More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4238 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4238  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 332 aa  669    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.440412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2259  putative glycosyl transferase  79.47 
 
 		 313 aa  503  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1592  glycosyl transferase family protein  75.33 
 
 		 346 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0866  glycosyl transferase family protein  62.62 
 
 		 327 aa  385  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0256  glycosyl transferase family protein  66.23 
 
 		 317 aa  372  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759794  normal  0.0678648 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2299  glycosyl transferase family protein  58.03 
 
 		 332 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.705135  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16010  Glycosyl transferase, family 2  57.98 
 
 		 322 aa  355  5.999999999999999e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000000647727  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0549  glycosyl transferase family protein  63.12 
 
 		 321 aa  349  4e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  unclonable  0.00000233931  normal  0.956589 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0173  glycosyl transferase family 2  60.4 
 
 		 325 aa  347  1e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0021  glycosyl transferase family 2  54.29 
 
 		 330 aa  335  7.999999999999999e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3000  glycosyl transferase family 2  63.58 
 
 		 330 aa  333  3e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4209  glycosyl transferase family 2  53.33 
 
 		 346 aa  332  6e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.220629 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0585  glycosyl transferase family protein  59.8 
 
 		 310 aa  328  9e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2940  glycosyl transferase family protein  56.62 
 
 		 318 aa  328  9e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4281  glycosyl transferase family 2  52.81 
 
 		 335 aa  315  5e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.405999 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4546  glycosyl transferase family 2  51.96 
 
 		 335 aa  311  7.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.947898  normal  0.992745 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0148  succinoglycan biosynthesis protein  50.98 
 
 		 334 aa  306  3e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4442  glycosyl transferase family 2  53.95 
 
 		 314 aa  302  5.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.302046 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4380  glycosyl transferase family 2  53.95 
 
 		 314 aa  302  5.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1891  glycosyl transferase family 2  46.23 
 
 		 307 aa  279  5e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0644224  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1245  glycosyl transferase family 2  47.78 
 
 		 324 aa  276  4e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000219954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0843  glycosyl transferase family 2  47.33 
 
 		 314 aa  268  8.999999999999999e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1189  glycosyltransferase, group 2 family protein  43.69 
 
 		 310 aa  257  2e-67  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1737  glycosyl transferase family protein  46.49 
 
 		 312 aa  255  6e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1566  cell wall membrane glycosyltransferase  43.84 
 
 		 314 aa  241  1e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.901523  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1400  glycosyltransferase-like protein  41.84 
 
 		 317 aa  222  4.9999999999999996e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5439  glycosyl transferase family protein  38.22 
 
 		 318 aa  218  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.409954  normal  0.431845 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0532  glycosyl transferase family 2  33.65 
 
 		 315 aa  157  3e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.356755  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1662  glycosyl transferase family protein  34.83 
 
 		 308 aa  155  1e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1259  glycosyl transferase family protein  31.96 
 
 		 303 aa  149  9e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1802  glycosyl transferase family protein  32.99 
 
 		 307 aa  145  1e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.319238  normal  0.13058 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1292  hypothetical protein  31.63 
 
 		 309 aa  144  3e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.833177 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1495  glycosyl transferase family protein  30.74 
 
 		 308 aa  142  7e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.025805  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0596  dolichol-phosphate mannosyltransferase  35.71 
 
 		 305 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0696  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 310 aa  134  3e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.646152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1537  glycosyl transferase family 2  34.36 
 
 		 308 aa  133  5e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0778  glycosyl transferase family protein  32 
 
 		 305 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.703306  normal  0.211437 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0916  glycosyl transferase family 2  30.38 
 
 		 336 aa  132  1.0000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2490  glycosyl transferase family 2  32.41 
 
 		 344 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2780  glycosyl transferase family 2  31.41 
 
 		 319 aa  127  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5487  glycosyl transferase family 2  34.47 
 
 		 394 aa  119  7.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1061  glycosyl transferase family 2  32.01 
 
 		 448 aa  115  7.999999999999999e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0520  glycosyl transferase family 2  33.18 
 
 		 221 aa  112  1.0000000000000001e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0151  histidinol-phosphate phosphatase family protein  33.04 
 
 		 410 aa  107  4e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_190  histidinol-phosphate phosphatase protein/glycosyl transferase  33.48 
 
 		 410 aa  106  5e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00438992  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2933  glycosyl transferase family 2  31.09 
 
 		 355 aa  104  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.175593 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1727  glycosyl transferase family protein  27.66 
 
 		 329 aa  103  3e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.350304  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3586  glycosyl transferase family 2  31.76 
 
 		 272 aa  100  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7655  putative glycosyltransferase  30.61 
 
 		 276 aa  99.8  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0400  glycosyl transferase family protein  30.62 
 
 		 344 aa  98.6  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156434  normal  0.0492083 
 
 
-
 
NC_002936  DET0202  histidinol-phosphate phosphatase family protein/glycosyl transferase, group 2 family protein  32.3 
 
 		 410 aa  98.2  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.631531  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3067  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 394 aa  97.8  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.936306  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4222  glycosyl transferase family protein  30.58 
 
 		 420 aa  97.4  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2117  glycosyl transferase family protein  27.99 
 
 		 304 aa  97.1  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal  0.308153 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0818  glycosyl transferase family 2  30.67 
 
 		 411 aa  97.4  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2273  glycosyl transferase family 2  30.04 
 
 		 295 aa  96.7  5e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0214  glycosyl transferase family protein  31.87 
 
 		 378 aa  96.7  6e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.840225  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0451  glycosyl transferase family protein  30.45 
 
 		 414 aa  95.9  8e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1913  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  27.34 
 
 		 382 aa  95.9  9e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0660  glycosyl transferase family 2  29.07 
 
 		 414 aa  95.5  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.77196  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2302  glycosyl transferase family protein  31.76 
 
 		 287 aa  95.5  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0527  glycosyl transferase family protein  32.16 
 
 		 374 aa  94  3e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.347971  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1765  glycosyl transferase family protein  28.89 
 
 		 229 aa  94  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2676  glycosyl transferase family protein  31.47 
 
 		 282 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3136  glycosyl transferase family protein  28.08 
 
 		 305 aa  92  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0478  glycosyl transferase family protein  32.23 
 
 		 371 aa  91.3  2e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0341  glycosyl transferase family protein  31.31 
 
 		 302 aa  91.7  2e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0794  glycosyl transferase family 2  30.51 
 
 		 291 aa  91.7  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02590  Glycosyl transferase, family 2  24.24 
 
 		 328 aa  89.7  6e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.105398  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0430  glycosyl transferase family 2  29.49 
 
 		 301 aa  89  9e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2124  glycosyl transferase family protein  24.84 
 
 		 340 aa  89  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1579  glycosyl transferase family protein  32.52 
 
 		 287 aa  88.6  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.21948  normal  0.274424 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1077  glycosyl transferase family protein  26.46 
 
 		 298 aa  87.8  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.273313  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0447  glycosyl transferase family 2  29.18 
 
 		 284 aa  87.4  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.397578  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3168  glycosyl transferase family 2  28.81 
 
 		 299 aa  87  4e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.912354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3898  glycosyl transferase family 2  26.92 
 
 		 285 aa  86.7  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2674  family 2 glycosyl transferase  30.87 
 
 		 285 aa  85.9  8e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49432  normal  0.387912 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1957  glycosyl transferase family protein  26.73 
 
 		 327 aa  85.5  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.890096  normal  0.0695773 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5098  glycosyl transferase family protein  27.59 
 
 		 336 aa  85.1  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0164  glycosyl transferase family 2  29.86 
 
 		 262 aa  84.3  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.858664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3852  glycosyl transferase family protein  32.17 
 
 		 271 aa  84.3  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.228313 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4187  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 		 386 aa  84  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4444  glycosyl transferase family protein  27.24 
 
 		 519 aa  83.6  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3061  glycosyl transferase family protein  33.2 
 
 		 480 aa  83.2  0.000000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0151807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0165  glycosyl transferase family protein  23.78 
 
 		 321 aa  82.4  0.000000000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000128177 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6391  glycosyl transferase family 2  31.67 
 
 		 273 aa  82.4  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.892714  normal  0.2042 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05405  putative glycosyltransferase  29.7 
 
 		 231 aa  82.4  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.507881  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2396  glycosyl transferase family protein  29.92 
 
 		 313 aa  82.4  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0589  glycosyl transferase family protein  26.07 
 
 		 226 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4293  glycosyl transferase family protein  27.63 
 
 		 531 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5602  glycosyl transferase family 2  28.29 
 
 		 412 aa  81.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.922712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0138  glycosyl transferase family protein  29.35 
 
 		 389 aa  81.3  0.00000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.15479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0014  glycosyl transferase family protein  28.85 
 
 		 357 aa  80.5  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00192438  hitchhiker  0.0000617059 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1622  glycosyl transferase family 2  28.4 
 
 		 280 aa  80.9  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.429819  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0217  glycosyl transferase family protein  27.88 
 
 		 283 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.860122  normal  0.275888 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1976  glycosyl transferase family 2  26.91 
 
 		 230 aa  80.5  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.364573  normal  0.0138769 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1970  glycosyl transferase family protein  29.53 
 
 		 305 aa  80.5  0.00000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.804516 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4432  glycosyl transferase family 2  27.24 
 
 		 527 aa  80.5  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4453  glycosyl transferase family 2  27.24 
 
 		 527 aa  80.5  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0976  glycosyl transferase family 2  28.63 
 
 		 430 aa  80.1  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>