12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0036 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0036  hypothetical protein  100 
 
 		 886 aa  1751    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1996  hypothetical protein  64.11 
 
 		 884 aa  1105    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.573803  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2986  hypothetical protein  48.53 
 
 		 884 aa  781    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.262988 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3104  hypothetical protein  49.04 
 
 		 884 aa  778    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.238928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5413  hypothetical protein  45.73 
 
 		 886 aa  668    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.871624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0781  hypothetical protein  41.8 
 
 		 886 aa  538  1e-151  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.384751  normal  0.165581 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2180  hypothetical protein  81.25 
 
 		 125 aa  82  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.729907 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0840  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  24.44 
 
 		 1048 aa  65.5  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.564215  hitchhiker  0.00099262 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3983  hypothetical protein  27.57 
 
 		 1100 aa  56.6  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.588967  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4020  hypothetical protein  27.63 
 
 		 1079 aa  55.5  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3877  hypothetical protein  29.12 
 
 		 1151 aa  54.3  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1287  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  25.52 
 
 		 994 aa  45.1  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>