52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4746 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4746  plasmid maintenance system killer  100 
 
 		 90 aa  191  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.675106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2525  plasmid maintenance system killer  76.92 
 
 		 91 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0385554  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1591  plasmid maintenance system killer  59.78 
 
 		 92 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0593652  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0088  plasmid maintenance system killer protein  52.75 
 
 		 91 aa  108  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.167827  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0090  plasmid maintenance system killer  52.75 
 
 		 91 aa  108  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2183  plasmid maintenance system killer  45.65 
 
 		 91 aa  72.4  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.454111  unclonable  0.000000258126 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2890  plasmid maintenance system killer  43.48 
 
 		 92 aa  72.4  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.320919  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0570  plasmid maintenance system killer  44.57 
 
 		 92 aa  72  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2429  plasmid maintenance system killer  42.39 
 
 		 94 aa  72  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.110388  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0438  plasmid maintenance system killer  40.22 
 
 		 92 aa  68.6  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.275617  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1143  proteic killer suppression protein  37.63 
 
 		 93 aa  68.2  0.00000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0404  proteic killer suppression protein  37.63 
 
 		 93 aa  68.2  0.00000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0360  plasmid maintenance system killer  37.63 
 
 		 93 aa  67.8  0.00000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6434  plasmid maintenance system killer  40.22 
 
 		 92 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.281041 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2880  plasmid maintenance system killer  39.78 
 
 		 93 aa  63.5  0.0000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.474042  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1124  plasmid maintenance system killer  43.01 
 
 		 92 aa  62.8  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000991255  normal  0.581141 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2470  plasmid maintenance system killer  41.3 
 
 		 92 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3084  plasmid maintenance system killer  41.3 
 
 		 92 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4450  plasmid maintenance system killer  36.96 
 
 		 92 aa  60.1  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5381  plasmid maintenance system killer  36.96 
 
 		 101 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0821109  hitchhiker  0.0023513 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0273  plasmid maintenance system killer  37.63 
 
 		 95 aa  59.7  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.1826 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3644  plasmid maintenance system killer  42.11 
 
 		 108 aa  57  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.018062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6999  plasmid maintenance system killer  37.23 
 
 		 94 aa  57  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.17446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3242  plasmid maintenance system killer  35.87 
 
 		 92 aa  56.6  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0235263  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1106  plasmid maintenance system killer  35.48 
 
 		 95 aa  56.6  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.458841  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3837  plasmid maintenance system killer  35.87 
 
 		 92 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1061  plasmid maintenance system killer  36.56 
 
 		 93 aa  55.1  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000720973 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2504  plasmid maintenance system killer  36.96 
 
 		 92 aa  54.7  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000281555  normal  0.853623 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3764  plasmid maintenance system killer  40 
 
 		 61 aa  53.9  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1454  plasmid maintenance system killer  36.96 
 
 		 114 aa  50.4  0.000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.046849  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27680  Plasmid maintenance system killer protein  34.41 
 
 		 93 aa  49.7  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2973  plasmid maintenance system killer  31.52 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2895  plasmid maintenance system killer  30.43 
 
 		 92 aa  46.6  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.541001 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1907  plasmid maintenance system killer  33.33 
 
 		 93 aa  46.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000193605  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0534  AAA family ATPase  30.43 
 
 		 112 aa  46.2  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.943308  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03904  plasmid maintenance system killer protein  30.11 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.462774  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0423  proteic killer protein, putative  31.52 
 
 		 92 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0413  plasmid maintenance system killer  30.11 
 
 		 93 aa  45.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1668  plasmid maintenance system killer  30.43 
 
 		 92 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.856327 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2941  plasmid maintenance system killer  27.96 
 
 		 94 aa  44.7  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00442539  hitchhiker  0.00124461 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3069  plasmid maintenance system killer  32.26 
 
 		 93 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1670  plasmid maintenance system killer protein  29.35 
 
 		 105 aa  44.3  0.0006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.137882  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4499  plasmid maintenance system killer  34.07 
 
 		 111 aa  43.9  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.538782 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4147  plasmid maintenance system killer  31.52 
 
 		 92 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.813098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4763  plasmid maintenance system killer  29.35 
 
 		 94 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.561409 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1215  plasmid maintenance system killer  30.11 
 
 		 93 aa  42.7  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2830  plasmid maintenance system killer  31.91 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0714148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4827  plasmid maintenance system killer  31.52 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3069  plasmid maintenance system killer  31.52 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67304  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2694  plasmid maintenance system killer  33.33 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0020  plasmid maintenance system killer  33.33 
 
 		 92 aa  40.8  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184323  normal  0.0200834 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2492  plasmid maintenance system killer  56 
 
 		 25 aa  40.4  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.319608  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>