90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0169 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0169  hypothetical protein  100 
 
 		 265 aa  534  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0067  hypothetical protein  86.79 
 
 		 264 aa  424  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0042  conserved hypothetical protein, putative alpha/beta hydrolase superfamily  80.63 
 
 		 261 aa  401  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0220  hypothetical protein  81.42 
 
 		 261 aa  399  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0078  hypothetical protein  77.65 
 
 		 257 aa  382  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0340  hypothetical protein  75.49 
 
 		 265 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0070  hypothetical protein  76.47 
 
 		 257 aa  370  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.105753 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2092  hypothetical protein  67.63 
 
 		 258 aa  294  1e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.499722  normal  0.282599 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3160  hypothetical protein  58.1 
 
 		 255 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.254415  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2116  hypothetical protein  56.15 
 
 		 263 aa  278  8e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2031  putative benzoate transport protein  55.56 
 
 		 647 aa  276  2e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0804  hypothetical protein  56.18 
 
 		 259 aa  276  3e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4266  putative hydrolase protein  55.77 
 
 		 274 aa  271  6e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4531  putative hydrolase protein  55.6 
 
 		 277 aa  271  7e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.213453 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4740  hypothetical protein  60.96 
 
 		 252 aa  269  4e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.268463  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0670  hypothetical protein  56.35 
 
 		 257 aa  268  5e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1904  hypothetical protein  58.44 
 
 		 283 aa  264  1e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.490792 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1622  hypothetical protein  57.61 
 
 		 271 aa  264  1e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0067083 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4230  hypothetical protein  57.37 
 
 		 252 aa  264  1e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00845825 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3482  hypothetical protein  50.56 
 
 		 272 aa  256  2e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00930264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0199  hypothetical protein  53.2 
 
 		 269 aa  252  5.000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362941  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0639  hypothetical protein  55.98 
 
 		 272 aa  251  6e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0484381 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1199  alpha/beta hydrolase fold  55.23 
 
 		 290 aa  248  1e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0204  alpha/beta hydrolase fold  52.42 
 
 		 264 aa  246  4e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1340  hypothetical protein  51.74 
 
 		 259 aa  245  6e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1614  alpha/beta hydrolase fold  55.91 
 
 		 265 aa  230  2e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0433205  decreased coverage  0.000315383 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2038  hypothetical protein  48.24 
 
 		 248 aa  215  7e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.965886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0956  hypothetical protein  49.59 
 
 		 249 aa  214  9e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.412658  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0384  hypothetical protein  47.84 
 
 		 254 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.72124  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0852  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  48.03 
 
 		 248 aa  209  3e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3377  Alpha/beta hydrolase fold  45.67 
 
 		 256 aa  208  8e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.189225  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1720  hypothetical protein  44.05 
 
 		 247 aa  205  5e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1102  hypothetical protein  46.94 
 
 		 249 aa  205  5e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0231031  normal  0.0560372 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2193  hypothetical protein  48.03 
 
 		 252 aa  193  2e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0195926  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2243  hypothetical protein  42.52 
 
 		 251 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0687  alpha/beta hydrolase fold  42.35 
 
 		 254 aa  182  6e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0802  alpha/beta fold family hydrolase  37.92 
 
 		 253 aa  175  8e-43  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2757  hypothetical protein  46.25 
 
 		 244 aa  169  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.128442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0679  Alpha/beta hydrolase  36.03 
 
 		 257 aa  168  9e-41  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0326  alpha/beta fold family hydrolase  33.74 
 
 		 260 aa  165  5.9999999999999996e-40  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0208  alpha/beta hydrolase  44.21 
 
 		 248 aa  165  5.9999999999999996e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0472  putative hydrolase  36.25 
 
 		 279 aa  157  2e-37  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.465833  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0700  hypothetical protein  31.63 
 
 		 276 aa  82.8  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000000140392  hitchhiker  0.000000000902529 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0544  hypothetical protein  31.63 
 
 		 276 aa  82.8  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00193081  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2582  peptidase S15  27.98 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0212  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  25 
 
 		 257 aa  58.5  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0929  putative hydrolase  27.8 
 
 		 252 aa  58.5  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.119531  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  22.78 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0234  alpha/beta hydrolase fold protein  30.41 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.104073 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  27.69 
 
 		 259 aa  55.8  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0986  hypothetical protein  35.29 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.749741 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0457  Lysophospholipase-like protein  24.57 
 
 		 274 aa  53.5  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1762  alpha/beta fold family hydrolase  32.52 
 
 		 260 aa  53.5  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000326151  normal  0.089199 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1279  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  24.89 
 
 		 261 aa  53.5  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000359236  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5143  alpha/beta hydrolase fold protein  41.76 
 
 		 275 aa  51.6  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0322  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  28.67 
 
 		 274 aa  51.6  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000337661  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0798  hydrolase, putative  27.01 
 
 		 246 aa  50.8  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0227  hypothetical protein  40.91 
 
 		 257 aa  49.7  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5571  OsmC family protein  25.69 
 
 		 408 aa  49.3  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0439292 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5429  OsmC family protein  26.79 
 
 		 397 aa  48.9  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1684  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  33.67 
 
 		 248 aa  48.5  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2450  hypothetical protein  24.55 
 
 		 258 aa  48.1  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2376  putative redox protein  26.64 
 
 		 259 aa  47.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2205  hypothetical protein  24.68 
 
 		 260 aa  47  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00108131  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3182  alpha/beta hydrolase fold  31.34 
 
 		 267 aa  47  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.44747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0453  hypothetical protein  30.7 
 
 		 239 aa  47.4  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.629046 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3394  hypothetical protein  37.33 
 
 		 251 aa  47.4  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.689408  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  28.02 
 
 		 260 aa  47.4  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1379  protein of unknown function UPF0227  27.4 
 
 		 214 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.510697 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1859  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  38.81 
 
 		 256 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.584887  normal  0.1667 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3950  alpha/beta hydrolase fold  37.89 
 
 		 295 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0198056  normal  0.15982 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0776  protein of unknown function UPF0227  28.02 
 
 		 213 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4103  OsmC family protein  37.31 
 
 		 402 aa  46.6  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.671514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1578  dienelactone hydrolase  25.75 
 
 		 255 aa  46.2  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1483  hypothetical protein  28.76 
 
 		 237 aa  46.6  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3136  hypothetical protein  37.88 
 
 		 258 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0718166  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36540  hypothetical protein  37.88 
 
 		 258 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0232099  normal  0.968112 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2236  prolyl oligopeptidase family protein  37.31 
 
 		 270 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.99651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3504  hypothetical protein  37.31 
 
 		 256 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.705316  normal  0.144736 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17390  hypothetical protein  28.31 
 
 		 268 aa  45.8  0.0008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4297  prolyl oligopeptidase family protein  33.71 
 
 		 242 aa  45.4  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6666  alpha/beta hydrolase fold  36.36 
 
 		 294 aa  44.3  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203299  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0226  hypothetical protein  37.88 
 
 		 257 aa  43.9  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4878  alpha/beta hydrolase fold  41.18 
 
 		 281 aa  43.1  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.345435  normal  0.558043 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0600  alpha/beta hydrolase fold protein  34.88 
 
 		 253 aa  43.1  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000132287  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2291  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  30.23 
 
 		 256 aa  42.7  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.155063  hitchhiker  0.0000115938 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2537  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 		 273 aa  42.7  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.68 
 
 		 368 aa  42.4  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3437  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  37.5 
 
 		 256 aa  42  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.431978 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1273  Alpha/beta hydrolase fold  29.65 
 
 		 258 aa  42  0.01  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.879726  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>