249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4666 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4666  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 200 aa  393  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.243183 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4918  TetR family transcriptional regulator  60.11 
 
 		 193 aa  211  7e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3662  TetR family transcriptional regulator  47.67 
 
 		 191 aa  155  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0297  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 203 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0512572 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0982  TetR family transcriptional regulator  38.12 
 
 		 194 aa  100  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2249  TetR family transcriptional regulator  38.15 
 
 		 227 aa  79.3  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.111246  normal  0.0445772 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0641  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.109704  normal  0.126118 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4463  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 198 aa  72  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5773  transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 		 212 aa  71.2  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5561  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 196 aa  70.1  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1862  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 213 aa  69.7  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.349014  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0459  TetR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 193 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0472  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 193 aa  68.6  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.957077  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0483  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 193 aa  68.6  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9138  putative transcriptional regulator, TetR family  30.17 
 
 		 217 aa  68.2  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3581  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 200 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.919672  normal  0.194712 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2830  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 187 aa  65.9  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.082996  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4395  transcriptional regulator, TetR family  31.85 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0253  TetR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 208 aa  64.7  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.920099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2959  TetR family transcriptional regulator  53.45 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.878802  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1562  putative transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 194 aa  64.3  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.196181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3003  TetR family transcriptional regulator  53.45 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.384269 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1085  TetR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 187 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.973817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2974  TetR family transcriptional regulator  53.45 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.021189 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1058  TetR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1074  TetR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220175  normal  0.111345 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2723  regulatory protein TetR  30.26 
 
 		 198 aa  62  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.769324  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6563  putative transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 		 186 aa  61.6  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0113679 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  33.14 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1232  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1714  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.058675  normal  0.0438262 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1637  transcriptional regulator, TetR family  33.55 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.890844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2506  transcriptional regulator, TetR family  26.18 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.368527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3937  TetR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  46.55 
 
 		 207 aa  57  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0416  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 228 aa  57  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24490  transcriptional regulator  32.32 
 
 		 213 aa  54.3  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3404  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 198 aa  54.3  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.64747  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3408  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 205 aa  53.9  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.954504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6679  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 209 aa  52  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.874837  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2395  transcriptional regulator, TetR family  43.42 
 
 		 205 aa  52  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.431985  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4571  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 199 aa  51.6  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2588  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 185 aa  51.6  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 219 aa  51.2  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05760  Transcriptional regulatory protein, TetR family  35.63 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.466087  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0576  transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0873  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 186 aa  50.4  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5705  transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1366  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 235 aa  50.4  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0482522  normal  0.0728361 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8807  putative transcriptional regulator, TetR family  36.78 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2904  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 213 aa  49.7  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5487  transcriptional regulator, TetR family  26.49 
 
 		 205 aa  48.9  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33680  transcriptional regulator  40.85 
 
 		 200 aa  49.3  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.737103  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0252  transcriptional regulator, TetR family  32.29 
 
 		 194 aa  49.3  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3926  TetR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 258 aa  48.9  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6912  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 236 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.830717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1394  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 214 aa  48.9  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3630  transcriptional regulator, TetR family  27.68 
 
 		 203 aa  48.9  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0042  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 219 aa  48.9  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664551  normal  0.814156 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 238 aa  48.1  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3200  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 237 aa  48.5  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3694  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 222 aa  48.1  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1681  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 198 aa  47.8  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1790  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 220 aa  47.4  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.536923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5953  TetR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0308427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1617  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 202 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0133761 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5709  TetR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.92684  normal  0.162375 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1419  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 232 aa  47.4  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0560  transcriptional regulator, TetR family  48.84 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3093  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0252517 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0225  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 240 aa  47.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3927  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 208 aa  47.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.375374  normal  0.0268365 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4925  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 228 aa  46.6  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.791426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1864  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 204 aa  46.6  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.370614  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28140  transcriptional regulator  30.49 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2158  transcriptional regulator, TetR family  37.35 
 
 		 244 aa  46.2  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5533  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 219 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.445482  normal  0.987341 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3617  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 219 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5785  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 219 aa  46.6  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.558716 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5198  transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 		 193 aa  46.2  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4750  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 219 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0204514 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0477  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 202 aa  46.6  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 192 aa  45.8  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1000  TetR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 204 aa  45.8  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 204 aa  45.8  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3412  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 206 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.430092  normal  0.661157 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0260  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 234 aa  45.8  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4245  regulatory protein, TetR  32.2 
 
 		 221 aa  45.8  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2917  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 218 aa  45.8  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1153  transcriptional regulator, TetR family  49.02 
 
 		 246 aa  46.2  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.181492  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0162  transcription regulator protein  38.6 
 
 		 233 aa  45.4  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.1146  normal  0.445023 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0666  transcriptional regulator  39.66 
 
 		 205 aa  45.4  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1087  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 222 aa  45.4  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00014413  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0351  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 230 aa  45.4  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2834  transcriptional regulator, TetR family  38.6 
 
 		 233 aa  45.4  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.170846  normal  0.770206 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  34.19 
 
 		 220 aa  45.1  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6533  TetR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 205 aa  45.1  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1512  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 233 aa  45.4  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>