More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4338 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_1247  quinolinate synthetase  83.78 
 
 
370 aa  647  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4338  quinolinate synthetase  100 
 
 
370 aa  761  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.230361  normal  0.0900103 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1229  quinolinate synthetase  84.59 
 
 
370 aa  652  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.597439 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1107  quinolinate synthetase  84.05 
 
 
370 aa  650  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0734  quinolinate synthetase complex, A subunit  69.88 
 
 
358 aa  497  1e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0699  quinolinate synthetase  66.01 
 
 
359 aa  489  1e-137  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.363533  normal  0.866465 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1434  quinolinate synthetase  66.87 
 
 
343 aa  467  1e-130  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.582213  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0791  quinolinate synthetase  61.29 
 
 
369 aa  435  1e-121  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00897217 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4308  quinolinate synthetase  62.39 
 
 
365 aa  419  1e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2557  quinolinate synthetase  64.15 
 
 
324 aa  419  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.445713  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4757  quinolinate synthetase  65.8 
 
 
307 aa  415  1e-115  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.774237  normal  0.37432 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2424  quinolinate synthetase  62.38 
 
 
327 aa  415  1e-115  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0623119 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2819  quinolinate synthetase  62.5 
 
 
327 aa  414  1e-114  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.433128  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1183  quinolinate synthetase complex, A subunit  61.83 
 
 
347 aa  402  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.244907  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0295  quinolinate synthetase complex, A subunit  61.77 
 
 
345 aa  404  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.19682 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2250  quinolinate synthetase  58.02 
 
 
351 aa  403  1e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.340783  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5463  quinolinate synthetase complex, A subunit  60.57 
 
 
338 aa  400  1e-110  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222387  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3494  quinolinate synthetase complex, A subunit  60.32 
 
 
343 aa  396  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.499841  normal  0.252503 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2870  quinolinate synthetase complex, A subunit  57.14 
 
 
357 aa  397  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.725936  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0429  quinolinate synthetase  61.08 
 
 
323 aa  395  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2644  quinolinate synthetase complex, A subunit  57.44 
 
 
347 aa  396  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.614387  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2767  quinolinate synthetase complex, A subunit  56.68 
 
 
357 aa  392  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0866463  normal  0.426331 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2215  quinolinate synthetase  63.14 
 
 
323 aa  393  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.224036  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4591  quinolinate synthetase complex, A subunit  60.13 
 
 
333 aa  388  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.316858  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0168  quinolinate synthetase complex, A subunit  59.49 
 
 
333 aa  385  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.243178  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4432  quinolinate synthetase  55.45 
 
 
350 aa  387  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.558643  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7188  quinolinate synthetase  62.74 
 
 
323 aa  383  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.014878 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6033  quinolinate synthetase  62.42 
 
 
323 aa  383  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.452115 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1429  quinolinate synthetase complex, A subunit  58.65 
 
 
328 aa  384  1e-105  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0922  quinolinate synthetase  61.9 
 
 
323 aa  370  1e-101  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.642254  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1045  quinolinate synthetase  61.22 
 
 
323 aa  364  1e-99  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.350076  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1541  quinolinate synthetase complex, A subunit  57.42 
 
 
326 aa  359  5e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.258054  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23170  quinolinate synthetase A  53.12 
 
 
375 aa  346  4e-94  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1004  quinolinate synthetase  51.24 
 
 
343 aa  324  1e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.529282  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0438  quinolinate synthetase  50.62 
 
 
343 aa  320  3e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.172914 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0104  quinolinate synthetase  48.63 
 
 
303 aa  269  5e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1590  quinolinate synthetase  46.76 
 
 
302 aa  260  2e-68  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1338  quinolinate synthetase  47.78 
 
 
302 aa  259  5e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.270834  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0754  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.71 
 
 
298 aa  259  6e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0092  quinolinate synthetase  46.05 
 
 
304 aa  259  7e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.871893  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1474  quinolinate synthetase complex, subunit A  47.44 
 
 
302 aa  258  2e-67  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  1.28992e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1757  quinolinate synthetase complex, A subunit  46.21 
 
 
303 aa  257  2e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.114115  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0785  quinolinate synthetase complex, A subunit  42.62 
 
 
347 aa  256  5e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00620  quinolinate synthetase complex, A subunit  43.77 
 
 
301 aa  254  2e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2119  quinolinate synthetase complex, A subunit  43.94 
 
 
302 aa  248  8e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.825722  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2413  quinolinate synthetase complex, A subunit  42.86 
 
 
308 aa  243  4e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292138  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0013  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.48 
 
 
332 aa  242  6e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3588  quinolinate synthetase  43.06 
 
 
304 aa  241  2e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0815  quinolinate synthetase  42.67 
 
 
325 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.659444  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3544  quinolinate synthetase  46.18 
 
 
304 aa  241  2e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  8.76339e-09  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0787  quinolinate synthetase  42.67 
 
 
325 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3519  quinolinate synthetase  42.71 
 
 
304 aa  239  5e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  1.25089e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3586  quinolinate synthetase  44.95 
 
 
305 aa  238  9e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00023844  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0163  quinolinate synthetase  41.69 
 
 
307 aa  238  2e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.274251  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0001  quinolinate synthetase complex, A subunit  43.58 
 
 
306 aa  237  3e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1600  quinolinate synthetase complex, A subunit  41.61 
 
 
304 aa  236  5e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07511  quinolinate synthetase  41.39 
 
 
304 aa  236  5e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3346  quinolinate synthetase  45.45 
 
 
334 aa  236  6e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.816323  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3480  quinolinate synthetase complex, A subunit  40.68 
 
 
304 aa  236  6e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2356  quinolinate synthetase A  40.82 
 
 
304 aa  236  6e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000244014  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3491  quinolinate synthetase  45.45 
 
 
334 aa  235  8e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0199  quinolinate synthetase  45.3 
 
 
304 aa  235  8e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.96344e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0678  quinolinate synthetase  41.64 
 
 
304 aa  235  9e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.657173  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1145  quinolinate synthetase  45.54 
 
 
326 aa  235  1e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0492282 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4733  quinolinate synthetase complex, A subunit  41.45 
 
 
331 aa  235  1e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.975521  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07331  quinolinate synthetase  41.97 
 
 
304 aa  234  1e-60  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.269483  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0021  quinolinate synthetase  45.36 
 
 
304 aa  235  1e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0447928  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1874  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.16 
 
 
307 aa  234  2e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1865  quinolinate synthetase  43.33 
 
 
304 aa  234  2e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.210788 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2965  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.17 
 
 
348 aa  232  7e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3427  quinolinate synthetase  44.78 
 
 
334 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0105  quinolinate synthetase  42.16 
 
 
322 aa  231  1e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3085  quinolinate synthetase  45.57 
 
 
337 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3128  quinolinate synthetase  45.57 
 
 
337 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.860453 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3068  quinolinate synthetase  45.57 
 
 
337 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.736779  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1548  quinolinate synthetase complex, A subunit  42.52 
 
 
317 aa  230  2e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0742  quinolinate synthetase complex, A subunit  40.8 
 
 
334 aa  230  3e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0225103 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07311  quinolinate synthetase  41.31 
 
 
304 aa  230  3e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.708071  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0424  quinolinate synthetase complex, A subunit  43.25 
 
 
324 aa  230  3e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0685168  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1456  quinolinate synthetase  40.4 
 
 
310 aa  229  5e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.129815 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0112  quinolinate synthetase  40.13 
 
 
328 aa  229  6e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0390837  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2202  quinolinate synthetase  42.91 
 
 
330 aa  229  6e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.189573  normal  0.759966 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1680  quinolinate synthetase  43.1 
 
 
306 aa  229  7e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.100379  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15631  quinolinate synthetase  40.13 
 
 
333 aa  228  9e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.798596 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0314  quinolinate synthetase  41.05 
 
 
323 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.104012 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10830  quinolinate synthetase  44.55 
 
 
335 aa  227  2e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.324254  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3573  quinolinate synthetase  43.84 
 
 
304 aa  228  2e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5221  quinolinate synthetase complex, A subunit  42.72 
 
 
338 aa  228  2e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.590266  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1727  quinolinate synthetase  42.71 
 
 
306 aa  228  2e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.08382e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07381  quinolinate synthetase  39.8 
 
 
328 aa  226  4e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0067481 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2010  quinolinate synthetase complex, A subunit  43.35 
 
 
349 aa  226  4e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.701511  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0419  quinolinate synthetase complex, A subunit  34.32 
 
 
344 aa  225  9e-58  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.748276  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1212  quinolinate synthetase complex, A subunit  38.44 
 
 
303 aa  225  1e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.416438  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1772  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.23 
 
 
323 aa  224  1e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  8.30693e-06  normal  0.199956 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0361  quinolinate synthetase complex, A subunit  42.91 
 
 
295 aa  225  1e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4593  quinolinate synthetase complex, A subunit  42.77 
 
 
346 aa  224  2e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0283  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0575  quinolinate synthetase  45.39 
 
 
332 aa  224  2e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.120653  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1991  quinolinate synthetase  41.72 
 
 
324 aa  224  2e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0121  quinolinate synthetase complex, A subunit  42.76 
 
 
303 aa  224  2e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.65603  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0394  quinolinate synthetase complex, A subunit  43.51 
 
 
332 aa  223  4e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0429667  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>