25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0167 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0167  hypothetical protein  100 
 
 		 141 aa  270  3e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.537871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0042  hypothetical protein  79.72 
 
 		 143 aa  187  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0450  hypothetical protein  66.07 
 
 		 143 aa  120  8e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0217  hypothetical protein  44.17 
 
 		 123 aa  84.7  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0702  hypothetical protein  34.4 
 
 		 124 aa  70.1  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.594351  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1692  hypothetical protein  38.84 
 
 		 111 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4346  hypothetical protein  36 
 
 		 116 aa  66.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.338582  normal  0.503108 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1776  hypothetical protein  37.93 
 
 		 116 aa  65.9  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1792  hypothetical protein  39.13 
 
 		 116 aa  66.2  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  unclonable  0.000000000573078  normal  0.10017 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1324  putative exported protein of unknown function  36.36 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.903845  normal  0.229957 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1012  hypothetical protein  41.58 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.12519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0760  hypothetical protein  41.58 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0363  hypothetical protein  33.87 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.170441 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2389  hypothetical protein  35.48 
 
 		 130 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2666  hypothetical protein  35.48 
 
 		 130 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4730  hypothetical protein  36.17 
 
 		 123 aa  52  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.267221 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0838  hypothetical protein  33.33 
 
 		 129 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00373642 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6223  hypothetical protein  31.97 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0218  hypothetical protein  39.52 
 
 		 126 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0439121 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4462  hypothetical protein  34.15 
 
 		 123 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.511366 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2346  hypothetical protein  35.45 
 
 		 130 aa  47  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3136  hypothetical protein  37.5 
 
 		 124 aa  47  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5426  hypothetical protein  35.79 
 
 		 126 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7083  hypothetical protein  32.29 
 
 		 131 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.200411  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4822  hypothetical protein  30.56 
 
 		 119 aa  40.8  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>