More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4128 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007925  RPC_4128  aldo/keto reductase  100 
 
 
313 aa  642    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4815  aldo/keto reductase  77.56 
 
 
313 aa  514  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1288  aldo/keto reductase  77.56 
 
 
313 aa  509  1e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3931  aldo/keto reductase  76.85 
 
 
313 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.726041  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0410  aldo/keto reductase  58.6 
 
 
320 aa  355  7.999999999999999e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.213987  normal  0.0921299 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0458  aldo/keto reductase  52.53 
 
 
317 aa  323  2e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0069  aldo/keto reductase  52.7 
 
 
323 aa  314  9.999999999999999e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4281  aldo/keto reductase  50.8 
 
 
317 aa  309  5e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.198466  hitchhiker  0.0048015 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3890  aldo/keto reductase  50.96 
 
 
319 aa  308  5e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.872462  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6154  aldo/keto reductase  51.42 
 
 
316 aa  308  5.9999999999999995e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.775736  normal  0.411679 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5072  aldo/keto reductase  53.65 
 
 
325 aa  305  5.0000000000000004e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.156563  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6159  aldo/keto reductase  51.58 
 
 
317 aa  305  6e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.145044  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2442  aldo/keto reductase  52.09 
 
 
309 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1649  aldo/keto reductase  51.74 
 
 
325 aa  304  2.0000000000000002e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.328017  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10970  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  51.72 
 
 
327 aa  299  5e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1691  aldo/keto reductase  51.88 
 
 
336 aa  297  1e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0210969 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1641  aldo/keto reductase  50.63 
 
 
325 aa  292  4e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000385668 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4073  aldo/keto reductase  50.16 
 
 
311 aa  286  4e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.492904 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4777  aldo/keto reductase  49.06 
 
 
321 aa  276  3e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13010  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  49.37 
 
 
324 aa  267  2e-70  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118581  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1876  aldo/keto reductase  46.2 
 
 
317 aa  262  6e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0609138 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0148  aldo/keto reductase  45.06 
 
 
352 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.243266  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0968  aldo/keto reductase  43.87 
 
 
349 aa  254  1.0000000000000001e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00511053 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3670  aldo/keto reductase  44.01 
 
 
311 aa  249  5e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3416  aldo/keto reductase  42.81 
 
 
348 aa  249  6e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2735  aldo/keto reductase  43.53 
 
 
344 aa  248  7e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2911  aldo/keto reductase  42.59 
 
 
343 aa  248  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.187668  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0603  aldo/keto reductase  41.98 
 
 
345 aa  246  4e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.512451  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0554  aldo/keto reductase  42.94 
 
 
341 aa  244  9.999999999999999e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.243293 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2549  aldo/keto reductase  41.88 
 
 
344 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.943239 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7154  aldo/keto reductase  40.18 
 
 
347 aa  244  9.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3180  aldo/keto reductase  38.27 
 
 
345 aa  241  9e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4232  aldo/keto reductase  43.71 
 
 
345 aa  241  1e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4219  aldo/keto reductase  40.81 
 
 
325 aa  241  2e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4612  aldo/keto reductase  45.57 
 
 
340 aa  240  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.593922  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0913  aldo/keto reductase  42.37 
 
 
352 aa  239  5e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.287018 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1556  aldo/keto reductase  41.1 
 
 
349 aa  239  5e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206898  normal  0.568157 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1459  aldo/keto reductase  41.23 
 
 
350 aa  239  5.999999999999999e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.209744  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6644  aldo/keto reductase  41.72 
 
 
342 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000695523  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1417  aldo/keto reductase  40.69 
 
 
349 aa  238  6.999999999999999e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.479026  normal  0.0673448 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6593  aldo/keto reductase  39.69 
 
 
338 aa  238  1e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.570213  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2808  aldo/keto reductase  42.19 
 
 
344 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.191746  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2528  aldo/keto reductase  43.77 
 
 
343 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3487  aldo/keto reductase  43.73 
 
 
341 aa  237  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6537  aldo/keto reductase  41.07 
 
 
335 aa  237  2e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0948  aldo/keto reductase  43.49 
 
 
333 aa  237  2e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00901952  normal  0.478792 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6213  aldo/keto reductase  42.32 
 
 
344 aa  237  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.344018 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4044  aldo/keto reductase  39.56 
 
 
344 aa  236  5.0000000000000005e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3155  aldo/keto reductase  40.74 
 
 
353 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4175  aldo/keto reductase  42.45 
 
 
345 aa  235  7e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530522  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4826  aldo/keto reductase  42.45 
 
 
345 aa  235  7e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3181  aldo/keto reductase  43.49 
 
 
322 aa  235  7e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.231147  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3340  aldo/keto reductase  42.45 
 
 
345 aa  235  7e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3193  aldo/keto reductase  42.17 
 
 
333 aa  235  7e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1278  aldo/keto reductase  43.17 
 
 
332 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2475  aldo/keto reductase  41.77 
 
 
327 aa  234  1.0000000000000001e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3268  aldo/keto reductase  41.96 
 
 
345 aa  233  3e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5127  aldo/keto reductase  42.27 
 
 
345 aa  233  3e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6197  aldo/keto reductase  41.96 
 
 
339 aa  232  8.000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135033  normal  0.610455 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1763  aldo/keto reductase  42.72 
 
 
341 aa  231  1e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0931  putative oxidoreductase (aldo/keto reductase)  40.38 
 
 
336 aa  231  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.936106 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0585  aldo/keto reductase  41.88 
 
 
344 aa  231  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2484  aldo/keto reductase  41.67 
 
 
352 aa  230  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.797379  normal  0.441954 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1313  aldo/keto reductase  42.99 
 
 
337 aa  230  3e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0386871  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3074  aldo/keto reductase  40.26 
 
 
333 aa  229  4e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00558733  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1849  aldo/keto reductase  40.38 
 
 
337 aa  229  5e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0475646  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4145  aldo/keto reductase  42.14 
 
 
332 aa  229  6e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.128845 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3210  aldo/keto reductase  40 
 
 
342 aa  228  7e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0255002 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1519  Aryl-alcohol dehydrogenase (NADP(+))  42.37 
 
 
344 aa  228  8e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.481251  normal  0.0511061 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2914  aldo/keto reductase  41.19 
 
 
345 aa  228  9e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3045  aldo/keto reductase  39.43 
 
 
326 aa  228  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.686286  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0950  aldo/keto reductase  41.59 
 
 
334 aa  228  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.493854  normal  0.381629 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4249  aldo/keto reductase  40.25 
 
 
343 aa  227  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.615627  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0110  aldo/keto reductase  39.81 
 
 
325 aa  227  2e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.199403 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3015  putative oxidoreductase, MocA  39.88 
 
 
341 aa  227  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3763  aldo/keto reductase  40.87 
 
 
355 aa  226  3e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.866751  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2034  aldo/keto reductase  39.94 
 
 
357 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2751  aldo/keto family dehydrogenase  39.12 
 
 
329 aa  226  3e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000178849 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5726  aldo/keto reductase  38.63 
 
 
349 aa  226  4e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.2086 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5670  aldo/keto reductase  39.81 
 
 
343 aa  226  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300824  normal  0.0449862 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3594  aldo/keto reductase  41.96 
 
 
344 aa  226  5.0000000000000005e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0217  putative oxidoreductase  40.37 
 
 
331 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2358  aldo/keto reductase  40.43 
 
 
331 aa  224  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0956157 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1427  aldo/keto reductase  38.94 
 
 
341 aa  224  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5658  aldo/keto reductase  39.5 
 
 
343 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.590758  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2535  aldo/keto reductase  39.12 
 
 
329 aa  224  2e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00875609  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02650  aldo/keto reductase  40.19 
 
 
317 aa  224  2e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4686  aldo/keto reductase  38.15 
 
 
342 aa  224  2e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0328236  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3784  aldo/keto reductase  42.01 
 
 
342 aa  224  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00710905  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3087  aldo/keto reductase  42.41 
 
 
333 aa  224  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000843919  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4856  aldo/keto reductase  40.18 
 
 
343 aa  223  3e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1764  aldo/keto reductase  40.87 
 
 
354 aa  223  3e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12040  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  41.16 
 
 
343 aa  223  3e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2739  aldo/keto reductase  41.67 
 
 
352 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.8158 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3824  aldo/keto reductase  40.06 
 
 
339 aa  222  6e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6594  aldo/keto reductase  39.18 
 
 
343 aa  222  6e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.688437  hitchhiker  0.0000922081 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3663  aldo/keto reductase  41.19 
 
 
344 aa  221  9e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5984  aldo/keto reductase  42.9 
 
 
368 aa  221  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0155  aldo/keto reductase  40.25 
 
 
329 aa  221  9.999999999999999e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0867  putative aldo/keto reductase  42.59 
 
 
349 aa  221  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>