More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4153 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0356  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  69.43 
 
 		 464 aa  646    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.31829  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2015  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  71.7 
 
 		 466 aa  678    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.15803  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1875  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.23 
 
 		 475 aa  640    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0379318  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0138  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  69.02 
 
 		 472 aa  659    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.599517  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2097  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  71.91 
 
 		 466 aa  678    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.311406  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3247  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  73.62 
 
 		 466 aa  692    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2842  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.6 
 
 		 473 aa  635    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01751  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.29 
 
 		 476 aa  637    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1604  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  82.49 
 
 		 468 aa  799    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.177686  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0822  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  71.91 
 
 		 466 aa  678    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0180  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.53 
 
 		 472 aa  637    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0500426 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0741  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  84.47 
 
 		 466 aa  806    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.88616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2377  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  89.19 
 
 		 485 aa  869    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.913153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4433  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  83.65 
 
 		 468 aa  803    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.513976 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0057  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.6 
 
 		 473 aa  635    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1514  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  72.98 
 
 		 463 aa  684    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4545  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  89.62 
 
 		 469 aa  863    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4291  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  72.98 
 
 		 466 aa  684    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1294  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.45 
 
 		 476 aa  635    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000000792408  hitchhiker  0.0000266691 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2918  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.66 
 
 		 473 aa  637    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2964  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  73.4 
 
 		 463 aa  684    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.317218  normal  0.0707693 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3444  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  77.8 
 
 		 467 aa  746    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.893839  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3134  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.6 
 
 		 473 aa  635    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3165  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.6 
 
 		 473 aa  634    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4943  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  83.23 
 
 		 468 aa  798    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0590429  normal  0.487152 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0049  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  71.49 
 
 		 509 aa  669    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1589  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  91.1 
 
 		 471 aa  878    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2003  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  72.98 
 
 		 468 aa  677    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.012931  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2895  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  68.72 
 
 		 470 aa  647    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1701  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.6 
 
 		 473 aa  635    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4074  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  71.06 
 
 		 461 aa  636    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.27026 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2674  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  70.35 
 
 		 469 aa  666    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4153  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  100 
 
 		 481 aa  998    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.370152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1597  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  91.53 
 
 		 471 aa  882    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2752  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  87.73 
 
 		 478 aa  857    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0927232  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0186  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  80.43 
 
 		 465 aa  758    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.168402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0170  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  68.72 
 
 		 472 aa  641    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.525466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0499  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  83.76 
 
 		 468 aa  809    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248655 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2835  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  69.79 
 
 		 461 aa  661    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0163  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  72.13 
 
 		 472 aa  665    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.358648 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3838  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.6 
 
 		 473 aa  635    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0166  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  72.98 
 
 		 463 aa  684    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.539917 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3576  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  69.79 
 
 		 465 aa  675    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5919  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.71 
 
 		 476 aa  635    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2263  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  68.58 
 
 		 470 aa  645    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1346  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  68.09 
 
 		 465 aa  644    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2440  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  69.81 
 
 		 469 aa  663    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2938  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  68.09 
 
 		 465 aa  644    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4623  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  73.83 
 
 		 463 aa  689    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3005  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.45 
 
 		 464 aa  640    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309685  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4897  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  83.65 
 
 		 468 aa  803    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3964  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  72.98 
 
 		 466 aa  680    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0041  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  68.72 
 
 		 465 aa  652    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0210952  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2682  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  71.61 
 
 		 463 aa  671    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5698  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  88.98 
 
 		 473 aa  868    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.457969  normal  0.268273 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0931  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  77.38 
 
 		 468 aa  735    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0161754 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3426  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  70 
 
 		 462 aa  650    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0119  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.74 
 
 		 477 aa  635    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0802054 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0117  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  74.95 
 
 		 472 aa  728    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00161182  normal  0.625216 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2392  adenosylhomocysteinase  65.7 
 
 		 470 aa  645    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.499407  normal  0.234977 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3417  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.6 
 
 		 473 aa  635    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3919  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.6 
 
 		 473 aa  635    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0589  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  76.63 
 
 		 469 aa  742    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.792658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0213  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.45 
 
 		 472 aa  634  1e-180  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15851  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2519  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.09 
 
 		 514 aa  633  1e-180  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.595006 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3375  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.7 
 
 		 472 aa  631  1e-180  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0146  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  68.37 
 
 		 476 aa  632  1e-180  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3842  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  68.01 
 
 		 471 aa  634  1e-180  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.902922  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0102  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.5 
 
 		 476 aa  634  1e-180  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.640394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0178  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  68.51 
 
 		 473 aa  633  1e-180  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0186  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.49 
 
 		 472 aa  632  1e-180  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.433145  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0199  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.49 
 
 		 472 aa  632  1e-180  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.868266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18351  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.11 
 
 		 477 aa  633  1e-180  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0813931  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3758  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  68.09 
 
 		 473 aa  630  1e-179  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1718  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.53 
 
 		 472 aa  630  1e-179  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3286  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.94 
 
 		 477 aa  629  1e-179  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.19663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2835  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.66 
 
 		 472 aa  628  1e-179  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.187693  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18171  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.9 
 
 		 472 aa  630  1e-179  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0272  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.66 
 
 		 472 aa  628  1e-179  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.786714  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0618  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.43 
 
 		 476 aa  628  1e-179  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.542253  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0093  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.16 
 
 		 474 aa  627  1e-178  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0186  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.46 
 
 		 470 aa  624  1e-178  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3333  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.58 
 
 		 474 aa  627  1e-178  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3656  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.37 
 
 		 474 aa  625  1e-178  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2540  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.1 
 
 		 479 aa  626  1e-178  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0193  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.02 
 
 		 470 aa  626  1e-178  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.551187  hitchhiker  0.00261817 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4356  adenosylhomocysteinase  66.12 
 
 		 485 aa  625  1e-178  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.39009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2130  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  68.15 
 
 		 432 aa  624  1e-178  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.421073  normal  0.933423 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0254  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.49 
 
 		 472 aa  627  1e-178  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18141  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.28 
 
 		 479 aa  627  1e-178  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.305772  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0626  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.77 
 
 		 481 aa  621  1e-177  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.549264  normal  0.0480596 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17511  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.72 
 
 		 476 aa  621  1e-177  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.424526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1202  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.68 
 
 		 477 aa  621  1e-177  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0597  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.8 
 
 		 476 aa  624  1e-177  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4132  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.81 
 
 		 479 aa  621  1e-177  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.901613 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1228  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.3 
 
 		 435 aa  624  1e-177  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.389132  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0314  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.19 
 
 		 480 aa  622  1e-177  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4610  adenosylhomocysteinase  66 
 
 		 483 aa  622  1e-177  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0656  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.53 
 
 		 473 aa  622  1e-177  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0735979 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20771  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.68 
 
 		 477 aa  621  1e-177  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.215343  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>