188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4393 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4393  PhnA protein  100 
 
 		 72 aa  139  9e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.843392  normal  0.121438 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4218  PhnA protein  84.72 
 
 		 72 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.855897  normal  0.884479 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4323  PhnA protein  81.94 
 
 		 72 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.784258  normal  0.217777 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4993  PhnA protein  79.17 
 
 		 72 aa  111  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1812  PhnA protein  67.61 
 
 		 73 aa  95.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0689852  hitchhiker  0.00415439 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2462  PhnA protein  67.65 
 
 		 70 aa  94.7  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.285508  normal  0.369901 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1710  PhnA protein  67.61 
 
 		 73 aa  94.7  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2936  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  72.46 
 
 		 111 aa  93.2  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.187672  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2006  PhnA protein  66.2 
 
 		 73 aa  92.8  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.166263 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1056  PhnA protein  69.12 
 
 		 71 aa  92  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.582272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01761  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  69.57 
 
 		 111 aa  91.3  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.372611  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6324  PhnA protein  66.15 
 
 		 101 aa  90.9  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.862401  hitchhiker  0.0065391 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1993  PhnA protein  64.18 
 
 		 101 aa  90.5  8e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1104  PhnA protein  64.18 
 
 		 99 aa  90.1  8e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1948  PhnA protein  64.18 
 
 		 101 aa  90.5  8e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.707433  normal  0.146847 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2270  PhnA protein  64.18 
 
 		 101 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.354218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0585  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  65.22 
 
 		 99 aa  88.6  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6481  PhnA protein  61.19 
 
 		 101 aa  87.8  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.82401  normal  0.811468 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0725  PhnA protein  69.12 
 
 		 73 aa  87.8  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5247  alkylphosphonate uptake protein  63.64 
 
 		 131 aa  87.4  6e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7168  PhnA protein  58.57 
 
 		 101 aa  87.4  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.679719  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1463  phnA protein, putative  67.19 
 
 		 69 aa  86.7  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.258363  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2844  PhnA protein  64.29 
 
 		 70 aa  85.1  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.834334  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6145  PhnA protein  64.18 
 
 		 69 aa  83.6  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1830  PhnA protein  57.97 
 
 		 101 aa  82.4  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0790585  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5393  PhnA-like protein  57.97 
 
 		 102 aa  82.4  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.786494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2295  PhnA protein-like protein  60.61 
 
 		 195 aa  80.1  0.000000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0216  PhnA domain-containing protein  62.12 
 
 		 69 aa  80.1  0.000000000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0178  PhnA domain-containing protein  62.12 
 
 		 69 aa  79.7  0.00000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0195  PhnA domain-containing protein  62.12 
 
 		 69 aa  79.3  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0010  conserved hypothetical protein, PhnA family  59.09 
 
 		 69 aa  78.2  0.00000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5170  PhnA-like protein  55.07 
 
 		 102 aa  78.2  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00732124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1109  PhnA protein  56.72 
 
 		 189 aa  75.1  0.0000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2917  phnA family protein  52.24 
 
 		 112 aa  72.8  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2595  phnA family protein  52.24 
 
 		 112 aa  72.8  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2692  PhnA protein  54.55 
 
 		 187 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00739311 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2760  PhnA protein  54.55 
 
 		 187 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2861  PhnA protein  54.55 
 
 		 187 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.118569 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1581  phnA protein  54.55 
 
 		 187 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0801  PhnA protein  51.47 
 
 		 113 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1309  PhnA protein-like  54.55 
 
 		 187 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.569365  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03979  hypothetical protein  53.73 
 
 		 111 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3884  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  53.73 
 
 		 111 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3438  hypothetical protein  51.47 
 
 		 113 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.67162  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1219  hypothetical protein  53.73 
 
 		 111 aa  72  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00756508  normal  0.430256 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03940  hypothetical protein  53.73 
 
 		 111 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0958  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  49.3 
 
 		 112 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0565299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1102  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  49.3 
 
 		 112 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5621  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  53.73 
 
 		 137 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.914109 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2614  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  56.72 
 
 		 134 aa  72  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.689429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4609  hypothetical protein  53.73 
 
 		 111 aa  72  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4573  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  53.73 
 
 		 137 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1091  PhnA protein  53.03 
 
 		 188 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.393322 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4662  hypothetical protein  53.73 
 
 		 111 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4348  hypothetical protein  53.73 
 
 		 111 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3919  hypothetical protein  53.73 
 
 		 111 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2938  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  55.22 
 
 		 113 aa  71.6  0.000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4551  hypothetical protein  52.24 
 
 		 111 aa  71.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0097  hypothetical protein  49.25 
 
 		 113 aa  71.2  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3129  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  52.94 
 
 		 113 aa  71.6  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0570  PhnA protein  52.24 
 
 		 112 aa  71.6  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.595887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4684  hypothetical protein  52.24 
 
 		 111 aa  71.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.550863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1421  PhnA protein  53.03 
 
 		 187 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2184  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  54.41 
 
 		 112 aa  71.2  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1398  PhnA protein  53.03 
 
 		 187 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1382  PhnA protein  53.03 
 
 		 187 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4635  hypothetical protein  52.24 
 
 		 111 aa  71.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4544  hypothetical protein  52.24 
 
 		 111 aa  71.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2956  PhnA protein  53.03 
 
 		 187 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4635  hypothetical protein  52.24 
 
 		 111 aa  71.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.945579 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0582  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  53.73 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1574  putative phosphonoacetate hydrolase PhnA  52.24 
 
 		 189 aa  70.5  0.000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.60114  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0107  putative phnA protein  50.7 
 
 		 189 aa  70.1  0.000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1478  PhnA protein  50.75 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3334  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  55.22 
 
 		 113 aa  69.7  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0976  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  55.22 
 
 		 113 aa  69.7  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0710  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  57.35 
 
 		 115 aa  69.7  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1344  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  54.41 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.204916  normal  0.319142 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1254  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  50 
 
 		 79 aa  68.9  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0192046  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2239  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  47.76 
 
 		 112 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0411  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  47.06 
 
 		 112 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1381  PHNA protein alkylphosphonate uptake  51.52 
 
 		 113 aa  68.2  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6473  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  50.75 
 
 		 113 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.44165  normal  0.219152 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0019  PhnA protein  50 
 
 		 184 aa  68.6  0.00000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0311  hypothetical protein  50.75 
 
 		 111 aa  68.6  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0235836 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2430  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  47.76 
 
 		 112 aa  68.2  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.101708  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2498  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  50 
 
 		 113 aa  68.2  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00301412  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1791  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  48.53 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.758561  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2615  PhnA protein-like protein  53.73 
 
 		 192 aa  67.8  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4249  putative Zn-ribbon-containing protein involved in phosphonate metabolism, PhnA-like protein  48.57 
 
 		 114 aa  67.8  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.435311  normal  0.680592 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2525  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  46.48 
 
 		 112 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0215423 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0089  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  46.27 
 
 		 112 aa  67.4  0.00000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1698  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  46.48 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000832125  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1339  alkylphosphonate uptake protein  43.66 
 
 		 114 aa  67  0.00000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.319385 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0516  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  49.25 
 
 		 113 aa  67  0.00000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1138  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  54.41 
 
 		 92 aa  67  0.00000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.186492 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1818  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  42.03 
 
 		 113 aa  66.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.942108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0240  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  52.86 
 
 		 137 aa  66.6  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0919  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  46.97 
 
 		 112 aa  66.2  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0017  PhnA protein  52.94 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>