More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4509 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007925  RPC_4509  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
1022 aa  2068    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0775662 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  36.59 
 
 
1763 aa  313  1e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.27 
 
 
1768 aa  306  1.0000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.29 
 
 
1767 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.83 
 
 
1765 aa  305  4.0000000000000003e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.73 
 
 
1767 aa  303  1e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.08 
 
 
1767 aa  301  5e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.53 
 
 
1771 aa  300  7e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0870  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.1 
 
 
1786 aa  299  2e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.65 
 
 
1782 aa  296  9e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3505  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.47 
 
 
1784 aa  295  4e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  34.41 
 
 
1765 aa  295  4e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.56 
 
 
1266 aa  293  1e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  31.21 
 
 
1014 aa  293  2e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3920  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  37.24 
 
 
758 aa  291  4e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0617  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.99 
 
 
1398 aa  290  8e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.536457  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.79 
 
 
1326 aa  288  4e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02943  two-component system sensor protein  34.41 
 
 
727 aa  286  2.0000000000000002e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00726909  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.58 
 
 
916 aa  286  2.0000000000000002e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1949  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.24 
 
 
1397 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.539898  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0979  sensor histidine kinase  32.43 
 
 
1574 aa  285  3.0000000000000004e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00449169 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.7 
 
 
1310 aa  284  6.000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2694  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.15 
 
 
1118 aa  281  3e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1768  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.86 
 
 
1033 aa  281  5e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.046039  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0092  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.74 
 
 
1313 aa  280  8e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.783031 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0903  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.17 
 
 
977 aa  279  2e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.393558  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.38 
 
 
1333 aa  279  3e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000202305 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.38 
 
 
921 aa  278  3e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0316  response regulator, histidine kinase  32.8 
 
 
891 aa  276  1.0000000000000001e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.304506  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  35.4 
 
 
1177 aa  276  2.0000000000000002e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2554  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.7 
 
 
876 aa  276  2.0000000000000002e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00476673 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34990  integral membrane hybrid histidine protein kinase  33.33 
 
 
914 aa  276  2.0000000000000002e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.97 
 
 
816 aa  276  2.0000000000000002e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1392  PAS sensor protein  33.49 
 
 
977 aa  275  3e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.802774  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1096  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.68 
 
 
1548 aa  275  3e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.363033 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2520  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.59 
 
 
929 aa  274  5.000000000000001e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.314221  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.04 
 
 
1284 aa  275  5.000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.25 
 
 
1267 aa  274  5.000000000000001e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50630  Periplasmic hybrid histidine protein kinase, two-component  35.13 
 
 
1030 aa  274  5.000000000000001e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.366718  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2946  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.5 
 
 
1303 aa  274  6e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3120  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  33.61 
 
 
1653 aa  273  9e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2787  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.85 
 
 
909 aa  273  1e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0319908  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0678  ammonium transporter  29.3 
 
 
1322 aa  273  1e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760367  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.58 
 
 
1611 aa  273  1e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0008  PAS  33.4 
 
 
1439 aa  272  2e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.130257  normal  0.0574671 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4029  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.7 
 
 
835 aa  272  2e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.15703 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3158  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.99 
 
 
1131 aa  272  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0979379 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  34.15 
 
 
1135 aa  272  2e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2890  peptidase M52, hydrogen uptake protein  34.25 
 
 
1053 aa  272  2.9999999999999997e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  34.13 
 
 
923 aa  271  2.9999999999999997e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0913  PAS sensor protein  34.23 
 
 
2035 aa  271  4e-71  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.271495  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.58 
 
 
1550 aa  271  4e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0747  signal transduction histidine kinase-like protein  32.82 
 
 
1287 aa  271  4e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1850  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.1 
 
 
946 aa  271  5e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0866059  normal  0.191772 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.88 
 
 
929 aa  271  5.9999999999999995e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  35.16 
 
 
1346 aa  270  8e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2958  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.4 
 
 
914 aa  270  1e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0730745  normal  0.010886 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.67 
 
 
1202 aa  269  2e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2892  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.7 
 
 
1126 aa  268  4e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.121173  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002502  BarA sensory histidine kinase  35.2 
 
 
932 aa  268  4e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003637  hypothetical protein  32.64 
 
 
1055 aa  268  5e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1512  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.22 
 
 
1480 aa  268  5e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0878697 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1691  sensor histidine kinase/response regulator GacS  34.73 
 
 
917 aa  268  5.999999999999999e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0413  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.22 
 
 
649 aa  267  5.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.486331 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1769  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.14 
 
 
782 aa  266  1e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.497012  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0290  histidine kinase  34.53 
 
 
931 aa  266  1e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000039083 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4645  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.38 
 
 
948 aa  265  3e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37090  alginate regulatory hybrid histidine protein kinase GacS  34.25 
 
 
905 aa  265  4e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0555684  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0258  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.68 
 
 
1040 aa  265  4.999999999999999e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.119641 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.96 
 
 
1442 aa  265  4.999999999999999e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.52 
 
 
1193 aa  264  6e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3698  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  34.52 
 
 
917 aa  263  1e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.34744  hitchhiker  0.00600076 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3314  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.83 
 
 
1582 aa  263  1e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.660804  hitchhiker  0.0000234203 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0067  signal transduction histidine kinase-like protein protein  33.09 
 
 
1021 aa  263  2e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5275  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.39 
 
 
830 aa  262  2e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.95 
 
 
1165 aa  262  3e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2063  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.13 
 
 
1622 aa  261  3e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2774  histidine kinase  33.58 
 
 
761 aa  262  3e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.622194  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0305  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.74 
 
 
967 aa  261  4e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  unclonable  0.00000133293 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1616  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.49 
 
 
1240 aa  261  4e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98218  normal  0.696471 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1381  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.97 
 
 
1468 aa  261  5.0000000000000005e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.770562  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1596  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.9 
 
 
705 aa  261  5.0000000000000005e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2488  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.26 
 
 
1109 aa  260  9e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.876623  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4016  putative PAS/PAC sensor protein  34.45 
 
 
1626 aa  259  1e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0277  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.14 
 
 
957 aa  259  2e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105373  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2979  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.08 
 
 
1340 aa  259  2e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.698765 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2394  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.08 
 
 
1788 aa  258  3e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0407078 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0829  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.68 
 
 
1240 aa  258  4e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1271  hybrid signal transduction histidine kinase and diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.66 
 
 
1499 aa  258  5e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.422796  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3788  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.09 
 
 
1042 aa  258  6e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4165  sensory box histidine kinase/response regulator  32.22 
 
 
1683 aa  258  6e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.418603  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0602  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.23 
 
 
1057 aa  257  9e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.862038  hitchhiker  0.00157552 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3543  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.19 
 
 
1603 aa  257  1.0000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00143205 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3839  histidine kinase  33.79 
 
 
590 aa  257  1.0000000000000001e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.783031 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.84 
 
 
916 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0675189  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1650  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.35 
 
 
917 aa  256  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.1856 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3612  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.64 
 
 
770 aa  256  2.0000000000000002e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.019984 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0790  hybrid sensory histidine kinase BarA  35.18 
 
 
906 aa  256  2.0000000000000002e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.437862  normal  0.397369 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3070  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.89 
 
 
1166 aa  256  2.0000000000000002e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109625 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3119  Signal transduction histidine kinase-like  32.87 
 
 
861 aa  255  3e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>