191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0109 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0109  methyltransferase type 11  100 
 
 		 277 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0599  Methyltransferase type 11  83.27 
 
 		 274 aa  407  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.586839  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0028  hypothetical protein  88.24 
 
 		 277 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0522  methyltransferase  78.99 
 
 		 279 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.255454 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0481  methyltransferase  74.55 
 
 		 312 aa  358  4e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0386  methyltransferase  71.38 
 
 		 289 aa  351  8.999999999999999e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.559124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7593  hypothetical protein  71.69 
 
 		 281 aa  337  9.999999999999999e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0427601 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2677  methyltransferase type 11  62.26 
 
 		 296 aa  296  2e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.265599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3105  methyltransferase type 11  62.59 
 
 		 311 aa  286  2e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.344458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1710  Methyltransferase type 11  57.89 
 
 		 295 aa  286  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.281828  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4813  methyltransferase type 11  57.8 
 
 		 292 aa  285  5e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000890432 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0309  methyltransferase type 11  60.7 
 
 		 297 aa  271  9e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.407914 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0353  Methyltransferase type 11  60.56 
 
 		 297 aa  270  2e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.373427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1136  methyltransferase type 11  55.12 
 
 		 298 aa  269  2.9999999999999997e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.577473  normal  0.78298 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0385  Methyltransferase type 11  59.23 
 
 		 296 aa  269  4e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.576997  normal  0.849001 
 
 
-
 
NC_004310  BR1879  hypothetical protein  54.33 
 
 		 297 aa  269  5e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1809  hypothetical protein  54.33 
 
 		 297 aa  269  5e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.492248  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1027  methyltransferase type 11  54.42 
 
 		 298 aa  265  7e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3007  methyltransferase type 11  54.77 
 
 		 292 aa  260  2e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2511  hypothetical protein  51.9 
 
 		 299 aa  258  6e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.282001 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1735  methyltransferase type 11  51.85 
 
 		 320 aa  258  8e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.802217  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3824  putative methyltransferase protein  50 
 
 		 294 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.563135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0938  methyltransferase type 11  54.14 
 
 		 304 aa  252  5.000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.455368 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3533  putative methyltransferase protein  49.31 
 
 		 294 aa  250  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2968  Methyltransferase type 11  56.69 
 
 		 299 aa  232  5e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.452033 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2265  methyltransferase type 11  47.7 
 
 		 305 aa  226  2e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3971  methyltransferase  49.48 
 
 		 289 aa  225  8e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0366  hypothetical protein  45 
 
 		 296 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0294  hypothetical protein  50.6 
 
 		 293 aa  214  1.9999999999999998e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2584  SAM-dependent methyltransferase  49.27 
 
 		 279 aa  211  1e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3499  SAM-dependent methyltransferase  48.36 
 
 		 289 aa  207  1e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2901  hypothetical protein  50.2 
 
 		 279 aa  203  3e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.525619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2857  SAM-dependent methyltransferase  50.75 
 
 		 270 aa  186  5e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2634  hypothetical protein  48.36 
 
 		 272 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1196  SAM-dependent methyltransferase  50.37 
 
 		 270 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0736  hypothetical protein  43.88 
 
 		 308 aa  181  1e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.3398  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0560  methyltransferase type 11  42.47 
 
 		 305 aa  165  6.9999999999999995e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.160345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0125  Methyltransferase type 11  42.59 
 
 		 289 aa  165  1.0000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.478416  normal  0.0344418 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11990  predicted protein  39.84 
 
 		 330 aa  159  6e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_89745  predicted protein  45.83 
 
 		 274 aa  159  7e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.588911 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04918  conserved hypothetical protein  40.38 
 
 		 376 aa  158  1e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0365995  normal  0.289567 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01100  conserved hypothetical protein  40.78 
 
 		 348 aa  139  6e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.336203  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58842  predicted protein  38.97 
 
 		 354 aa  139  7e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.040839  decreased coverage  0.00802664 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1494  methyltransferase type 11  39.61 
 
 		 257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1791  methyltransferase type 12  39.85 
 
 		 260 aa  125  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0725  hypothetical protein  36.31 
 
 		 264 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0339  hypothetical protein  36.75 
 
 		 263 aa  119  6e-26  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.590301  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2161  biotin biosynthesis protein BioC  36.63 
 
 		 291 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0822  biotin biosynthesis protein BioC  41.1 
 
 		 295 aa  110  3e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0926  biotin synthesis protein  40.49 
 
 		 295 aa  108  8.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.676817  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3831  biotin biosynthesis protein BioC  40.24 
 
 		 294 aa  107  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0157  biotin biosynthesis protein BioC  41.52 
 
 		 290 aa  105  8e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.322 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0668  hypothetical protein  36.14 
 
 		 240 aa  102  7e-21  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0421  biotin biosynthesis protein BioC  40 
 
 		 292 aa  102  9e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000894072 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0245  biotin synthesis protein BioC  40 
 
 		 292 aa  102  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1981  biotin biosynthesis protein BioC  26.6 
 
 		 309 aa  101  1e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3013  biotin biosynthesis protein BioC  38.95 
 
 		 291 aa  101  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.755782  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03630  biotin biosynthesis protein BioC  37.87 
 
 		 294 aa  100  3e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2109  hypothetical protein  34.43 
 
 		 263 aa  100  4e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0900704  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1132  biotin biosynthesis protein BioC  35.63 
 
 		 307 aa  98.2  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2098  biotin biosynthesis protein BioC  35.91 
 
 		 309 aa  94.4  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0322  biotin biosynthesis protein BioC  37.79 
 
 		 306 aa  93.6  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0126192 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0960  biotin biosynthesis protein BioC  37.28 
 
 		 295 aa  93.6  3e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.131557  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  37.57 
 
 		 291 aa  93.2  4e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1611  biotin synthesis protein  30.65 
 
 		 281 aa  91.3  2e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0573  putative methyltransferase  30.65 
 
 		 281 aa  91.3  2e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3817  biotin synthesis protein BioC  30.16 
 
 		 310 aa  83.6  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.335829 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6178  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  32.13 
 
 		 321 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2862  biotin synthesis protein BioC  29.3 
 
 		 302 aa  79  0.00000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.41686  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3137  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  31.71 
 
 		 558 aa  79.3  0.00000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.785759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2235  methyltransferase type 11  31.52 
 
 		 321 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180564  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2849  methyltransferase type 11  31.52 
 
 		 321 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0876  biotin synthesis protein BioC  33.54 
 
 		 300 aa  78.6  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3539  biotin synthesis protein BioC  29.3 
 
 		 302 aa  78.6  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.662235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3908  biotin synthesis protein BioC  30.47 
 
 		 305 aa  78.2  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0274  methyltransferase type 11  33.53 
 
 		 319 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.372157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0312  putative methylase involved in ubiquinone/menaquinone biosynthesis  30.96 
 
 		 333 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4173  hypothetical protein  29.72 
 
 		 338 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1400  methyltransferase type 11  29.45 
 
 		 301 aa  75.9  0.0000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1243  biotin synthesis protein BioC  32.08 
 
 		 300 aa  75.1  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.341992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2860  methyltransferase type 11  34.83 
 
 		 279 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.607715 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1187  hypothetical protein  33.96 
 
 		 317 aa  74.7  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1672  biotin synthesis protein BioC  30.49 
 
 		 300 aa  74.3  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.724893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0542  Methyltransferase type 11  34.12 
 
 		 321 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.617554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2904  methyltransferase type 11  36.57 
 
 		 321 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2766  methyltransferase type 11  36.57 
 
 		 321 aa  72  0.000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0619  biotin synthesis protein  29.79 
 
 		 297 aa  72  0.000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1535  Methyltransferase type 11  32.38 
 
 		 320 aa  71.6  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3244  methyltransferase type 11  28.77 
 
 		 280 aa  72  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0216  Methyltransferase type 11  30.39 
 
 		 313 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.320783 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0235  Methyltransferase type 11  30.58 
 
 		 313 aa  69.7  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0198521 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0454  methyltransferase type 11  36.05 
 
 		 321 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0360  putative biotin synthesis protein (methyltransferase)  29.94 
 
 		 367 aa  67  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.591727 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0424  hypothetical protein  34.32 
 
 		 338 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1679  hypothetical protein  28.78 
 
 		 295 aa  65.9  0.0000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.129518  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  30.39 
 
 		 312 aa  65.5  0.0000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2627  biotin synthesis protein, putative  34.52 
 
 		 267 aa  63.5  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0259  methyltransferase type 11  30.3 
 
 		 300 aa  63.9  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0670  hypothetical protein  34.88 
 
 		 338 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.562342  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2847  hypothetical protein  34.88 
 
 		 321 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>