More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0134 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0134  beta-lactamase-like  100 
 
 		 222 aa  448  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0715  Beta-lactamase-like  91.89 
 
 		 222 aa  413  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0571  beta-lactamase domain protein  87.61 
 
 		 221 aa  391  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.695514  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7673  metallo-hydrolase/oxidoreductase domain-containing protein  78.18 
 
 		 222 aa  358  5e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0374  beta-lactamase-like  75.68 
 
 		 222 aa  352  2.9999999999999997e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.834872 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0233  beta-lactamase-like  73.15 
 
 		 230 aa  333  2e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0113  beta-lactamase-like  70.91 
 
 		 224 aa  325  3e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.110968 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5856  beta-lactamase domain protein  71.01 
 
 		 213 aa  305  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.518272  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5335  beta-lactamase domain-containing protein  70.53 
 
 		 213 aa  297  8e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.311932  normal  0.0822687 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2576  beta-lactamase domain-containing protein  65.87 
 
 		 214 aa  282  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.835238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2508  beta-lactamase domain protein  65.87 
 
 		 214 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523411 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1467  metallo-beta-lactamase family protein  64.9 
 
 		 218 aa  283  2.0000000000000002e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2799  beta-lactamase domain protein  65.87 
 
 		 214 aa  282  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130329  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1517  metallo-beta-lactamase family protein  64.9 
 
 		 218 aa  281  6.000000000000001e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0317  beta-lactamase domain-containing protein  65.22 
 
 		 214 aa  281  7.000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.605621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1648  beta-lactamase domain-containing protein  63.94 
 
 		 218 aa  276  1e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2753  beta-lactamase domain protein  59.9 
 
 		 217 aa  275  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.254037  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3016  beta-lactamase domain protein  59.42 
 
 		 219 aa  272  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1588  beta-lactamase domain-containing protein  58.25 
 
 		 237 aa  268  4e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2240  beta-lactamase domain-containing protein  59.81 
 
 		 213 aa  266  2e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2138  beta-lactamase-like  64.59 
 
 		 215 aa  266  2e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0796003  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1522  Beta-lactamase-like  59.9 
 
 		 214 aa  263  1e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0451  beta-lactamase domain protein  59.22 
 
 		 213 aa  262  3e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3159  hydrolase  59.81 
 
 		 215 aa  261  4e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2524  beta-lactamase domain-containing protein  59.51 
 
 		 215 aa  259  2e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2142  metallo-beta-lactamase family protein  57.35 
 
 		 214 aa  254  5e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.84321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0841  Beta-lactamase-like  57.49 
 
 		 213 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0225813 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2954  beta-lactamase domain-containing protein  58.33 
 
 		 214 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3433  beta-lactamase-like protein  55.45 
 
 		 222 aa  250  9.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1662  beta-lactamase domain-containing protein  57.35 
 
 		 223 aa  246  1e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.220652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1728  beta-lactamase domain-containing protein  56.59 
 
 		 215 aa  247  1e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1411  beta-lactamase domain-containing protein  58.33 
 
 		 214 aa  247  1e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.557584  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  54.81 
 
 		 215 aa  246  2e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  54.81 
 
 		 215 aa  246  2e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  54.81 
 
 		 215 aa  246  2e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3151  metallo-beta-lactamase family protein  57.84 
 
 		 214 aa  246  2e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  54.81 
 
 		 215 aa  246  2e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  54.81 
 
 		 215 aa  246  2e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  54.81 
 
 		 215 aa  245  3e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  54.81 
 
 		 215 aa  245  3e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3268  Beta-lactamase-like  57.77 
 
 		 216 aa  246  3e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  54.81 
 
 		 215 aa  246  3e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  54.81 
 
 		 215 aa  245  3e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3119  beta-lactamase domain-containing protein  56.31 
 
 		 216 aa  244  4.9999999999999997e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.603346  normal  0.30493 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0167  beta-lactamase-like  54.41 
 
 		 212 aa  245  4.9999999999999997e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1422  beta-lactamase-like protein  57 
 
 		 221 aa  244  9e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1446  beta-lactamase domain-containing protein  55.12 
 
 		 215 aa  244  9e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.746343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0044  metallo-beta-lactamase superfamily protein  56.86 
 
 		 214 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1782  beta-lactamase domain protein  56.59 
 
 		 215 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00356762  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3822  metallo-beta-lactamase family protein  56.86 
 
 		 214 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0194  beta-lactamase domain-containing protein  55.83 
 
 		 214 aa  242  3e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113604  hitchhiker  0.00000000306881 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2969  metallo-beta-lactamase family protein  56.86 
 
 		 214 aa  242  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2909  metallo-beta-lactamase family protein  56.86 
 
 		 214 aa  242  3e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.457315  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3400  metallo-beta-lactamase family protein  56.86 
 
 		 214 aa  242  3e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00696268  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1632  metallo-beta-lactamase family protein  56.86 
 
 		 214 aa  242  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3903  metallo-beta-lactamase family protein  56.86 
 
 		 214 aa  242  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0394  putative metallo-beta-lactamase family protein  52.68 
 
 		 215 aa  242  3.9999999999999997e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2269  beta-lactamase domain-containing protein  55.88 
 
 		 214 aa  241  3.9999999999999997e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.289735 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3552  beta-lactamase domain-containing protein  56.8 
 
 		 483 aa  242  3.9999999999999997e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2652  beta-lactamase domain-containing protein  54.15 
 
 		 215 aa  241  6e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0560187  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2561  metallo-beta-lactamase family protein  54.15 
 
 		 215 aa  241  6e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000219407  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4053  beta-lactamase domain-containing protein  55.61 
 
 		 212 aa  241  7e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000967513 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1975  metallo-beta-lactamase superfamily protein  53.66 
 
 		 215 aa  241  7.999999999999999e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0642346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1030  hydroxyacylglutathione hydrolase  53.85 
 
 		 215 aa  239  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  hitchhiker  0.00661846 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0402  beta-lactamase domain protein  55.88 
 
 		 214 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4317  putative metallo-beta-lactamase family protein  56.37 
 
 		 214 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1112  hydroxyacylglutathione hydrolase  53.85 
 
 		 215 aa  239  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0213  beta-lactamase domain-containing protein  55.34 
 
 		 214 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.325973 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1095  hydroxyacylglutathione hydrolase  53.85 
 
 		 215 aa  239  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1062  hydroxyacylglutathione hydrolase  53.85 
 
 		 215 aa  239  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1003  hydroxyacylglutathione hydrolase  53.85 
 
 		 215 aa  239  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105674  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3268  hypothetical protein  54.72 
 
 		 224 aa  238  4e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0199  beta-lactamase domain-containing protein  54.85 
 
 		 214 aa  238  8e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604325  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3388  Beta-lactamase-like  54.63 
 
 		 241 aa  237  9e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1755  beta-lactamase domain-containing protein  54.63 
 
 		 235 aa  237  1e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.622383  normal  0.422321 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0988  metallo-beta-lactamase family protein  53.88 
 
 		 214 aa  237  1e-61  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0520901  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2054  beta-lactamase domain protein  55.61 
 
 		 215 aa  237  1e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.128768  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0267  beta-lactamase domain-containing protein  54.37 
 
 		 214 aa  236  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3586  metallo-beta-lactamase family protein  53.59 
 
 		 219 aa  236  2e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2821  beta-lactamase-like  54.63 
 
 		 237 aa  236  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1500  beta-lactamase domain-containing protein  53.92 
 
 		 214 aa  236  2e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.903392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0285  beta-lactamase domain-containing protein  54.37 
 
 		 214 aa  236  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394027  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1435  beta-lactamase domain-containing protein  53.92 
 
 		 214 aa  235  3e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0282  beta-lactamase domain-containing protein  52.94 
 
 		 240 aa  235  3e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1634  beta-lactamase domain protein  54.15 
 
 		 211 aa  234  7e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0717617  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3054  metallo-beta-lactamase family protein  53.92 
 
 		 214 aa  234  7e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1713  metallo-beta-lactamase family protein  56.37 
 
 		 212 aa  234  9e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0120  beta-lactamase domain-containing protein  54.41 
 
 		 214 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0031  beta-lactamase domain-containing protein  52.45 
 
 		 214 aa  233  1.0000000000000001e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.789051  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2370  beta-lactamase-like  52.53 
 
 		 245 aa  233  2.0000000000000002e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1662  beta-lactamase domain protein  52.68 
 
 		 212 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0334  beta-lactamase domain-containing protein  54.15 
 
 		 212 aa  231  6e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1493  beta-lactamase domain-containing protein  53.43 
 
 		 214 aa  231  6e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0068  metallo-beta-lactamase superfamily protein  51.21 
 
 		 212 aa  230  1e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0554126  normal  0.354369 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2428  beta-lactamase domain-containing protein  52.45 
 
 		 214 aa  228  4e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3466  beta-lactamase domain protein  53.43 
 
 		 218 aa  228  4e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1635  beta-lactamase domain-containing protein  53.43 
 
 		 214 aa  228  5e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.702342  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0228  beta-lactamase domain-containing protein  51.23 
 
 		 212 aa  228  5e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2734  beta-lactamase domain-containing protein  52.94 
 
 		 214 aa  228  6e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2751  beta-lactamase domain-containing protein  52.45 
 
 		 214 aa  227  1e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>