14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4892 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4892  hypothetical protein  100 
 
 		 197 aa  391  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0913  hypothetical protein  48.76 
 
 		 173 aa  159  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.514761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0809  hypothetical protein  46 
 
 		 170 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.444098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5244  hypothetical protein  46.73 
 
 		 177 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1241  hypothetical protein  32.76 
 
 		 218 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00985067  unclonable  0.0000000232118 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0643  hypothetical protein  32.92 
 
 		 172 aa  77.8  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.595512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0745  hypothetical protein  30.05 
 
 		 184 aa  72  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1681  hypothetical protein  39.52 
 
 		 216 aa  68.9  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3786  hypothetical protein  30.38 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4445  hypothetical protein  34.76 
 
 		 220 aa  62  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.651537 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2397  hypothetical protein  35.37 
 
 		 220 aa  61.2  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.438725  normal  0.127627 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3784  hypothetical protein  35.37 
 
 		 220 aa  61.2  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0249757 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4030  hypothetical protein  35.37 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0779  hypothetical protein  33.75 
 
 		 170 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>