More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4181 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4181  methyltransferase type 11  100 
 
 		 239 aa  486  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2577  Methyltransferase type 11  39.35 
 
 		 227 aa  160  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4086  methyltransferase type 11  37.93 
 
 		 249 aa  77  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315577  normal  0.173874 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0058  Methyltransferase type 11  39.47 
 
 		 354 aa  74.3  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  37.91 
 
 		 261 aa  71.6  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  28.1 
 
 		 235 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.22 
 
 		 238 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2481  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  26.8 
 
 		 235 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.817194 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2830  methylase  28.57 
 
 		 238 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.036188  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  38.46 
 
 		 252 aa  69.7  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0617  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  35.71 
 
 		 232 aa  69.7  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.48837 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51145  predicted protein  28.8 
 
 		 363 aa  69.3  0.00000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2850  methylase  28.14 
 
 		 235 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00782865  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.57 
 
 		 236 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2233  Methyltransferase type 11  35.25 
 
 		 204 aa  68.6  0.00000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.569046  hitchhiker  0.00169364 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2709  methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 204 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.690891  normal  0.954825 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  39.42 
 
 		 257 aa  68.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2595  methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 204 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133869  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3265  methyltransferase type 11  32.88 
 
 		 241 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0474  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  38.58 
 
 		 257 aa  66.6  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5124  methyltransferase type 11  32.19 
 
 		 241 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0265  Methyltransferase type 11  37.62 
 
 		 257 aa  66.2  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.767056 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7600  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.59 
 
 		 254 aa  65.5  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.906312  normal  0.192206 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  27.18 
 
 		 225 aa  65.5  0.0000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  34.07 
 
 		 215 aa  65.1  0.0000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  37.86 
 
 		 244 aa  65.5  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  38.33 
 
 		 225 aa  65.5  0.0000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2096  type 11 methyltransferase  29.61 
 
 		 207 aa  64.7  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.423415  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0381  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.88 
 
 		 261 aa  65.1  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.111253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0061  Orf34  33.76 
 
 		 246 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3821  methyltransferase type 11  35.25 
 
 		 203 aa  64.7  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00951673  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  35.92 
 
 		 236 aa  64.3  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2634  methyltransferase type 11  34.42 
 
 		 204 aa  64.7  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162625  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1562  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.76 
 
 		 246 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1474  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.76 
 
 		 246 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0302671  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1751  Methyltransferase type 11  34.21 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.190561  hitchhiker  0.00369788 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  34.55 
 
 		 1106 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.94 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.423276 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6814  Methyltransferase type 11  28.89 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  34.04 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  41 
 
 		 634 aa  62.8  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1575  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.74 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0515  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.35 
 
 		 254 aa  62.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0440194 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  27.52 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4779  Methyltransferase type 11  43.56 
 
 		 264 aa  62.4  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766265 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7834  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 316 aa  62.4  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.26678  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5212  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  37.11 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0540942  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0079  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.59 
 
 		 253 aa  62.4  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0762202 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0328  Methyltransferase type 11  32.03 
 
 		 207 aa  62  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1428  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0321  Methyltransferase type 11  32.03 
 
 		 207 aa  62  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0289  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  36.61 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.911114 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0705  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 300 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.716094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3965  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.03 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2880  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  36.29 
 
 		 273 aa  61.6  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2022  hypothetical protein  31.3 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891913  normal  0.0390381 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  26.52 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.04 
 
 		 235 aa  61.6  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0297  UbiE/COQ5 family methyltransferase  36.61 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2273  methyltransferase type 11  36.81 
 
 		 204 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.972016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2345  methyltransferase type 11  36.73 
 
 		 204 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1068  methyltransferase type 11  26.63 
 
 		 417 aa  61.2  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1535  methyltransferase type 11  36.84 
 
 		 265 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0615869  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0607  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.81 
 
 		 253 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.18812  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0981  methyltransferase type 11  43.88 
 
 		 229 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7096  Methyltransferase type 11  29.01 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517227  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2935  Methyltransferase type 11  35.92 
 
 		 320 aa  60.8  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  33.8 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4427  methyltransferase type 11  39.32 
 
 		 273 aa  60.8  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0282  UbiE/COQ5 family methyltransferase  36.61 
 
 		 256 aa  60.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.986318 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2034  methyltransferase  31.06 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00341547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3941  methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3266  hypothetical protein  30.08 
 
 		 400 aa  60.1  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0284  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  36.61 
 
 		 256 aa  60.1  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2918  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  33.33 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1304  UbiE/COQ5 family methlytransferase  40 
 
 		 246 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.308237  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  32.98 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1352  hypothetical protein  24.83 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  35.79 
 
 		 1032 aa  60.1  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  26.67 
 
 		 283 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  34.38 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2207  Methyltransferase type 11  39.56 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1467  UbiE/COQ5 family methlytransferase  37.96 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2461  Methyltransferase type 11  34.82 
 
 		 265 aa  59.7  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2995  Methyltransferase type 11  31.82 
 
 		 363 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.482606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2160  methyltransferase type 11  35.4 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.264842  normal  0.115714 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  36.36 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.72 
 
 		 345 aa  59.3  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  29.57 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  36.94 
 
 		 253 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4269  methyltransferase type 11  37.25 
 
 		 332 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.589079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4324  Methyltransferase type 11  32.46 
 
 		 286 aa  59.3  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1880  Methyltransferase type 11  34.38 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2463  methyltransferase type 11  36.11 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.899692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  35.9 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  33.98 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4431  methyltransferase type 11  32.58 
 
 		 295 aa  58.9  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2090  methyltransferase type 11  37.25 
 
 		 341 aa  58.9  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6862  Methyltransferase type 11  27.71 
 
 		 227 aa  58.5  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2788  23S rRNA methyltransferase A  29.85 
 
 		 271 aa  58.5  0.00000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>