More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4318 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4318  modD protein  100 
 
 		 287 aa  555  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0022213  normal  0.0469871 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1188  modD protein  75.64 
 
 		 291 aa  371  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1056  modD protein  76 
 
 		 282 aa  360  2e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1194  modD protein  76.09 
 
 		 280 aa  352  4e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5866  molybdenum transport component,pyrophosphorylase ModD  70.42 
 
 		 291 aa  318  7e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.509038 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0279  modD protein  56.83 
 
 		 286 aa  288  6e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4317  hypothetical protein  53.33 
 
 		 280 aa  260  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.922994 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1475  putative molybdenum utilization protein ModD  54.58 
 
 		 281 aa  251  9.000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4167  modD protein  57.74 
 
 		 277 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00277005  normal  0.105526 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3873  quinolinate phosphoribosyl transferase/putativemolybdenum utilization protein ModD  57.89 
 
 		 277 aa  233  3e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.124116  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2039  modD protein  52.17 
 
 		 279 aa  232  5e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.197629  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2963  modD protein  46.55 
 
 		 283 aa  231  8.000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0448  modD protein  44.73 
 
 		 334 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1551  modD protein  50.55 
 
 		 293 aa  224  1e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.593391  normal  0.205266 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0412  putative molybdenum utilization protein ModD  43.66 
 
 		 282 aa  223  3e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.783583  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0148  modD protein  50.91 
 
 		 280 aa  221  8e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.42259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0375  modD protein  44.16 
 
 		 281 aa  218  7e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0455  modD protein  42.86 
 
 		 281 aa  218  1e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4264  modD protein  40.73 
 
 		 281 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.975922 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1543  putative molybdenum utilization protein ModD  49.81 
 
 		 286 aa  207  2e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.107574  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1707  putative molybdenum utilization protein ModD  41.82 
 
 		 285 aa  204  2e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.36441 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0476  modD protein  43.59 
 
 		 284 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1726  modD protein  43.53 
 
 		 290 aa  199  3e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.27933  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0544  modD protein  32.51 
 
 		 283 aa  185  7e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.537412  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1260  modD protein  41.28 
 
 		 284 aa  185  7e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.649684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0251  molybdenum transport protein ModD  38.55 
 
 		 282 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2229  modD protein  35.02 
 
 		 285 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2028  modD protein  38.63 
 
 		 298 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.33908  normal  0.318387 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1544  pyrophosphorylase, putative  40.93 
 
 		 284 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0908  modD protein  38.2 
 
 		 270 aa  183  3e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.830488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1193  modD protein  37.63 
 
 		 283 aa  183  3e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.17865 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1540  putative molybdenum utilization protein ModD  35.21 
 
 		 288 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3263  modD protein  34.66 
 
 		 281 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000266277  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13700  putative molybdenum utilization protein ModD  37.64 
 
 		 279 aa  176  4e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3533  modD protein  54.21 
 
 		 280 aa  176  5e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336903  normal  0.0489002 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0376  modD protein  32.48 
 
 		 283 aa  169  4e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0949  modD protein  33.94 
 
 		 279 aa  169  5e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000429339  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0809  modD protein  34.07 
 
 		 272 aa  167  1e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1951  molybdenum transport protein ModD  35.74 
 
 		 284 aa  167  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0448433 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2224  modD protein  40.43 
 
 		 280 aa  167  2e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.197416 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1536  modD protein  33.58 
 
 		 283 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.515796  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0060  modD protein  40.58 
 
 		 272 aa  166  5e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.747163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1092  modD protein  32.85 
 
 		 283 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0979  modD protein  41.37 
 
 		 272 aa  159  3e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.918465  normal  0.0845492 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0259  nicotinate-nucleotide diphosphorylase (carboxylating)  31.39 
 
 		 263 aa  144  2e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1392  ModD protein  32.13 
 
 		 277 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0320  molybdenum transport system protein ModD  29.81 
 
 		 279 aa  138  7.999999999999999e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1375  ModD protein  31.46 
 
 		 280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1163  quinolinate phosphoribosyl transferase  41.85 
 
 		 296 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.465501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2501  hypothetical protein  41.85 
 
 		 279 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0224  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.67 
 
 		 285 aa  117  9.999999999999999e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0241  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  33.08 
 
 		 272 aa  115  8.999999999999998e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1867  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  30.98 
 
 		 275 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.284093 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0821  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  33.73 
 
 		 286 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.182018  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1304  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase (carboxylating)  28.15 
 
 		 263 aa  106  5e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.424331 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2135  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  33.58 
 
 		 279 aa  103  3e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1549  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30.43 
 
 		 287 aa  98.6  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1682  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  26.95 
 
 		 274 aa  98.6  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000108714  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27531  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase:quinolinate phosphoriobsyl transferase  31.83 
 
 		 297 aa  96.7  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1728  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.5 
 
 		 278 aa  94.7  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1663  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30.98 
 
 		 275 aa  94.4  2e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.103144  unclonable  0.000000000000154791 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0378  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  26.94 
 
 		 279 aa  93.6  4e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3559  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  33.59 
 
 		 291 aa  93.2  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00528415  normal  0.118693 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0384  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  26.57 
 
 		 279 aa  92.8  6e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0647  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  26.01 
 
 		 275 aa  90.9  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.173443  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2452  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  30.57 
 
 		 279 aa  90.9  2e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0528  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  33.21 
 
 		 270 aa  90.5  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03770  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.57 
 
 		 307 aa  90.1  4e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.797923  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3164  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30.55 
 
 		 282 aa  89.7  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00339828  hitchhiker  0.00016604 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0918  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  32 
 
 		 276 aa  90.1  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1988  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  29.89 
 
 		 276 aa  89.4  6e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.103319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0914  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  23.31 
 
 		 288 aa  89  9e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1237  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  26.71 
 
 		 272 aa  88.6  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0853  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  33.59 
 
 		 284 aa  88.2  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00111019  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0107  nicotinate-nucleotide diphosphorylase (carboxylating)  28.52 
 
 		 276 aa  88.6  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2774  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.51 
 
 		 285 aa  88.2  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.109833 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2134  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  28.99 
 
 		 290 aa  87  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00345657  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0360  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  26.17 
 
 		 269 aa  87  3e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6033  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  32.58 
 
 		 308 aa  87  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2558  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.62 
 
 		 309 aa  87.4  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0983562  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1973  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.35 
 
 		 275 aa  86.3  5e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.795275  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0785  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.89 
 
 		 282 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.138679 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0043  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  24.61 
 
 		 297 aa  85.1  0.000000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.541216  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2352  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  26.32 
 
 		 283 aa  85.1  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1263  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.71 
 
 		 287 aa  84.3  0.000000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0133  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30.28 
 
 		 292 aa  84.3  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.539491  normal  0.0277976 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1495  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.37 
 
 		 271 aa  84  0.000000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.451714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4275  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  28.42 
 
 		 277 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00530788  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0732  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.18 
 
 		 289 aa  83.2  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0786  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.89 
 
 		 281 aa  82.8  0.000000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0532  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  32.52 
 
 		 512 aa  82.4  0.000000000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.147571  normal  0.119991 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1902  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  28.35 
 
 		 276 aa  82.4  0.000000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.493343 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2321  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.07 
 
 		 276 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000100602  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2530  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  26.97 
 
 		 283 aa  82  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2217  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  33.33 
 
 		 285 aa  81.6  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0752  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  25.87 
 
 		 279 aa  81.3  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02171  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase:quinolinate phosphoriobsyl transferase  23.28 
 
 		 288 aa  81.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1755  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  28.91 
 
 		 282 aa  80.9  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.828891  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2252  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.37 
 
 		 278 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487275 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0420  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  22.68 
 
 		 277 aa  80.5  0.00000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.640134  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>