More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0206 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_0046  hypothetical protein  72.48 
 
 
507 aa  739    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.810658  normal  0.280558 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0081  protein of unknown function UPF0079  80.24 
 
 
506 aa  809    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.428182  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0625  hypothetical protein  88.12 
 
 
505 aa  885    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00759808  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0383  hypothetical protein  76.24 
 
 
506 aa  762    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0206  hypothetical protein  100 
 
 
505 aa  998    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0259343  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0054  hypothetical protein  75.05 
 
 
507 aa  746    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.885213  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0086  hypothetical protein  67 
 
 
509 aa  644    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.522913  normal  0.567075 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3297  hypothetical protein  52.59 
 
 
523 aa  509  1e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.480432 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0666  protein of unknown function UPF0079  50.1 
 
 
523 aa  456  1e-127  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.469867 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1606  protein of unknown function UPF0079  51.68 
 
 
529 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0383764  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4941  protein of unknown function UPF0079  50.7 
 
 
540 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.267606 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4431  hypothetical protein  50.89 
 
 
549 aa  445  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.319947 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4542  hypothetical protein  51.19 
 
 
529 aa  442  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0493  aminoglycoside phosphotransferase  50.3 
 
 
514 aa  437  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00248724 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4895  protein of unknown function UPF0079  51.09 
 
 
542 aa  432  1e-120  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.582734  normal  0.663902 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0587  hypothetical protein  48.57 
 
 
562 aa  430  1e-119  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.977621 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3962  protein of unknown function UPF0079  44.69 
 
 
503 aa  421  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2100  hypothetical protein  48.07 
 
 
513 aa  417  9.999999999999999e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2017  hypothetical protein  47.86 
 
 
513 aa  414  1e-114  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3245  hypothetical protein  46.06 
 
 
504 aa  410  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479121  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4289  protein of unknown function UPF0079  44.11 
 
 
505 aa  402  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0623599  normal  0.680884 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0820  hypothetical protein  45.53 
 
 
509 aa  401  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1355  P-loop hydrolase/phosphotransferase  40.36 
 
 
497 aa  376  1e-103  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3578  hypothetical protein  47.56 
 
 
498 aa  375  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.303943  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0051  hypothetical protein  45.04 
 
 
502 aa  374  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0135  aminoglycoside phosphotransferase  40.5 
 
 
362 aa  242  1e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2797  hypothetical protein  38.11 
 
 
472 aa  237  4e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3437  aminoglycoside phosphotransferase  42.11 
 
 
360 aa  200  5e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.17769  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2677  aminoglycoside phosphotransferase  40.7 
 
 
328 aa  194  5e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0566  aminoglycoside phosphotransferase  40.3 
 
 
358 aa  193  7e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0083  aminoglycoside phosphotransferase  36.39 
 
 
365 aa  188  2e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.972168 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2843  aminoglycoside phosphotransferase  38.22 
 
 
332 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4850  aminoglycoside phosphotransferase  37.99 
 
 
363 aa  184  4.0000000000000006e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.191997  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2954  aminoglycoside phosphotransferase  39.5 
 
 
342 aa  179  9e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.290607  normal  0.0281748 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0160  aminoglycoside phosphotransferase  36.99 
 
 
323 aa  177  5e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.549928 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0175  aminoglycoside phosphotransferase  40.24 
 
 
341 aa  171  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00583599  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1523  hypothetical protein  39.53 
 
 
341 aa  166  9e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.165776  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2000  aminoglycoside phosphotransferase  35.06 
 
 
327 aa  157  5.0000000000000005e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00692225  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2299  aminoglycoside phosphotransferase  35.33 
 
 
328 aa  156  7e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.45511  normal  0.057046 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0962  aminoglycoside phosphotransferase  35.43 
 
 
340 aa  151  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.135258  hitchhiker  0.0017288 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2712  aminoglycoside phosphotransferase  35.81 
 
 
349 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2739  aminoglycoside phosphotransferase  35.81 
 
 
349 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2100  aminoglycoside phosphotransferase  35.81 
 
 
349 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2764  aminoglycoside phosphotransferase  35.16 
 
 
349 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6039  aminoglycoside phosphotransferase  34.84 
 
 
349 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0587  aminoglycoside phosphotransferase  35.16 
 
 
348 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2630  aminoglycoside phosphotransferase  34.52 
 
 
349 aa  137  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.280943  normal  0.909879 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2336  hypothetical protein  33.83 
 
 
330 aa  137  5e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3435  aminoglycoside phosphotransferase  34.38 
 
 
332 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0740  hypothetical protein  32.92 
 
 
338 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.565611  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46790  phosphotransferase  35.22 
 
 
340 aa  134  3.9999999999999996e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0496  aminoglycoside phosphotransferase  35.91 
 
 
344 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0550103  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2432  aminoglycoside phosphotransferase  34.87 
 
 
323 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4813  aminoglycoside phosphotransferase  33.85 
 
 
333 aa  132  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0654401 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1697  aminoglycoside phosphotransferase  30.5 
 
 
379 aa  132  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.579927  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1453  aminoglycoside phosphotransferase  34.98 
 
 
346 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.355309  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07780  hypothetical protein  32.92 
 
 
338 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0103434 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4797  aminoglycoside phosphotransferase  32.81 
 
 
339 aa  131  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.318668  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0883  aminoglycoside phosphotransferase  30.86 
 
 
345 aa  130  7.000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000858674  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1019  aminoglycoside phosphotransferase  35.22 
 
 
341 aa  129  9.000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0435  aminoglycoside phosphotransferase  34.35 
 
 
348 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.625762  normal  0.267382 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1518  hypothetical protein  30.55 
 
 
379 aa  128  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.422445 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3660  aminoglycoside phosphotransferase  34.08 
 
 
341 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0405  aminoglycoside phosphotransferase  32.6 
 
 
339 aa  127  6e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0126  aminoglycoside phosphotransferase  32.72 
 
 
344 aa  127  6e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4025  hypothetical protein  32.48 
 
 
363 aa  127  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4009  aminoglycoside phosphotransferase  34.27 
 
 
341 aa  125  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4063  aminoglycoside phosphotransferase  34.77 
 
 
308 aa  126  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.106064 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3471  aminoglycoside phosphotransferase  33.86 
 
 
387 aa  125  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.161527  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0201  hypothetical protein  33.22 
 
 
350 aa  125  3e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.59437 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0439  aminoglycoside phosphotransferase  32.29 
 
 
339 aa  124  4e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0436  aminoglycoside phosphotransferase  32.39 
 
 
339 aa  124  6e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.196256  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0374  hypothetical protein  28.66 
 
 
325 aa  123  7e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5131  aminoglycoside phosphotransferase  31.91 
 
 
339 aa  123  7e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.552611  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4849  hypothetical protein  48.99 
 
 
150 aa  123  7e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366742  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4113  aminoglycoside phosphotransferase  33.54 
 
 
387 aa  123  9e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.567269  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4765  aminoglycoside phosphotransferase  34.29 
 
 
372 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.476513  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0349  hypothetical protein  28.34 
 
 
325 aa  122  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0207  hypothetical protein  36.63 
 
 
344 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.585984  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2420  phosphotransferase family protein  36.63 
 
 
344 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2738  phosphotransferase family protein  36.63 
 
 
344 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.918677  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2340  phosphotransferase family protein  36.63 
 
 
344 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.322839  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2075  7.5 kDa chlorosome protein  28.71 
 
 
365 aa  122  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.978302  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0705  phosphotransferase family protein  36.63 
 
 
344 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0107  phosphotransferase enzyme family protein  28.8 
 
 
329 aa  121  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0251717  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4077  aminoglycoside phosphotransferase  34.46 
 
 
360 aa  121  3e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349729  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3511  aminoglycoside phosphotransferase  33.43 
 
 
346 aa  121  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0395  aminoglycoside phosphotransferase  33.96 
 
 
348 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410154  normal  0.0724183 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3910  aminoglycoside phosphotransferase  32.95 
 
 
393 aa  120  4.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2148  aminoglycoside phosphotransferase  31.37 
 
 
331 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0296  aminoglycoside phosphotransferase  32.39 
 
 
338 aa  120  7e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.000010357  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0600  hypothetical protein  32.81 
 
 
341 aa  120  7.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0870  phosphotransferase domain-containing protein  36.26 
 
 
401 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0099  aminoglycoside phosphotransferase  32.49 
 
 
362 aa  120  7.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0691  phosphotransferase family protein  35.9 
 
 
344 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0674  aminoglycoside phosphotransferase  32.32 
 
 
363 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0981  aminoglycoside phosphotransferase  29.94 
 
 
361 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.125929  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4623  aminoglycoside phosphotransferase  32.05 
 
 
340 aa  118  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111315  normal  0.973044 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1083  aminoglycoside phosphotransferase  29.65 
 
 
361 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0965455  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0993  aminoglycoside phosphotransferase  29.53 
 
 
359 aa  117  5e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>