More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0050 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0050  ABC transporter related  100 
 
 		 232 aa  471  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.906419  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0225  ABC transporter related  52.16 
 
 		 237 aa  248  8e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.633175  normal  0.041415 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0761  ABC transporter related  53.25 
 
 		 237 aa  247  1e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3423  ABC transporter related  51.5 
 
 		 237 aa  243  9.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4479  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  51.29 
 
 		 234 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00225011  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4464  ABC transporter related  49.36 
 
 		 237 aa  242  3e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335127  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1244  ABC transporter related  48.93 
 
 		 236 aa  241  7e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193229  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0660  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  48.93 
 
 		 237 aa  240  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0197  ABC transporter related  50.43 
 
 		 234 aa  239  2e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4329  ABC transporter related  48.5 
 
 		 237 aa  239  4e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1979  ABC transporter related  48.07 
 
 		 236 aa  238  5e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  48.28 
 
 		 236 aa  236  2e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  48.71 
 
 		 236 aa  236  2e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4754  ABC transporter-related protein  50.43 
 
 		 234 aa  235  5.0000000000000005e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4218  ABC transporter related  48.28 
 
 		 234 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.110724 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2306  ABC transporter related protein  46.58 
 
 		 236 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4171  ABC transporter related  50.43 
 
 		 231 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0661  ABC transporter related  51.29 
 
 		 231 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1660  ABC transporter related  46.55 
 
 		 234 aa  232  3e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0655  ABC transporter related  51.29 
 
 		 231 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.139364 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0615  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.29 
 
 		 231 aa  231  5e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4061  ABC transporter related  46.64 
 
 		 252 aa  231  6e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.245646 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3827  ABC transporter related  49.14 
 
 		 237 aa  231  6e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1585  ABC transporter related  49.79 
 
 		 237 aa  231  6e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4904  ABC transporter related  49.14 
 
 		 237 aa  231  6e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2562  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  47.84 
 
 		 233 aa  229  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6570  ABC transporter related  47.41 
 
 		 233 aa  230  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192562  normal  0.0138442 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1755  ABC transporter related  50.86 
 
 		 234 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4185  ABC transporter related protein  50.64 
 
 		 238 aa  229  3e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0263202  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2387  ABC transporter related  45.26 
 
 		 231 aa  229  3e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0332278  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2431  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding proteinputative  48.28 
 
 		 234 aa  229  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5724  ABC transporter related  47.84 
 
 		 233 aa  229  3e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6088  ABC transporter related  47.84 
 
 		 233 aa  229  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2808  ABC transporter related  48.71 
 
 		 232 aa  228  5e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491763  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4268  ABC transporter related  49.78 
 
 		 234 aa  228  5e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6571  ABC transporter related  47.84 
 
 		 233 aa  228  6e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177691  normal  0.0408481 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1491  ABC transporter related  47.44 
 
 		 239 aa  227  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318894  normal  0.254571 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1450  ABC transporter related  47.44 
 
 		 239 aa  227  1e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0957848  hitchhiker  0.000807382 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1774  putative amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  47.44 
 
 		 236 aa  226  2e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.328885  normal  0.085306 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2313  ABC transporter related  46.35 
 
 		 236 aa  226  2e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2021  ABC transporter related  44.78 
 
 		 231 aa  224  8e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0684522  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3676  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  48.28 
 
 		 234 aa  224  1e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1576  ABC transporter related  47.39 
 
 		 231 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1683  ABC transporter related  44.78 
 
 		 231 aa  223  2e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0175  ABC transporter related  48.32 
 
 		 259 aa  223  2e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154822  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3165  ABC transporter related  47.83 
 
 		 241 aa  223  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.317931  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  50.21 
 
 		 238 aa  223  3e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3462  ABC transporter related  48.28 
 
 		 235 aa  223  3e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4568  ABC transporter related  47.39 
 
 		 232 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.272221  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1570  ABC transporter related  46.96 
 
 		 232 aa  222  4e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.687597 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2175  ABC transporter related protein  48.02 
 
 		 232 aa  221  6e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.549091  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0157  ABC transporter related  47.9 
 
 		 259 aa  221  6e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0186  ABC transporter related  44.54 
 
 		 244 aa  221  7e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0222  ABC transporter related  48.25 
 
 		 243 aa  221  7e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  48.29 
 
 		 237 aa  221  8e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2926  ABC transporter related  46.09 
 
 		 231 aa  221  8e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.103898  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2574  ABC transporter related  45.65 
 
 		 231 aa  219  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.261355  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  48.48 
 
 		 235 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1858  ABC transporter-related protein  46.55 
 
 		 237 aa  219  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3312  ABC transporter related  43.04 
 
 		 231 aa  219  3e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000555614  hitchhiker  0.00984182 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1865  ABC transporter related  47.48 
 
 		 247 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1403  ABC transporter related  46.58 
 
 		 237 aa  218  5e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668018  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1177  ABC transporter related  49.78 
 
 		 236 aa  218  6e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.496575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1841  ABC transporter related  46.09 
 
 		 231 aa  218  7e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.373128 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  47.44 
 
 		 237 aa  218  8.999999999999998e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1577  ABC transporter related  43.78 
 
 		 238 aa  217  1e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.787524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3208  ABC transporter related  48.43 
 
 		 231 aa  217  1e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.07 
 
 		 234 aa  217  1e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  48.07 
 
 		 259 aa  216  2e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2891  ABC transporter related protein  47.21 
 
 		 240 aa  215  4e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0113  ABC transporter related  43.59 
 
 		 236 aa  215  4e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0856  ABC transporter related  47.84 
 
 		 233 aa  215  5e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  47.01 
 
 		 235 aa  214  7e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1566  ABC transporter related  47.86 
 
 		 234 aa  214  7e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2929  ABC transporter related  52.13 
 
 		 230 aa  214  7e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0028  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.92 
 
 		 238 aa  214  9.999999999999999e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1863  ABC transporter related  47.44 
 
 		 238 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1754  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  45.26 
 
 		 239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395881  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0860  ABC transporter related  46.22 
 
 		 536 aa  213  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.473738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  45.34 
 
 		 235 aa  213  1.9999999999999998e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1730  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.06 
 
 		 247 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5837  ABC transporter related  48.93 
 
 		 234 aa  212  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000984285 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1209  ABC transporter related  49.15 
 
 		 256 aa  212  3.9999999999999995e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.093328  normal  0.473951 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4397  ABC transporter related  44.1 
 
 		 233 aa  212  3.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1715  ABC transporter related  50.23 
 
 		 234 aa  212  3.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0199922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1793  ABC transporter related  43.59 
 
 		 235 aa  212  4.9999999999999996e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4106  ABC transporter related  49.35 
 
 		 234 aa  211  5.999999999999999e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1819  ABC transporter-related protein  47.48 
 
 		 247 aa  211  7e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3131  ABC transporter related  45.06 
 
 		 237 aa  211  7e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1515  ABC transporter related  48.72 
 
 		 251 aa  211  7.999999999999999e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.274382  normal  0.678489 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1400  ABC transporter related  49.57 
 
 		 251 aa  211  9e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.625735 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1388  ABC transporter related  46.35 
 
 		 236 aa  210  1e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6267  ABC transporter related  48.31 
 
 		 239 aa  210  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2654  ABC transporter-like protein  47.21 
 
 		 237 aa  211  1e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00480746  hitchhiker  0.00390953 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2393  ABC transporter related  50 
 
 		 234 aa  211  1e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0025  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.92 
 
 		 238 aa  209  2e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0545  ABC transporter related  46.93 
 
 		 234 aa  209  3e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.756199 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1679  ABC transporter-like protein  45.76 
 
 		 234 aa  209  3e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.2537  normal  0.0768267 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0450  ABC transporter related  46.35 
 
 		 234 aa  209  4e-53  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.68217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0936  ABC transporter related  45.92 
 
 		 234 aa  209  4e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000438141  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>