More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4760 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



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Organism name
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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4760  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  100 
 
 		 399 aa  758    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal  1 
 
 
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NC_008825  Mpe_A3595  putative membrane transport protein  57.53 
 
 		 404 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1775  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  53.85 
 
 		 403 aa  379  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.394194  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6000  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  51.79 
 
 		 399 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.923433  normal  0.331381 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7148  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  51.77 
 
 		 399 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1702  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  54.26 
 
 		 412 aa  372  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2897  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  53.92 
 
 		 396 aa  374  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151649  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2001  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  54.01 
 
 		 412 aa  370  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0443671  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4173  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  53.87 
 
 		 400 aa  345  8.999999999999999e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_004310  BR1401  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  51.15 
 
 		 403 aa  345  1e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1867  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  53.81 
 
 		 406 aa  342  5e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.960562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1358  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  50.9 
 
 		 403 aa  342  5.999999999999999e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24271  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3365  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  53.76 
 
 		 436 aa  340  2.9999999999999998e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.139638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4241  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  52.17 
 
 		 396 aa  330  3e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.122316 
 
 
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NC_007517  Gmet_1682  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.04 
 
 		 414 aa  238  9e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0153282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3518  MFS permease  38.27 
 
 		 401 aa  235  1.0000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010501  PputW619_4575  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.39 
 
 		 393 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180506  normal  0.0143089 
 
 
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NC_013216  Dtox_1599  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  40.26 
 
 		 384 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007005  Psyr_0657  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.23 
 
 		 398 aa  225  1e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.327939  normal  1 
 
 
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NC_009656  PSPA7_1571  MFS family transporter  38.93 
 
 		 392 aa  225  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_18090  major facilitator subfamily transporter protein  38.93 
 
 		 392 aa  225  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012917  PC1_1452  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.95 
 
 		 418 aa  224  2e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.266521  n/a   
 
 
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NC_004578  PSPTO_0753  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  34.97 
 
 		 398 aa  223  4e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.363927  n/a   
 
 
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NC_009484  Acry_0848  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.74 
 
 		 404 aa  223  4e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007492  Pfl01_0664  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.49 
 
 		 401 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013159  Svir_13380  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  39.29 
 
 		 424 aa  220  3.9999999999999997e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.223533  normal  1 
 
 
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NC_009719  Plav_0571  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.42 
 
 		 399 aa  220  3.9999999999999997e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0910669  normal  1 
 
 
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NC_013739  Cwoe_3301  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  42.28 
 
 		 403 aa  218  1e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_002939  GSU0264  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.63 
 
 		 411 aa  218  2e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013730  Slin_4137  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  37.08 
 
 		 409 aa  217  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0321092  normal  0.661568 
 
 
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NC_012856  Rpic12D_1975  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  36.62 
 
 		 394 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010465  YPK_2792  bicyclomycin/multidrug efflux system  33.85 
 
 		 401 aa  214  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010682  Rpic_2375  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  36.1 
 
 		 394 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.525477 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3562  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  38.59 
 
 		 392 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
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NC_002947  PP_0589  Bcr/CflA family multidrug resistance transporter  36.13 
 
 		 393 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009512  Pput_0628  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.13 
 
 		 393 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00837231  normal  0.960264 
 
 
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NC_013131  Caci_8150  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  37.62 
 
 		 412 aa  213  4.9999999999999996e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_003295  RSc2172  drug transport transmembrane protein  34.9 
 
 		 407 aa  212  7.999999999999999e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309598  normal  1 
 
 
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NC_009832  Spro_3251  bicyclomycin/multidrug efflux system  34.93 
 
 		 402 aa  212  7.999999999999999e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.303475 
 
 
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NC_010322  PputGB1_0634  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.13 
 
 		 393 aa  212  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000940614 
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_2717  bicyclomycin/multidrug efflux system  35.9 
 
 		 399 aa  212  7.999999999999999e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0392308  n/a   
 
 
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NC_013037  Dfer_3081  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.7 
 
 		 409 aa  211  2e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.707115 
 
 
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NC_010159  YpAngola_A1491  bicyclomycin/multidrug efflux system  34.14 
 
 		 399 aa  210  3e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.646257  normal  1 
 
 
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NC_014151  Cfla_1045  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  38.31 
 
 		 461 aa  209  5e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008609  Ppro_0843  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.85 
 
 		 424 aa  209  5e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007974  Rmet_4752  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily  36.39 
 
 		 426 aa  209  7e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.685858  normal  0.328295 
 
 
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NC_008599  CFF8240_0011  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.49 
 
 		 400 aa  209  8e-53  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.461677  n/a   
 
 
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NC_007348  Reut_B4036  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  40.82 
 
 		 406 aa  208  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009832  Spro_1190  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  40 
 
 		 396 aa  207  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013421  Pecwa_1841  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.16 
 
 		 418 aa  208  2e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013730  Slin_3348  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  37.17 
 
 		 411 aa  207  3e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.241483 
 
 
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NC_014158  Tpau_1659  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  37.77 
 
 		 398 aa  207  4e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_5989  sugar (and other) transporter  39.63 
 
 		 411 aa  207  4e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.291494  normal  0.241739 
 
 
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NC_012880  Dd703_2351  bicyclomycin/multidrug efflux system  34.46 
 
 		 398 aa  206  5e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012880  Dd703_2514  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  40.37 
 
 		 397 aa  205  1e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007947  Mfla_0749  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.88 
 
 		 498 aa  205  1e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.471391  normal  0.544805 
 
 
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NC_013526  Tter_2346  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  38.21 
 
 		 408 aa  205  1e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011365  Gdia_2049  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.6 
 
 		 435 aa  204  2e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008060  Bcen_0485  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.46 
 
 		 458 aa  203  5e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011312  VSAL_I2019  bicyclomycin/multidrug efflux system  33.59 
 
 		 401 aa  203  5e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
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NC_008542  Bcen2424_0964  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.46 
 
 		 405 aa  203  5e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013521  Sked_25390  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  38.48 
 
 		 414 aa  203  5e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.721605  normal  0.383381 
 
 
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NC_010508  Bcenmc03_0925  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.46 
 
 		 405 aa  202  7e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.805462  normal  1 
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_0167  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.34 
 
 		 398 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014210  Ndas_3614  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  38.86 
 
 		 407 aa  202  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008255  CHU_2159  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.72 
 
 		 410 aa  202  9.999999999999999e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.832459 
 
 
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NC_011772  BCG9842_B5119  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  36.08 
 
 		 416 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009441  Fjoh_2852  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.56 
 
 		 409 aa  200  3e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013205  Aaci_0874  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  38.03 
 
 		 417 aa  200  3.9999999999999996e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1904  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  39.5 
 
 		 425 aa  199  6e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013757  Gobs_3432  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  38.59 
 
 		 438 aa  199  7.999999999999999e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00363219  n/a   
 
 
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NC_010084  Bmul_2434  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.01 
 
 		 405 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.71242  normal  1 
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A4067  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.34 
 
 		 405 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.23672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3892  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.11 
 
 		 412 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0543814  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1854  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.95 
 
 		 412 aa  197  2.0000000000000003e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.888494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1767  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.66 
 
 		 397 aa  198  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.91 
 
 		 405 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2778  bicyclomycin/multidrug efflux system  36.08 
 
 		 398 aa  197  3e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.276165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2220  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.34 
 
 		 430 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0827  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.67 
 
 		 389 aa  196  6e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0437  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.63 
 
 		 398 aa  196  6e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2370  bicyclomycin/multidrug efflux system  35.18 
 
 		 396 aa  196  8.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00149864  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2780  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  37.85 
 
 		 399 aa  195  9e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.118826 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0202  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.57 
 
 		 419 aa  195  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0173  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.82 
 
 		 416 aa  195  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181141  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0824  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.91 
 
 		 434 aa  195  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2458  bicyclomycin/multidrug efflux system  35.18 
 
 		 396 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150098 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2572  bicyclomycin/multidrug efflux system  35.18 
 
 		 396 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348003 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2415  bicyclomycin/multidrug efflux system  35.18 
 
 		 396 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0436595  normal  0.152549 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0202  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  35.57 
 
 		 416 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0183  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.82 
 
 		 416 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000244367  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_0170  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.57 
 
 		 419 aa  194  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000813415  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_0181  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.82 
 
 		 416 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011094  SeSA_A2461  bicyclomycin/multidrug efflux system  35.18 
 
 		 396 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.334321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0226  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  35.57 
 
 		 416 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_5745  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  36.07 
 
 		 417 aa  194  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012560  Avin_10090  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily  37.8 
 
 		 392 aa  194  3e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0442276  n/a   
 
 
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NC_011725  BCB4264_A0206  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  35.57 
 
 		 416 aa  193  5e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.993392  n/a   
 
 
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NC_013421  Pecwa_1911  bicyclomycin/multidrug efflux system  33.59 
 
 		 396 aa  192  7e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009674  Bcer98_0184  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.35 
 
 		 398 aa  192  9e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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