122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4688 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4688  nuclease (SNase-like)  100 
 
 		 241 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0782  nuclease (SNase-like)  72.77 
 
 		 242 aa  362  2e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4628  SNase-like nuclease  73.21 
 
 		 242 aa  361  6e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0545  putative nuclease-like protein  75.45 
 
 		 241 aa  360  1e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0379373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0859  nuclease (SNase domain protein)  70.35 
 
 		 243 aa  335  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2576  nuclease (SNase domain protein)  49.78 
 
 		 358 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.901293  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0317  nuclease (SNase domain protein)  37.5 
 
 		 227 aa  152  7e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183306  normal  0.136686 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0111  nuclease  37.08 
 
 		 227 aa  148  8e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0065  nuclease  36.12 
 
 		 227 aa  141  9e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5043  nuclease (SNase domain protein)  35 
 
 		 249 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2309  nuclease  35.22 
 
 		 214 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1554  nuclease (SNase-like)  44.85 
 
 		 202 aa  112  6e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0857  nuclease  33.49 
 
 		 214 aa  109  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2185  nuclease (SNase-like)  33.03 
 
 		 226 aa  106  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0576  Excalibur domain protein  40.37 
 
 		 212 aa  106  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000012089  unclonable  0.00000255125 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6820  nuclease (SNase domain protein)  32.05 
 
 		 226 aa  105  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0330594  normal  0.398913 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2752  hypothetical protein  31.82 
 
 		 263 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2244  nuclease  41.26 
 
 		 534 aa  103  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000544674  normal  0.0168792 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3956  nuclease (SNase-like)  37.66 
 
 		 171 aa  101  9e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0594  Excalibur domain-containing protein  35.88 
 
 		 211 aa  101  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.187659 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0424  nuclease (SNase-like)  32.13 
 
 		 250 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.445506  normal  0.365939 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3744  nuclease  37.14 
 
 		 161 aa  99.4  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1032  SNase-like nuclease  32.66 
 
 		 246 aa  98.2  9e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1591  nuclease (SNase-like)  39.24 
 
 		 158 aa  98.2  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1131  nuclease (SNase-like)  32.11 
 
 		 246 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.844533  normal  0.680053 
 
 
-
 
NC_004310  BR0870  nuclease domain-containing protein  40.77 
 
 		 189 aa  97.1  3e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0862  nuclease domain-containing protein  40.77 
 
 		 189 aa  97.1  3e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2193  nuclease  35.66 
 
 		 177 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2156  nuclease (SNase domain protein)  34.9 
 
 		 177 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2471  nuclease (SNase domain protein)  35.66 
 
 		 177 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0134  Excalibur  31.05 
 
 		 220 aa  92.4  5e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.194412  normal  0.895355 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5017  nuclease  37.41 
 
 		 167 aa  92.8  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.177044 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1969  nuclease (SNase-like)  36.5 
 
 		 172 aa  91.7  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1599  nuclease  33.75 
 
 		 195 aa  91.3  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.798842  normal  0.295978 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2357  nuclease  31.41 
 
 		 221 aa  91.3  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0848  nuclease-like protein  31.82 
 
 		 184 aa  85.5  6e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0898613  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2315  nuclease (SNase domain protein)  37.18 
 
 		 185 aa  84.7  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5373  putative nuclease-like protein  38.35 
 
 		 176 aa  84.3  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0199446 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4597  nuclease (SNase domain protein)  34.29 
 
 		 208 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0232149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4153  nuclease (SNase domain protein)  36.13 
 
 		 166 aa  84  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.574783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4484  nuclease (SNase domain protein)  34.29 
 
 		 211 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.270396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4116  nuclease  34.29 
 
 		 209 aa  78.6  0.00000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.373469  normal  0.63366 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3323  nuclease  35.21 
 
 		 163 aa  74.7  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.763522 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2100  nuclease (SNase-like)  39.69 
 
 		 192 aa  73.2  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1730  nuclease  36.73 
 
 		 175 aa  71.6  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0510494  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9903  succinoglycan biosynthesis protein  34.18 
 
 		 168 aa  70.9  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  31.55 
 
 		 164 aa  67.8  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2078  nuclease (SNase domain protein)  41.94 
 
 		 185 aa  67.4  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  28.57 
 
 		 175 aa  67  0.0000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  28.57 
 
 		 175 aa  66.6  0.0000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  32.26 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  27.95 
 
 		 175 aa  65.9  0.0000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0693  thermonuclease family protein  33.05 
 
 		 199 aa  64.3  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.739462  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2052  succinoglycan biosynthesis protein  33.07 
 
 		 171 aa  63.5  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132309  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4183  nuclease (SNase-like)  28.96 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.283514  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15970  micrococcal nuclease-like nuclease  25 
 
 		 388 aa  62  0.000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.339667  normal  0.0582928 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  27.16 
 
 		 153 aa  62  0.000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  28.87 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2340  nuclease (SNase domain protein)  30.59 
 
 		 162 aa  58.2  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  29.32 
 
 		 174 aa  57.4  0.0000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03631  hypothetical protein  27.33 
 
 		 155 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  29.05 
 
 		 180 aa  56.6  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0217  hypothetical protein  28.45 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.530241  normal  0.176582 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2932  nuclease  23.36 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000967854  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0480  nuclease  33.88 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.898976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2003  nuclease (SNase-like)  28.98 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0394  hypothetical protein  50 
 
 		 199 aa  55.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3683  nuclease  32.9 
 
 		 153 aa  54.7  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4029  hypothetical protein  29.25 
 
 		 329 aa  54.3  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  30.77 
 
 		 238 aa  54.7  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1306  nuclease (SNase-like)  30.25 
 
 		 175 aa  53.9  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0742  putative lipoprotein  32.94 
 
 		 319 aa  53.9  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3848  nuclease  31.9 
 
 		 186 aa  54.3  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  29.33 
 
 		 206 aa  52.4  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2501  nuclease  28.21 
 
 		 205 aa  52.4  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.080015  normal  0.0413796 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2144  nuclease (SNase-like)  32.87 
 
 		 162 aa  51.2  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.149778  normal  0.293408 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1898  hypothetical protein  50.94 
 
 		 214 aa  51.6  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0131013  normal  0.0107915 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  26.67 
 
 		 232 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0779  nuclease (SNase domain protein)  26.75 
 
 		 169 aa  51.2  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0791  hypothetical protein  31.76 
 
 		 319 aa  50.4  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6085  nuclease  33.33 
 
 		 158 aa  50.4  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  27.98 
 
 		 179 aa  50.8  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1886  nuclease  26.77 
 
 		 192 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0247855 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0188  hypothetical protein  25.86 
 
 		 238 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1359  nuclease (SNase domain protein)  27.56 
 
 		 191 aa  50.8  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104697  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2942  prophage MuMc02, nuclease, putative  29.8 
 
 		 216 aa  50.4  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375298  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5258  nuclease  29.94 
 
 		 170 aa  50.4  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.486577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6411  nuclease  29.75 
 
 		 233 aa  50.4  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0873  nuclease (SNase-like)  30.77 
 
 		 178 aa  50.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4568  nuclease  27.95 
 
 		 229 aa  49.7  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.313094  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0193  nuclease  32.17 
 
 		 182 aa  49.7  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3662  nuclease (SNase domain protein)  31.29 
 
 		 175 aa  49.7  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.808999  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  30.22 
 
 		 169 aa  49.3  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2364  nuclease (SNase domain protein)  29.58 
 
 		 171 aa  48.9  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000986149  hitchhiker  0.0000256205 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1464  micrococcal nuclease  31.08 
 
 		 150 aa  48.9  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.895174  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4452  hypothetical protein  33.01 
 
 		 194 aa  48.9  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25810  nuclease  30.71 
 
 		 169 aa  47.8  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.823432  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1653  hypothetical protein  23.84 
 
 		 170 aa  47.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164251  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0791  nuclease (SNase-like)  32.99 
 
 		 169 aa  47.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2313  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.92 
 
 		 406 aa  46.6  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>