More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4046 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4046  CBS domain-containing protein  100 
 
 		 141 aa  292  1e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1350  CBS domain containing membrane protein  72.86 
 
 		 168 aa  218  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1370  CBS domain-containing protein  71.43 
 
 		 171 aa  214  2e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4720  CBS domain containing membrane protein  69.53 
 
 		 130 aa  193  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.236602  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1918  CBS domain-containing protein  63.57 
 
 		 146 aa  184  3e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.406809  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2791  hypothetical protein  58.57 
 
 		 141 aa  181  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.402578  normal  0.193338 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1031  hypothetical protein  61.7 
 
 		 143 aa  171  3.9999999999999995e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4373  CBS domain-containing protein  64.75 
 
 		 154 aa  167  6e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2016  CBS domain-containing protein  49.65 
 
 		 144 aa  137  7e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2074  signal transduction protein  44.68 
 
 		 142 aa  115  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.350465  normal  0.315482 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0318  CBS domain-containing protein  33.86 
 
 		 370 aa  69.7  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147887  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1740  signal transduction protein  30.23 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247067 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0213  CBS domain-containing protein  29.27 
 
 		 863 aa  67.4  0.00000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3318  protein of unknown function DUF190  32.87 
 
 		 436 aa  67  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.17404  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0215  CBS domain-containing protein  30.08 
 
 		 863 aa  67  0.00000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4216  Chloride channel core  32.06 
 
 		 863 aa  67  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.298005 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2021  CBS domain containing membrane protein  30.72 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2529  CBS domain containing membrane protein  29.73 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00130386  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1761  CBS domain-containing protein  24.06 
 
 		 315 aa  66.2  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000282472  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  30.43 
 
 		 246 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0239  signal transduction protein  30.08 
 
 		 128 aa  65.1  0.0000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.371768 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2320  CBS domain-containing protein  29.86 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000465345  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  31.2 
 
 		 862 aa  64.3  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2230  signal transduction protein  28.03 
 
 		 249 aa  63.9  0.0000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2915  Chloride channel core  31.3 
 
 		 897 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5476  signal-transduction protein  31.15 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.184871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5097  signal-transduction protein  31.15 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158303  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5185  signal-transduction protein  31.15 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1342  putative acetoin utilization protein AcuB  26.19 
 
 		 149 aa  62  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  33.59 
 
 		 256 aa  61.6  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0750  CBS domain containing protein  33.33 
 
 		 867 aa  61.2  0.000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.596795  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2035  CBS domain-containing protein  28.69 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1039  putative signal transduction protein with CBS domains  29.69 
 
 		 260 aa  60.5  0.000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2232  CBS domain containing membrane protein  29.22 
 
 		 164 aa  60.5  0.000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3292  signal transduction protein  31.09 
 
 		 142 aa  60.1  0.000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1197  signal-transduction protein  29.52 
 
 		 280 aa  60.1  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.749795  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  30.53 
 
 		 282 aa  60.1  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1297  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  28.46 
 
 		 888 aa  58.9  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.795106  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  29.6 
 
 		 859 aa  58.9  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0278  CBS domain containing membrane protein  27.78 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10697 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2064  hypothetical protein  30.6 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.769911  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  25.49 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1801  CBS domain-containing protein  26.95 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0256126  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1588  CBS  29.85 
 
 		 859 aa  58.2  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.497223  normal  0.185787 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  26.81 
 
 		 247 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1436  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  28.57 
 
 		 482 aa  58.2  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0966  hypothetical protein  27.34 
 
 		 331 aa  58.2  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1482  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  28.57 
 
 		 482 aa  58.2  0.00000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0779  putative signal transduction protein with CBS domains  29.84 
 
 		 272 aa  57.8  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0978373  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0019  CBS domain-containing protein  25.68 
 
 		 410 aa  57.4  0.00000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1465  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.51 
 
 		 580 aa  57.4  0.00000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0657  signal transduction protein  26.87 
 
 		 309 aa  57.4  0.00000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00784458  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  28.8 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1760  CBS domain-containing protein  27.78 
 
 		 279 aa  57.4  0.00000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000218135  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1902  CBS domain-containing protein  26.95 
 
 		 231 aa  57.4  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  26.76 
 
 		 230 aa  57  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1719  CBS domain-containing protein  29.32 
 
 		 143 aa  57  0.00000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000658293 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  27.5 
 
 		 863 aa  56.2  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4053  CBS domain-containing protein  29.25 
 
 		 400 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.250275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0803  signal transduction protein  32.2 
 
 		 160 aa  56.6  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.708068  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  31.45 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1420  polyA polymerase family protein  30.08 
 
 		 880 aa  56.6  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0185526  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  26.92 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  28.28 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2260  CBS domain-containing protein  28.08 
 
 		 150 aa  57  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000586041  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  26.05 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  27.27 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  26.39 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1703  CBS domain containing membrane protein  28.08 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311156  normal  0.0624027 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1262  CBS domain containing membrane protein  26.95 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00178252  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  27.89 
 
 		 427 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3316  CBS domain-containing protein  25.9 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1330  signal transduction protein  28.36 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2625  CBS domain containing protein  28.36 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1533  CBS domain containing membrane protein  31.54 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.279871  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3591  Chloride channel core  35.05 
 
 		 875 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0274826 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2342  CBS domain-containing protein  28 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0675  signal transduction protein  25.87 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2812  CBS domain containing membrane protein  32.06 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718769  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2529  CBS domain containing protein  28.36 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.48063  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  27.66 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0684  polynucleotide adenylyltransferase region  30.08 
 
 		 877 aa  55.5  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3392  protein of unknown function DUF190  31.69 
 
 		 433 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  28 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1882  CBS domain-containing protein  27.66 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000211918  hitchhiker  0.00000438045 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1147  CBS domain containing membrane protein  27.4 
 
 		 404 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  26.77 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2906  signal transduction protein  31.58 
 
 		 291 aa  55.1  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  26.24 
 
 		 229 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  25.83 
 
 		 845 aa  55.5  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2437  signal transduction protein  26.67 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.188385 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1795  CBS domain-containing protein  25.76 
 
 		 251 aa  54.7  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.346551  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3021  CBS domain containing membrane protein  26.95 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1883  CBS domain-containing protein  28.37 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  27.56 
 
 		 769 aa  54.7  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  28.35 
 
 		 225 aa  54.3  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0546  putative signal-transduction protein with CBS and DRTGG domains  31.25 
 
 		 434 aa  54.7  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.865084 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  31.09 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0878  CBS domain containing protein  28.35 
 
 		 880 aa  54.3  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3596  CBS domain-containing protein  27.97 
 
 		 241 aa  53.9  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal  0.0301148 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>