10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0059 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0059  hypothetical protein  100 
 
 		 205 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.611189 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2690  hypothetical protein  78.43 
 
 		 205 aa  300  9e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.197707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7858  hypothetical protein  73.04 
 
 		 205 aa  285  4e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.338781 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4543  hypothetical protein  60.4 
 
 		 211 aa  226  2e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.399515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4061  hypothetical protein  58.91 
 
 		 221 aa  207  8e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4429  hypothetical protein  58.42 
 
 		 225 aa  206  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0804  hypothetical protein  57.84 
 
 		 205 aa  205  4e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.823154 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1629  hypothetical protein  55.72 
 
 		 205 aa  188  5e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3138  hypothetical protein  45.45 
 
 		 204 aa  179  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.598614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0471  hypothetical protein  56.22 
 
 		 206 aa  167  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0277572 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>