More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4135 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4135  glutathione S-transferase-like  100 
 
 		 239 aa  498  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.354502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4144  glutathione S-transferase-like protein  84.62 
 
 		 235 aa  425  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.547927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0346  glutathione S-transferase domain-containing protein  71 
 
 		 231 aa  353  1e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5440  glutathione S-transferase domain-containing protein  68.94 
 
 		 235 aa  349  2e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.199616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3132  glutathione S-transferase domain-containing protein  68.94 
 
 		 235 aa  347  9e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188559  normal  0.0740814 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2356  glutathione S-transferase domain-containing protein  68.8 
 
 		 231 aa  345  3e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.727095  normal  0.759531 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3215  glutathione S-transferase domain-containing protein  68.09 
 
 		 261 aa  342  4e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.969871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0354  Glutathione S-transferase domain protein  66.52 
 
 		 233 aa  337  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3409  putative glutathione S-transferase  67.23 
 
 		 232 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1653  Glutathione S-transferase domain protein  70.64 
 
 		 233 aa  336  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0442  glutathione S-transferase domain-containing protein  70.21 
 
 		 233 aa  336  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0747669 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3416  putative glutathione S-transferase-like protein  67.23 
 
 		 232 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21646  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2306  Glutathione S-transferase domain protein  67.97 
 
 		 229 aa  336  1.9999999999999998e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0027483 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3373  putative glutathione S-transferase  67.23 
 
 		 232 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0887626  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1120  putative glutathione S-transferase  67.23 
 
 		 232 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0258  putative glutathione S-transferase  67.23 
 
 		 232 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2524  putative glutathione S-transferase  67.23 
 
 		 232 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1701  Glutathione S-transferase domain protein  67.23 
 
 		 233 aa  334  9e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4693  glutathione S-transferase-like protein  64.53 
 
 		 232 aa  332  4e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3453  Glutathione S-transferase domain  68.51 
 
 		 235 aa  332  5e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1238  hypothetical protein  65.96 
 
 		 232 aa  331  5e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00464821  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3329  Glutathione S-transferase domain  68.94 
 
 		 235 aa  330  2e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0980  glutathione S-transferase domain-containing protein  66.1 
 
 		 237 aa  322  3e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3457  glutathione S-transferase domain-containing protein  67.54 
 
 		 232 aa  320  9.000000000000001e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0220469  normal  0.0243961 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50970  glutathione S-transferase  69.05 
 
 		 213 aa  320  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.069878  hitchhiker  0.0000421189 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4348  glutathione S-transferase  68.57 
 
 		 213 aa  318  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5178  glutathione S-transferase-like  62.55 
 
 		 232 aa  316  2e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.14205  normal  0.444148 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05780  Glutathione S-transferase-like protein  63.6 
 
 		 229 aa  312  3.9999999999999997e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.713113  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1214  glutathione S-transferase-like protein  68.57 
 
 		 214 aa  311  4.999999999999999e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0332  glutathione S-transferase-like protein  62.07 
 
 		 229 aa  302  3.0000000000000004e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3866  Glutathione S-transferase domain  62.88 
 
 		 229 aa  298  4e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02807  glutathione S-transferase  62.88 
 
 		 229 aa  298  5e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3195  Glutathione S-transferase domain  62.56 
 
 		 233 aa  296  2e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.16528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2846  glutathione S-transferase domain-containing protein  61.11 
 
 		 263 aa  295  3e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.130993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1416  glutathione S-transferase  60.43 
 
 		 230 aa  292  3e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0078  Glutathione S-transferase domain  58.19 
 
 		 235 aa  292  3e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.926583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2476  Glutathione S-transferase domain  56.83 
 
 		 239 aa  281  8.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.797585  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2246  glutathione S-transferase-like  56.09 
 
 		 237 aa  277  8e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0687483  normal  0.14056 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0662  glutathione S-transferase domain-containing protein  57.63 
 
 		 233 aa  277  9e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3209  glutathione S-transferase-like protein  55.95 
 
 		 239 aa  276  2e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2631  glutathione S-transferase-like  56.36 
 
 		 239 aa  276  2e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.400604  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1479  Glutathione S-transferase domain protein  62.32 
 
 		 208 aa  273  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00108267  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3798  glutathione S-transferase domain-containing protein  57.39 
 
 		 236 aa  273  2.0000000000000002e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.59415  normal  0.718162 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1526  glutathione S-transferase domain-containing protein  56.2 
 
 		 241 aa  272  4.0000000000000004e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.824932  normal  0.476803 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1855  Glutathione S-transferase domain protein  57.14 
 
 		 230 aa  271  5.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.619929  normal  0.146027 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2784  Glutathione S-transferase domain protein  61.35 
 
 		 208 aa  270  2e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000939416  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2563  Glutathione S-transferase domain protein  60.19 
 
 		 209 aa  270  2e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0185641  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2021  putative GST-related protein  56.28 
 
 		 230 aa  266  2e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.398836  normal  0.122618 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2178  Glutathione S-transferase domain  56.28 
 
 		 230 aa  266  2e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0564194 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1381  Glutathione S-transferase domain protein  60.49 
 
 		 209 aa  265  4e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0785607  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0624  glutathione S-transferase family protein  56.96 
 
 		 236 aa  265  5e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0626  glutathione S-transferase family protein  56.96 
 
 		 236 aa  263  1e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.679166  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2303  Glutathione S-transferase domain protein  55.32 
 
 		 234 aa  262  3e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0188012  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1954  putative GST-related protein  56.14 
 
 		 255 aa  261  4.999999999999999e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.331571 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2602  glutathione S-transferase domain-containing protein  56.96 
 
 		 231 aa  260  2e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.550233 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2655  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.84 
 
 		 235 aa  258  8e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.185355  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2578  glutathione S-transferase, N- domain  57.77 
 
 		 215 aa  257  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.539822  normal  0.255018 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2490  glutathione S-transferase, N- domain  57.77 
 
 		 215 aa  257  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00139167  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3152  glutathione S-transferase-like  52.61 
 
 		 235 aa  257  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.194724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2590  glutathione S-transferase, N- domain  57.77 
 
 		 215 aa  257  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.153757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2699  glutathione S-transferase, N- domain  57.77 
 
 		 215 aa  257  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.100904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3442  glutathione S-transferase  59.22 
 
 		 215 aa  256  2e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000326275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2458  glutathione S-transferase  59.22 
 
 		 215 aa  256  2e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00690199  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02227  predicted glutathione S-transferase  59.22 
 
 		 215 aa  255  3e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0437248  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1354  Glutathione S-transferase domain protein  59.22 
 
 		 215 aa  255  3e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000942555  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2452  glutathione S-transferase  59.22 
 
 		 215 aa  255  3e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350471  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2596  glutathione S-transferase  59.22 
 
 		 215 aa  255  3e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000860005  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1350  glutathione S-transferase  59.22 
 
 		 215 aa  255  3e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0219801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2678  glutathione S-transferase  59.22 
 
 		 215 aa  255  3e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000401347  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0967  glutathione S-transferase-like protein  53.04 
 
 		 230 aa  255  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00253605  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02187  hypothetical protein  59.22 
 
 		 215 aa  255  3e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0695509  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0300  glutathione S-transferase-like protein  51.07 
 
 		 234 aa  256  3e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2536  glutathione S-transferase, N- domain  57.28 
 
 		 215 aa  255  4e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0018218  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1366  Glutathione S-transferase domain  54.31 
 
 		 233 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.202985  hitchhiker  0.00146778 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2851  glutathione S-transferase domain-containing protein  56.8 
 
 		 207 aa  254  1.0000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0434229  normal  0.257081 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2266  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.17 
 
 		 230 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5556  glutathione S-transferase-like protein  51.74 
 
 		 230 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3320  glutathione S-transferase domain-containing protein  57 
 
 		 209 aa  252  5.000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000262213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2145  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.74 
 
 		 230 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0715733  normal  0.478827 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5265  putative glutathione transferase  53.45 
 
 		 234 aa  251  7e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.0071298  normal  0.528332 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1049  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.3 
 
 		 230 aa  249  3e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104834  normal  0.267684 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1001  glutathione S-transferase  51.74 
 
 		 230 aa  248  5e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3771  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.43 
 
 		 230 aa  246  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.680155  normal  0.387546 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1988  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.45 
 
 		 233 aa  246  3e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.601516 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2962  glutathione S-transferase-like  51.06 
 
 		 234 aa  243  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.716617  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1641  Glutathione S-transferase domain protein  48.31 
 
 		 240 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.606226  normal  0.332972 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2228  glutathione S-transferase domain-containing protein  50 
 
 		 230 aa  241  6e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1616  glutathione S-transferase-like  50 
 
 		 230 aa  241  6e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2252  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.57 
 
 		 230 aa  239  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.791972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4759  glutathione S-transferase domain-containing protein  56.37 
 
 		 211 aa  240  2e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.895544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5226  Glutathione S-transferase domain  56.37 
 
 		 211 aa  240  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0430433 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5301  Glutathione S-transferase domain  55.34 
 
 		 211 aa  237  1e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0751  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.28 
 
 		 242 aa  235  5.0000000000000005e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0134442  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0486  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.95 
 
 		 211 aa  235  6e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.302672  normal  0.434346 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2407  putative glutathione S-transferase  53.1 
 
 		 235 aa  230  1e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00274689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2848  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.83 
 
 		 233 aa  229  2e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0336918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4359  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.14 
 
 		 222 aa  228  5e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0906  hypothetical protein  55.5 
 
 		 228 aa  226  2e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.719726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4925  Glutathione S-transferase domain protein  51.69 
 
 		 223 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18954  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0831  Glutathione S-transferase domain protein  53.2 
 
 		 227 aa  223  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0286662 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>