More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4707 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4707  inositol monophosphatase  100 
 
 		 270 aa  536  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.977346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4111  inositol-1(or 4)-monophosphatase  77.86 
 
 		 271 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1347  inositol monophosphatase  74.53 
 
 		 271 aa  388  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0596677  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1853  inositol-1(or 4)-monophosphatase  76.59 
 
 		 253 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0604801  decreased coverage  0.000548461 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3181  inositol monophosphatase  71.71 
 
 		 271 aa  362  3e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.717976  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2559  inositol monophosphatase  69.8 
 
 		 275 aa  344  8e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.38703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1688  putative inositol monophosphatase family protein  68.31 
 
 		 248 aa  338  7e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.719108 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1485  inositol monophosphatase  52.46 
 
 		 278 aa  231  8.000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.208921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0821  inositol monophosphatase  48.36 
 
 		 272 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.272919 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0855  inositol monophosphatase  47.95 
 
 		 272 aa  224  1e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0786662  normal  0.150631 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0895  inositol monophosphatase  47.54 
 
 		 272 aa  223  3e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.632992 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0630  inositol-phosphate phosphatase  47.76 
 
 		 268 aa  214  9.999999999999999e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0361  inositol monophosphatase  46.85 
 
 		 270 aa  203  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186566  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5380  inositol monophosphatase  44.62 
 
 		 271 aa  203  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.297931 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2248  inositol monophosphatase  45.67 
 
 		 270 aa  199  5e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.041874  normal  0.100685 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0915  inositol monophosphatase  45.87 
 
 		 273 aa  194  9e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.208619 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0530  inositol monophosphatase  43.53 
 
 		 269 aa  187  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.428745 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0070  inositol monophosphatase  42.86 
 
 		 273 aa  183  3e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.207628 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0486  inositol monophosphatase  42.02 
 
 		 269 aa  179  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0479273 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0422  inositol monophosphatase  39.76 
 
 		 272 aa  172  5e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0902  inositol monophosphatase family protein  44.26 
 
 		 270 aa  166  5e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4535  inositol-phosphate phosphatase  39.37 
 
 		 261 aa  164  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.196766 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0435  inositol monophosphatase  40.23 
 
 		 264 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3043  inositol monophosphatase  37.35 
 
 		 265 aa  160  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2640  inositol monophosphatase  36.76 
 
 		 266 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.727914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0192  inositol monophosphatase family protein  34.65 
 
 		 269 aa  150  3e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0212  inositol monophosphatase family protein  36.02 
 
 		 254 aa  145  6e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0063  inositol-phosphate phosphatase  35.25 
 
 		 264 aa  144  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.695366  hitchhiker  0.0000489388 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0917  inositol monophosphatase  37.69 
 
 		 258 aa  142  7e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.018726  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0568  inositol monophosphatase  35.52 
 
 		 263 aa  141  9e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.437406 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3283  inositol monophosphatase  35.84 
 
 		 274 aa  140  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3171  inositol monophosphatase  35.57 
 
 		 258 aa  139  3e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2576  inositol monophosphatase  36.92 
 
 		 258 aa  137  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.635906 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2360  inositol monophosphatase  40.74 
 
 		 259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3002  inositol-phosphate phosphatase  36.33 
 
 		 258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.867462  normal  0.136891 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0024  inositol monophosphatase  31.09 
 
 		 271 aa  130  3e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0795  inositol monophosphatase  35.8 
 
 		 402 aa  127  2.0000000000000002e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2688  inositol monophosphatase  36.63 
 
 		 273 aa  123  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0402  inositol-1(or 4)-monophosphatase  33.62 
 
 		 260 aa  122  5e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.126302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0186  inositol-phosphate phosphatase  33.06 
 
 		 257 aa  115  7.999999999999999e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1912  inositol monophosphatase  28.36 
 
 		 284 aa  115  7.999999999999999e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00612  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  31.33 
 
 		 275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2288  inositol monophosphatase  34.09 
 
 		 265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.690009  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001881  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  31.33 
 
 		 275 aa  109  4.0000000000000004e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4717  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  32.56 
 
 		 270 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.957777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1058  inositol monophosphatase  31.2 
 
 		 281 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000501091 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1199  inositol-phosphate phosphatase  32.64 
 
 		 264 aa  106  4e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.339227 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0646  3(2),5 -bisphosphate nucleotidase  30.49 
 
 		 251 aa  106  4e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0170  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  32.2 
 
 		 270 aa  106  5e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0125589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0170  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  32.2 
 
 		 270 aa  105  6e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2303  inositol monophosphatase  30.57 
 
 		 293 aa  105  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000171915 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0165  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  32.2 
 
 		 270 aa  105  7e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.462598 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03972  3-Phosphoadenosine 5-phosphosulfate (PAPS) 3-phosphatase  29.46 
 
 		 281 aa  105  9e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00312866  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0225  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  34.43 
 
 		 269 aa  104  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.453654  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1396  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  33.2 
 
 		 256 aa  104  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0294905  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2983  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  33.06 
 
 		 272 aa  103  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0157  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  32.86 
 
 		 269 aa  103  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00114057  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3950  inositol monophosphatase  34.48 
 
 		 570 aa  103  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.176149  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0191  cysQ protein  33.02 
 
 		 270 aa  103  4e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0898  Inositol-phosphate phosphatase  27.97 
 
 		 265 aa  103  4e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000281614  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0118  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  31.84 
 
 		 269 aa  102  5e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2295  cysQ protein  30.12 
 
 		 275 aa  102  6e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13641  CysQ  27.43 
 
 		 302 aa  102  6e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0137  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  29.03 
 
 		 278 aa  102  6e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0130  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  32.13 
 
 		 270 aa  102  7e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.835537 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0717  inositol monophosphatase family protein  32.24 
 
 		 266 aa  101  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1985  inositol monophosphatase  28.81 
 
 		 290 aa  101  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.838762 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0673  inositol monophosphatase family protein  32.38 
 
 		 266 aa  101  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4086  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  32.73 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2471  inositol monophosphatase  30.99 
 
 		 261 aa  101  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3548  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  33.18 
 
 		 270 aa  101  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3674  inositol monophosphatase  29.74 
 
 		 292 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2912  protein CysQ  30.71 
 
 		 272 aa  100  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4187  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  32.73 
 
 		 270 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0712  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  28.4 
 
 		 271 aa  100  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3728  inositol monophosphatase  29.74 
 
 		 292 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.275945  normal  0.190022 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0172  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  32.73 
 
 		 270 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.126779 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1466  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  28.4 
 
 		 271 aa  100  3e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2153  inositol-phosphate phosphatase  32.93 
 
 		 267 aa  100  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.38913  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1698  inositol monophosphatase  33.07 
 
 		 261 aa  99.8  4e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.133457  normal  0.97401 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0173  3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate (PAPS) 3'-phosphatase-like  30.97 
 
 		 289 aa  99.8  5e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.82997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0168  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  32.27 
 
 		 270 aa  99.8  5e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1547  protein CysQ  33.79 
 
 		 262 aa  99.4  6e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.286101  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2932  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  34.05 
 
 		 276 aa  99.4  6e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2321  inositol monophosphatase  30.53 
 
 		 267 aa  99  8e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000655872  normal  0.931835 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2060  inositol-1(or 4)-monophosphatase  34.5 
 
 		 282 aa  98.6  9e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1815  inositol-phosphate phosphatase  33.33 
 
 		 267 aa  98.6  9e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00063204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2419  3(2),5 -bisphosphate nucleotidase  32.05 
 
 		 284 aa  97.8  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01351  inositol-1-monophosphatase  31.97 
 
 		 255 aa  97.8  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.104947  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0525  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  33.33 
 
 		 273 aa  98.2  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1735  inositol-phosphate phosphatase  33.33 
 
 		 267 aa  98.2  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000203014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2284  inositol monophosphatase  33.33 
 
 		 267 aa  98.2  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00357051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1772  inositol-phosphate phosphatase  30.08 
 
 		 283 aa  98.6  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.32038  hitchhiker  0.00184964 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1289  extragenic suppressor protein SuhB  32.47 
 
 		 267 aa  97.8  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077456  normal  0.0155379 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1957  Inositol-phosphate phosphatase  32.53 
 
 		 267 aa  97.4  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000619286  normal  0.0182477 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2390  inositol-phosphate phosphatase  32.53 
 
 		 267 aa  97.4  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000252035  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2401  inositol-phosphate phosphatase  32.53 
 
 		 267 aa  97.4  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0002318  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2506  inositol-phosphate phosphatase  32.53 
 
 		 267 aa  97.4  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.024533  normal  0.0296693 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1028  inositol monophosphatase  31.88 
 
 		 269 aa  97.8  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00157763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1174  inositol-phosphate phosphatase  28.99 
 
 		 254 aa  96.7  3e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>