR2158  apolipoprotein N-acyltransferase  44.09 
 
 
532 aa  406  1e-112  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.0003541  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2070  apolipoprotein N-acyltransferase  44.28 
 
 
532 aa  408  1e-112  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000583807  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0017  apolipoprotein N-acyltransferase  46.03 
 
 
534 aa  401  1e-110  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00536194 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1059  apolipoprotein N-acyltransferase  44.34 
 
 
550 aa  395  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.130315  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0442  apolipoprotein N-acyltransferase  42.69 
 
 
528 aa  379  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0171803  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1247  apolipoprotein N-acyltransferase  40.99 
 
 
541 aa  370  1e-101  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.620781  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0044  apolipoprotein N-acyltransferase  42.47 
 
 
543 aa  370  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00386393  unclonable  4.81156e-12 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3613  apolipoprotein N-acyltransferase  41.44 
 
 
523 aa  301  1e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.157782  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3951  apolipoprotein N-acyltransferase  41.44 
 
 
523 aa  301  1e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.680782  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3037  apolipoprotein N-acyltransferase  37.13 
 
 
537 aa  293  7e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3774  apolipoprotein N-acyltransferase  39.41 
 
 
531 aa  289  1e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0178  apolipoprotein N-acyltransferase  33.01 
 
 
501 aa  274  4e-72  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4441  apolipoprotein N-acyltransferase  37.45 
 
 
502 aa  272  1e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0120  apolipoprotein N-acyltransferase  32.03 
 
 
488 aa  253  6e-66  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0025  apolipoprotein N-acyltransferase  36.42 
 
 
528 aa  246  1e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.129672  normal  0.499637 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0192  apolipoprotein N-acyltransferase  37.66 
 
 
508 aa  243  8e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3281  apolipoprotein N-acyltransferase  37.94 
 
 
495 aa  240  5e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.909948 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0705  apolipoprotein N-acyltransferase  36.14 
 
 
487 aa  240  6e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.515448 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3596  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  37.35 
 
 
495 aa  234  3e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0428669  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0497  apolipoprotein N-acyltransferase  36.13 
 
 
472 aa  232  2e-59  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.367555  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3876  hypothetical protein  36.82 
 
 
495 aa  231  3e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.350017  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1013  apolipoprotein N-acyltransferase  35.08 
 
 
497 aa  229  1e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.179625  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2103  apolipoprotein N-acyltransferase  34.83 
 
 
525 aa  223  7e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0285  apolipoprotein N-acyltransferase  34.77 
 
 
522 aa  212  1e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3138  apolipoprotein N-acyltransferase  31.88 
 
 
573 aa  199  1e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.632903 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1236  apolipoprotein N-acyltransferase  35.96 
 
 
506 aa  196  1e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1976  apolipoprotein N-acyltransferase  28.63 
 
 
524 aa  194  4e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0457399 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2927  apolipoprotein N-acyltransferase  31.71 
 
 
537 aa  192  1e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.974187  decreased coverage  0.00828182 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1116  apolipoprotein N-acyltransferase  29.79 
 
 
513 aa  189  1e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0723  apolipoprotein N-acyltransferase  32.42 
 
 
510 aa  188  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1768  apolipoprotein N-acyltransferase  32.2 
 
 
542 aa  188  2e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3374  apolipoprotein N-acyltransferase  31.68 
 
 
588 aa  186  9e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0635082 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2276  apolipoprotein N-acyltransferase  28.05 
 
 
524 aa  186  1e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00039204 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3259  apolipoprotein N-acyltransferase  33.04 
 
 
507 aa  184  3e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1785  apolipoprotein N-acyltransferase  34.28 
 
 
521 aa  184  5e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000151712  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1000  apolipoprotein N-acyltransferase  30.78 
 
 
516 aa  183  6e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.671685  normal  0.0816035 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2037  apolipoprotein N-acyltransferase  32.98 
 
 
516 aa  182  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1215  apolipoprotein N-acyltransferase  30.71 
 
 
509 aa  181  3e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.814042  normal  0.510478 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1004  apolipoprotein N-acyltransferase  30.78 
 
 
516 aa  181  3e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.13359 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0527  apolipoprotein N-acyltransferase  32.44 
 
 
523 aa  180  5e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.776126  normal  0.0299872 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2337  apolipoprotein N-acyltransferase  27.43 
 
 
523 aa  180  6e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.111383 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1001  apolipoprotein N-acyltransferase  32.94 
 
 
507 aa  179  8e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00299698  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1065  apolipoprotein N-acyltransferase  31.31 
 
 
519 aa  179  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0720615 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2859  apolipoprotein N-acyltransferase  30.48 
 
 
518 aa  179  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0418  apolipoprotein N-acyltransferase  31.5 
 
 
503 aa  179  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.618227  normal  0.927373 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0403  apolipoprotein N-acyltransferase  31.12 
 
 
503 aa  178  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.44742 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1303  apolipoprotein N-acyltransferase  32.14 
 
 
502 aa  178  2e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.873503  normal  0.159256 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1177  apolipoprotein N-acyltransferase  30.48 
 
 
518 aa  177  3e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2742  apolipoprotein N-acyltransferase  31.43 
 
 
514 aa  177  5e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.447637  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3700  apolipoprotein N-acyltransferase  32.24 
 
 
515 aa  177  6e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.582606  hitchhiker  2.54581e-05 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2734  apolipoprotein N-acyltransferase  32.65 
 
 
525 aa  176  7e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.8548  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1104  apolipoprotein N-acyltransferase  30.9 
 
 
511 aa  174  5e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0480  apolipoprotein N-acyltransferase  29.51 
 
 
505 aa  174  5e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0772251  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2380  apolipoprotein N-acyltransferase  31.35 
 
 
532 aa  173  6e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  8.38838e-07  hitchhiker  2.62387e-05 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2726  apolipoprotein N-acyltransferase  32.61 
 
 
567 aa  173  7e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4808  apolipoprotein N-acyltransferase  31.57 
 
 
506 aa  173  8e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2367  apolipoprotein N-acyltransferase  33.12 
 
 
521 aa  173  8e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1439  apolipoprotein N-acyltransferase  37.08 
 
 
524 aa  172  1e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.233971 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1343  apolipoprotein N-acyltransferase  27.24 
 
 
522 aa  172  1e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.528625 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2751  apolipoprotein N-acyltransferase  34.1 
 
 
562 aa  172  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.444108  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0020  apolipoprotein N-acyltransferase  33 
 
 
509 aa  171  3e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0238  apolipoprotein N-acyltransferase  28.6 
 
 
510 aa  171  3e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0531  apolipoprotein N-acyltransferase  29.51 
 
 
524 aa  170  6e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0307226  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3475  apolipoprotein N-acyltransferase  29.61 
 
 
519 aa  170  6e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00817837 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6026  apolipoprotein N-acyltransferase  32.42 
 
 
562 aa  169  9e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.115466  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3443  apolipoprotein N-acyltransferase  31.26 
 
 
524 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000768498 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1102  apolipoprotein N-acyltransferase  31.44 
 
 
524 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  1.49878e-09 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2341  apolipoprotein N-acyltransferase  30.42 
 
 
526 aa  169  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.254934  normal  0.0837539 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0449  apolipoprotein N-acyltransferase  31.76 
 
 
510 aa  168  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0202397  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2616  apolipoprotein N-acyltransferase  33.46 
 
 
562 aa  168  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244944  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2281  apolipoprotein N-acyltransferase  33.18 
 
 
477 aa  169  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3265  apolipoprotein N-acyltransferase  31.08 
 
 
524 aa  167  3e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4349  apolipoprotein N-acyltransferase  30.81 
 
 
506 aa  167  4e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.37536  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004215  apolipoprotein N-acyltransferase/copper homeostasis protein CutE  30.23 
 
 
492 aa  167  4e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3307  apolipoprotein N-acyltransferase  31.07 
 
 
524 aa  166  8e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01226  apolipoprotein N-acyltransferase  28.68 
 
 
506 aa  166  1e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3138  apolipoprotein N-acyltransferase  30.13 
 
 
509 aa  166  1e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3141  apolipoprotein N-acyltransferase  27.85 
 
 
511 aa  165  1e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.218924  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1183  apolipoprotein N-acyltransferase  29.92 
 
 
512 aa  166  1e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.072894 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1455  apolipoprotein N-acyltransferase  31 
 
 
504 aa  165  2e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0063424  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0992  apolipoprotein N-acyltransferase  27.5 
 
 
501 aa  165  2e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.192008  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0749  apolipoprotein N-acyltransferase  30.37 
 
 
512 aa  164  3e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.209793  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>