23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0027 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0027  hypothetical protein  100 
 
 		 597 aa  1182    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2604  hypothetical protein  30.52 
 
 		 609 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.276166  normal  0.470384 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0028  hypothetical protein  26.2 
 
 		 632 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2605  hypothetical protein  24.96 
 
 		 661 aa  114  7.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.250599  normal  0.12756 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4754  hypothetical protein  22.91 
 
 		 609 aa  74.7  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2090  hypothetical protein  26.15 
 
 		 618 aa  73.2  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1517  hypothetical protein  23.9 
 
 		 613 aa  58.2  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.675511  normal  0.340737 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0030  hypothetical protein  22.38 
 
 		 628 aa  57.4  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3152  hypothetical protein  27.59 
 
 		 313 aa  55.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5216  hypothetical protein  27.59 
 
 		 313 aa  55.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.204329 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5058  hypothetical protein  27.59 
 
 		 363 aa  55.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.863034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0010  hypothetical protein  23.51 
 
 		 638 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.610647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0008  hypothetical protein  23.51 
 
 		 638 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0016  hypothetical protein  23.51 
 
 		 638 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.490672  unclonable  0.000000381885 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0008  hypothetical protein  23.51 
 
 		 638 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0559853  normal  0.0972457 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2536  hypothetical protein  25.18 
 
 		 617 aa  49.3  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3875  hypothetical protein  30.94 
 
 		 476 aa  48.9  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0018  hypothetical protein  32.67 
 
 		 605 aa  48.9  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1857  hypothetical protein  27.33 
 
 		 504 aa  47.8  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6545  hypothetical protein  26.92 
 
 		 322 aa  45.8  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.329804 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7024  transposition protein, TnsD-like protein  35.63 
 
 		 563 aa  45.4  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.39846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3573  hypothetical protein  36.99 
 
 		 664 aa  44.7  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0309383 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06982  hypothetical protein  31.18 
 
 		 183 aa  43.9  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>