116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0145 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0145  hypothetical protein  100 
 
 		 371 aa  717    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0706  hypothetical protein  87.06 
 
 		 373 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0565  hypothetical protein  76.67 
 
 		 370 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.866851  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0368  hypothetical protein  70.28 
 
 		 378 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.992488 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0005  hypothetical protein  61.43 
 
 		 377 aa  377  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00809476  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0015  hypothetical protein  60.46 
 
 		 380 aa  350  2e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4389  hypothetical protein  39.12 
 
 		 361 aa  170  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2736  hypothetical protein  37.87 
 
 		 363 aa  150  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.30564  normal  0.0867479 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2601  hypothetical protein  37.42 
 
 		 371 aa  119  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.220305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0309  hypothetical protein  34.26 
 
 		 363 aa  108  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.631914  normal  0.0699099 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1134  hypothetical protein  35.08 
 
 		 376 aa  93.6  4e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0164  hypothetical protein  34.53 
 
 		 359 aa  69.3  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2884  hypothetical protein  32.19 
 
 		 360 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0054  hypothetical protein  24.02 
 
 		 338 aa  64.7  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1914  protein of unknown function DUF939  27.67 
 
 		 395 aa  64.7  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0097  hypothetical protein  23.53 
 
 		 347 aa  62.8  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0146368  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2821  hypothetical protein  33.16 
 
 		 724 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.596664  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1902  fusaric acid resistance domain-containing protein  27.48 
 
 		 679 aa  56.6  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.48277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1538  fusaric acid resistance domain protein  30 
 
 		 679 aa  56.6  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0513426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1157  hypothetical protein  33.33 
 
 		 238 aa  55.8  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.596662  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1611  fusaric acid resistance domain-containing protein  30 
 
 		 679 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.461133  normal  0.751418 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1733  fusaric acid resistance domain protein  30 
 
 		 679 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105287  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1551  fusaric acid resistance domain protein  29.52 
 
 		 679 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33190  hypothetical protein  33.16 
 
 		 724 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014137 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7105  hypothetical protein  29.96 
 
 		 350 aa  54.3  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5449  hypothetical protein  33.33 
 
 		 189 aa  53.5  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.962565 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1802  fusaric acid resistance protein region  27.36 
 
 		 677 aa  53.5  0.000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  0.016258 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3032  hypothetical protein  27.04 
 
 		 770 aa  53.1  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0228594  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3993  hypothetical protein  27.61 
 
 		 356 aa  52.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0182739  normal  0.26526 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1553  fusaric acid resistance domain-containing protein  28.91 
 
 		 670 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.266646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4720  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  25 
 
 		 746 aa  52.4  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171257  hitchhiker  0.00604484 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1837  fusaric acid resistance domain protein  29.3 
 
 		 670 aa  52.8  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0235624  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01615  conserved inner membrane protein  28.91 
 
 		 670 aa  52  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.174689  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1995  Fusaric acid resistance protein conserved region  28.91 
 
 		 670 aa  52  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000064393  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2888  YccS/YhfK family integral membrane protein  29.21 
 
 		 727 aa  52  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1722  fusaric acid resistance domain-containing protein  28.91 
 
 		 670 aa  52  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.375298  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1856  fusaric acid resistance domain-containing protein  28.91 
 
 		 670 aa  52  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0794628  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1984  fusaric acid resistance protein region  28.91 
 
 		 670 aa  52  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0152424  hitchhiker  0.000622676 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1167  fusaric acid resistance protein region  28.86 
 
 		 676 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240521 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2357  fusaric acid resistance domain protein  28.91 
 
 		 663 aa  52  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000905484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0939  fusaric acid resistance protein region  26.8 
 
 		 730 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2375  integral membrane protein, YccS/YhfK family  29.21 
 
 		 727 aa  50.8  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2162  conserved hypothetical conserved membrane protein  32.6 
 
 		 679 aa  50.4  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0547772  normal  0.0766716 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1818  hypothetical protein  26.67 
 
 		 664 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4083  fusaric acid resistance protein region  30.19 
 
 		 682 aa  49.7  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4120  hypothetical protein  31.28 
 
 		 679 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.215585  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4804  membrane protein-like protein  32.56 
 
 		 352 aa  48.9  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2060  fusaric acid resistance protein region  31.45 
 
 		 635 aa  48.9  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.065197  normal  0.166692 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47810  hypothetical protein  30.73 
 
 		 679 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00112495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0233  membrane protein-like  31.61 
 
 		 653 aa  49.3  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1421  hypothetical membrane spanning protein  27.27 
 
 		 377 aa  48.9  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.230954  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1952  fusaric acid resistance protein region  28.07 
 
 		 704 aa  48.1  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6076  membrane protein  31.03 
 
 		 600 aa  48.1  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1693  membrane protein-like  30.77 
 
 		 188 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21280  hypothetical protein  26.25 
 
 		 664 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2305  membrane protein-like protein  30.77 
 
 		 188 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1472  integral membrane protein, YccS/YhfK family protein  24.5 
 
 		 733 aa  48.1  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.872698 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1484  hypothetical protein  27.27 
 
 		 377 aa  48.5  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.356024  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4267  fusaric acid resistance protein region  27.48 
 
 		 662 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2328  membrane protein-like protein  30.77 
 
 		 188 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.529679  normal  0.28675 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2224  membrane protein-like protein  35.17 
 
 		 188 aa  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3187  hypothetical protein  26.87 
 
 		 790 aa  47.4  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0973  membrane protein-like protein  33.33 
 
 		 189 aa  47.4  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1329  hypothetical protein  37.5 
 
 		 217 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.666788  normal  0.253277 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2211  fusaric acid resistance protein region  29.14 
 
 		 670 aa  47.4  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0710968  hitchhiker  0.000740189 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5647  membrane protein-like  31.79 
 
 		 189 aa  46.6  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4234  Fusaric acid resistance protein conserved region  28.57 
 
 		 690 aa  46.6  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1365  hypothetical protein  30.77 
 
 		 272 aa  46.6  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0118  fusaric acid resistance protein region  28.57 
 
 		 690 aa  46.6  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.429698  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4282  fusaric acid resistance protein region  28.57 
 
 		 711 aa  46.6  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4422  fusaric acid resistance protein region  28.57 
 
 		 690 aa  46.6  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5794  integral membrane protein, YccS/YhfK family  25.91 
 
 		 720 aa  46.6  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2344  membrane protein-like protein  34.48 
 
 		 188 aa  46.2  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2072  membrane protein-like protein  29.09 
 
 		 419 aa  46.6  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000107578  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1903  hypothetical protein  30.77 
 
 		 269 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.515369  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1263  fusaric acid resistance protein  32.46 
 
 		 676 aa  46.2  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1992  fusaric acid resistance protein region  27.85 
 
 		 702 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.355593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0430  membrane protein  28.23 
 
 		 364 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0785433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2038  membrane protein-like protein  28.81 
 
 		 184 aa  45.8  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0752149  normal  0.0532499 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5820  membrane protein-like protein  32.12 
 
 		 659 aa  46.2  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.202056  normal  0.271534 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4582  fusaric acid resistance protein region  28.89 
 
 		 725 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0691108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0867  fusaric acid resistance protein region  29.44 
 
 		 725 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5462  fusaric acid resistance protein region  28.87 
 
 		 718 aa  45.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0737125 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1150  fusaric acid resistance protein region  27.03 
 
 		 662 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0139844  normal  0.271992 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5009  membrane protein, TIGR01666  22.93 
 
 		 732 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2509  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  22.91 
 
 		 746 aa  45.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000184796  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01106  hypothetical protein  26.13 
 
 		 680 aa  44.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1017  hypothetical protein  34.81 
 
 		 217 aa  44.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120147  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05690  Integral membrane protein, YccS/YhfK family  28.07 
 
 		 724 aa  45.1  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2253  Fusaric acid resistance protein conserved region  29.34 
 
 		 653 aa  45.1  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1951  conserved hypothetical conserved membrane protein  31.49 
 
 		 677 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.126596  normal  0.313547 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0765  hypothetical protein  34.81 
 
 		 217 aa  44.7  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.644467 
 
 
-
 
NC_004310  BR1809  hypothetical protein  24.82 
 
 		 176 aa  44.3  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1053  hypothetical protein  30.77 
 
 		 197 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0815  hypothetical protein  30.77 
 
 		 197 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1207  hypothetical protein  30.77 
 
 		 197 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1215  hypothetical protein  30.77 
 
 		 197 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0312554  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0336  hypothetical protein  30.77 
 
 		 197 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1742  hypothetical protein  24.82 
 
 		 176 aa  44.7  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.62552  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1796  fusaric acid resistance protein region  28.66 
 
 		 625 aa  43.9  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00451003  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>