More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4154 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5699  S-adenosylmethionine synthetase  92.71 
 
 		 399 aa  744    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.464938 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2378  S-adenosylmethionine synthetase  92.71 
 
 		 398 aa  745    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.989714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1588  S-adenosylmethionine synthetase  95.73 
 
 		 398 aa  769    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4154  S-adenosylmethionine synthetase  100 
 
 		 398 aa  819    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.509299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1596  S-adenosylmethionine synthetase  94.72 
 
 		 398 aa  759    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4546  S-adenosylmethionine synthetase  91.96 
 
 		 398 aa  748    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2753  S-adenosylmethionine synthetase  92.21 
 
 		 398 aa  744    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.293666  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1062  methionine adenosyltransferase  73.68 
 
 		 398 aa  593  1e-168  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.323236  normal  0.678652 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1816  methionine adenosyltransferase  72.8 
 
 		 397 aa  587  1e-167  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0159943  normal  0.205319 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5288  methionine adenosyltransferase  70.18 
 
 		 392 aa  552  1e-156  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.344896 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0013  S-adenosylmethionine synthetase  68.28 
 
 		 412 aa  550  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.303357  normal  0.0988559 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4493  methionine adenosyltransferase  69.42 
 
 		 392 aa  549  1e-155  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0015  S-adenosylmethionine synthetase  68.28 
 
 		 412 aa  548  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000616083 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5908  S-adenosylmethionine synthetase  69.67 
 
 		 392 aa  549  1e-155  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.545702  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0752  S-adenosylmethionine synthetase  66.75 
 
 		 420 aa  544  1e-154  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3623  S-adenosylmethionine synthetase  67.76 
 
 		 389 aa  547  1e-154  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2160  S-adenosylmethionine synthetase  66.27 
 
 		 421 aa  542  1e-153  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00603906  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2072  S-adenosylmethionine synthetase  66.51 
 
 		 421 aa  544  1e-153  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0645702  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3629  Methionine adenosyltransferase  68.92 
 
 		 391 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0654869  normal  0.253839 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0046  S-adenosylmethionine synthetase  66.91 
 
 		 426 aa  539  9.999999999999999e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0624552  hitchhiker  0.00000000150767 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3306  methionine adenosyltransferase  68.92 
 
 		 391 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.636766 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3506  Methionine adenosyltransferase  68.67 
 
 		 391 aa  537  1e-151  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.996413  normal  0.604274 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0444  S-adenosylmethionine synthetase  66.83 
 
 		 412 aa  530  1e-149  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00664731  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0706  S-adenosylmethionine synthetase  66.58 
 
 		 393 aa  525  1e-148  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.479174 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1012  S-adenosylmethionine synthetase  67.65 
 
 		 394 aa  526  1e-148  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1249  S-adenosylmethionine synthetase  64.11 
 
 		 426 aa  518  1e-146  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3924  S-adenosylmethionine synthetase  65.17 
 
 		 426 aa  520  1e-146  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3595  S-adenosylmethionine synthetase  65.34 
 
 		 388 aa  508  1e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0230155  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0193  S-adenosylmethionine synthetase  65.09 
 
 		 393 aa  509  1e-143  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.390697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3280  S-adenosylmethionine synthetase  65.34 
 
 		 388 aa  508  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.861099 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3877  S-adenosylmethionine synthetase  65.59 
 
 		 388 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3776  S-adenosylmethionine synthetase  63.22 
 
 		 389 aa  495  1e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1873  S-adenosylmethionine synthetase  63.09 
 
 		 388 aa  494  9.999999999999999e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.176283  normal  0.7494 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2439  S-adenosylmethionine synthetase  63.98 
 
 		 388 aa  491  1e-137  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1054  S-adenosylmethionine synthetase  62.69 
 
 		 395 aa  479  1e-134  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1970  S-adenosylmethionine synthetase  61.85 
 
 		 395 aa  463  1e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0027  S-adenosylmethionine synthetase  61.41 
 
 		 407 aa  462  1e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114949  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3373  S-adenosylmethionine synthetase  61.74 
 
 		 402 aa  460  9.999999999999999e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.304144 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3139  S-adenosylmethionine synthetase  57.11 
 
 		 406 aa  456  1e-127  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0136  S-adenosylmethionine synthetase  56.78 
 
 		 390 aa  441  9.999999999999999e-123  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0945  S-adenosylmethionine synthetase  54.06 
 
 		 393 aa  434  1e-120  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0018  S-adenosylmethionine synthetase  53.81 
 
 		 392 aa  434  1e-120  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0284  S-adenosylmethionine synthetase  59.22 
 
 		 401 aa  430  1e-119  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1256  S-adenosylmethionine synthetase  53.73 
 
 		 395 aa  405  1.0000000000000001e-112  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.247936  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0413  S-adenosylmethionine synthetase  55.58 
 
 		 390 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0737611  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3252  S-adenosylmethionine synthetase  53.07 
 
 		 393 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2262  S-adenosylmethionine synthetase  54.27 
 
 		 385 aa  405  1.0000000000000001e-112  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0139  S-adenosylmethionine synthetase  53.75 
 
 		 389 aa  402  1e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4320  methionine adenosyltransferase  53.25 
 
 		 387 aa  404  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.238534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1821  S-adenosylmethionine synthetase  54.2 
 
 		 385 aa  402  1e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0267535  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0499  S-adenosylmethionine synthetase  53.45 
 
 		 396 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1841  S-adenosylmethionine synthetase  54.46 
 
 		 398 aa  399  9.999999999999999e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1877  S-adenosylmethionine synthetase  54.46 
 
 		 398 aa  399  9.999999999999999e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3880  S-adenosylmethionine synthetase  51.48 
 
 		 393 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.356419  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0470  S-adenosylmethionine synthetase  53.94 
 
 		 382 aa  400  9.999999999999999e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09860  Methionine adenosyltransferase  53.48 
 
 		 402 aa  401  9.999999999999999e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4967  S-adenosylmethionine synthetase  53.2 
 
 		 396 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.3549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0126  S-adenosylmethionine synthetase  52.46 
 
 		 393 aa  397  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0210112 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1179  Methionine adenosyltransferase  53.63 
 
 		 389 aa  396  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03161  S-adenosylmethionine synthetase  53.63 
 
 		 381 aa  397  1e-109  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.713354  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5016  S-adenosylmethionine synthetase  53.2 
 
 		 396 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330289 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1082  S-adenosylmethionine synthetase  54.55 
 
 		 383 aa  396  1e-109  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0507835  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4840  S-adenosylmethionine synthetase  53.2 
 
 		 396 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.905564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3331  S-adenosylmethionine synthetase  52.76 
 
 		 383 aa  397  1e-109  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.175486  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0871  S-adenosylmethionine synthetase  53.67 
 
 		 383 aa  397  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0646  S-adenosylmethionine synthetase  54.55 
 
 		 383 aa  397  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00167645  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3874  methionine adenosyltransferase  52.2 
 
 		 396 aa  398  1e-109  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000696498  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0683  S-adenosylmethionine synthetase  52.38 
 
 		 393 aa  394  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.842341  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0873  S-adenosylmethionine synthetase  53.16 
 
 		 383 aa  393  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3541  S-adenosylmethionine synthetase  53.16 
 
 		 383 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0929  S-adenosylmethionine synthetase  52.91 
 
 		 383 aa  392  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0383  S-adenosylmethionine synthetase  54.52 
 
 		 396 aa  392  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0660  S-adenosylmethionine synthetase  51.11 
 
 		 395 aa  392  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00877697  decreased coverage  0.0019474 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2574  S-adenosylmethionine synthetase  52.22 
 
 		 395 aa  394  1e-108  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0485425  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0828  S-adenosylmethionine synthetase  51.89 
 
 		 388 aa  392  1e-108  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.296122  normal  0.0311874 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0979  S-adenosylmethionine synthetase  52.13 
 
 		 393 aa  392  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5269  S-adenosylmethionine synthetase  52.83 
 
 		 396 aa  394  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.613554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0879  S-adenosylmethionine synthetase  52.51 
 
 		 388 aa  394  1e-108  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000307684  hitchhiker  0.000000742555 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0085  methionine adenosyltransferase  51.51 
 
 		 388 aa  392  1e-108  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.486268 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0767  S-adenosylmethionine synthetase  52.13 
 
 		 393 aa  393  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0850  S-adenosylmethionine synthetase  52.39 
 
 		 388 aa  394  1e-108  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.876069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3660  S-adenosylmethionine synthetase  53.16 
 
 		 383 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.2045 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3466  S-adenosylmethionine synthetase  53.16 
 
 		 383 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2777  S-adenosylmethionine synthetase  54.98 
 
 		 403 aa  394  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102854  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0659  S-adenosylmethionine synthetase  54.98 
 
 		 403 aa  393  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3336  S-adenosylmethionine synthetase  53.27 
 
 		 384 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.216224  normal  0.254076 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2760  S-adenosylmethionine synthetase  53.16 
 
 		 383 aa  392  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0705  S-adenosylmethionine synthetase  52.13 
 
 		 393 aa  393  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.102884 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3263  S-adenosylmethionine synthetase  53.27 
 
 		 384 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0673019  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0751  S-adenosylmethionine synthetase  52.66 
 
 		 383 aa  391  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0753  Non-specific protein-tyrosine kinase  53.27 
 
 		 384 aa  390  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0349  S-adenosylmethionine synthetase  52.5 
 
 		 388 aa  390  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000664302  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2521  S-adenosylmethionine synthetase  51.63 
 
 		 388 aa  389  1e-107  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1133  S-adenosylmethionine synthetase  52.97 
 
 		 395 aa  391  1e-107  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000111198  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2084  methionine adenosyltransferase  52.11 
 
 		 395 aa  391  1e-107  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.191002  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3346  S-adenosylmethionine synthetase  53.02 
 
 		 384 aa  389  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.274047  decreased coverage  0.00210424 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5604  S-adenosylmethionine synthetase  52.1 
 
 		 393 aa  391  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.617182 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0841  S-adenosylmethionine synthetase  54.02 
 
 		 384 aa  390  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0826  S-adenosylmethionine synthetase  52.91 
 
 		 383 aa  391  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232254  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3974  S-adenosylmethionine synthetase  52.51 
 
 		 384 aa  389  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>