23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0024 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0024  hypothetical protein  100 
 
 		 229 aa  462  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2601  hypothetical protein  34.94 
 
 		 197 aa  62  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.244034  normal  0.833439 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0221  TnsA endonuclease  42.86 
 
 		 210 aa  57  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.136583  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1221  hypothetical protein  30.05 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.734028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2649  hypothetical protein  30.05 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0941676  normal  0.0643152 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2170  hypothetical protein  30.05 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.514033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1345  hypothetical protein  30.05 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0014  hypothetical protein  36.78 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0005  hypothetical protein  30 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0200197  normal  0.107844 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0007  hypothetical protein  30 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0005  hypothetical protein  30 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.25819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0692  hypothetical protein  37.5 
 
 		 215 aa  48.9  0.00006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.143067  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1589  hypothetical protein  37.5 
 
 		 215 aa  48.9  0.00006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0126  hypothetical protein  30.88 
 
 		 220 aa  46.2  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0378  hypothetical protein  29.82 
 
 		 205 aa  45.8  0.0006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1648  hypothetical protein  42.11 
 
 		 217 aa  45.4  0.0007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.840198  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1193  hypothetical protein  28.57 
 
 		 241 aa  44.7  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.226627  normal  0.38143 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01456  hypothetical protein  28.81 
 
 		 208 aa  43.9  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0067  integrase catalytic subunit  34.31 
 
 		 905 aa  42.4  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4946  integrase catalytic subunit  34.31 
 
 		 905 aa  42.4  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.275371 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1715  integrase catalytic subunit  34.31 
 
 		 905 aa  42.4  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1330  integrase catalytic subunit  34.31 
 
 		 905 aa  42.4  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0193  integrase catalytic subunit  34.31 
 
 		 905 aa  42.4  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.952164  hitchhiker  0.00648226 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>