More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3993 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3993  hypothetical protein  100 
 
 		 322 aa  647    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288603 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0909  hypothetical protein  54.61 
 
 		 329 aa  309  4e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  45.62 
 
 		 328 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  45.33 
 
 		 327 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  44.89 
 
 		 336 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  46.31 
 
 		 339 aa  274  2.0000000000000002e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  47.64 
 
 		 328 aa  273  3e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  42.68 
 
 		 328 aa  272  5.000000000000001e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  46.93 
 
 		 325 aa  271  7e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  46.53 
 
 		 314 aa  271  8.000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  45.61 
 
 		 330 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  45.39 
 
 		 330 aa  267  1e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  41.23 
 
 		 327 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  43.95 
 
 		 318 aa  265  5.999999999999999e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  44 
 
 		 335 aa  265  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  42.62 
 
 		 331 aa  263  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  44.19 
 
 		 345 aa  263  2e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  44.19 
 
 		 345 aa  263  3e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  46.74 
 
 		 328 aa  263  4e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  43.48 
 
 		 325 aa  263  4e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  43.48 
 
 		 327 aa  263  4e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  45.9 
 
 		 335 aa  262  4.999999999999999e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  42.68 
 
 		 333 aa  262  6.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  42.71 
 
 		 335 aa  260  2e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  45.15 
 
 		 322 aa  260  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  41.84 
 
 		 349 aa  259  3e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0619  hypothetical protein  42.39 
 
 		 325 aa  259  5.0000000000000005e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  41.58 
 
 		 327 aa  257  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  43.33 
 
 		 333 aa  258  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  44.88 
 
 		 339 aa  257  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  43.05 
 
 		 328 aa  257  2e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  43.05 
 
 		 328 aa  257  2e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  41.28 
 
 		 331 aa  256  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  42.33 
 
 		 304 aa  256  3e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  41.32 
 
 		 320 aa  256  4e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5284  hypothetical protein  43.31 
 
 		 330 aa  256  4e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  41.84 
 
 		 356 aa  255  7e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5443  hypothetical protein  42.42 
 
 		 337 aa  254  1.0000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3550  hypothetical protein  41.39 
 
 		 326 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.615423  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  45.21 
 
 		 336 aa  253  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  42.76 
 
 		 339 aa  254  2.0000000000000002e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  41.43 
 
 		 330 aa  254  2.0000000000000002e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  41.51 
 
 		 332 aa  253  3e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  44.59 
 
 		 324 aa  253  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  42.57 
 
 		 337 aa  253  3e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  38.58 
 
 		 323 aa  252  6e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  41.1 
 
 		 331 aa  252  6e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2114  hypothetical protein  43.2 
 
 		 325 aa  252  7e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00328294 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  43.99 
 
 		 328 aa  251  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3250  hypothetical protein  43.09 
 
 		 330 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3547  hypothetical protein  43.03 
 
 		 330 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  42.05 
 
 		 328 aa  250  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3548  hypothetical protein  42.67 
 
 		 334 aa  249  3e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0576712  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  41.08 
 
 		 338 aa  249  3e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  44.63 
 
 		 324 aa  250  3e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  41.36 
 
 		 330 aa  250  3e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  41.78 
 
 		 325 aa  249  6e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  40.74 
 
 		 325 aa  248  8e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  39.06 
 
 		 330 aa  248  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1316  hypothetical protein  43.14 
 
 		 334 aa  247  1e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.293847  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  41.36 
 
 		 335 aa  247  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4503  extra-cytoplasmic solute receptor  42.19 
 
 		 366 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.4554  normal  0.0615049 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  42.86 
 
 		 358 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  40.94 
 
 		 325 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  41.98 
 
 		 324 aa  246  3e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  39.81 
 
 		 329 aa  246  3e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2537  hypothetical protein  41.69 
 
 		 329 aa  246  4e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5113  extra-cytoplasmic solute receptor  41.43 
 
 		 330 aa  245  6.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000122246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5119  hypothetical protein  39.62 
 
 		 328 aa  245  9e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  45.05 
 
 		 323 aa  244  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1818  hypothetical protein  43.85 
 
 		 326 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00429449 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2485  hypothetical protein  40.43 
 
 		 346 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0644524  normal  0.0188147 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  43 
 
 		 322 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  45.05 
 
 		 353 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1197  hypothetical protein  43.1 
 
 		 324 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  41.36 
 
 		 323 aa  243  1.9999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  41.75 
 
 		 331 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  44.3 
 
 		 326 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  42.24 
 
 		 323 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3406  hypothetical protein  42.63 
 
 		 322 aa  243  1.9999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.88077 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  42.47 
 
 		 328 aa  243  3e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  41.69 
 
 		 331 aa  243  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2898  hypothetical protein  39.47 
 
 		 334 aa  243  3e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000220815  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3135  hypothetical protein  42.42 
 
 		 326 aa  243  3.9999999999999997e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82433  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  42.14 
 
 		 330 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5733  hypothetical protein  43.43 
 
 		 341 aa  243  5e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558781 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  43.62 
 
 		 328 aa  242  6e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4563  hypothetical protein  40.44 
 
 		 329 aa  242  6e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.011816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  40.27 
 
 		 330 aa  242  6e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  40.27 
 
 		 330 aa  242  6e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  39.31 
 
 		 343 aa  242  6e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  41.03 
 
 		 332 aa  241  7.999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  41.08 
 
 		 327 aa  241  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  43.29 
 
 		 355 aa  241  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3017  hypothetical protein  41.59 
 
 		 326 aa  241  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0135549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0579  hypothetical protein  41.25 
 
 		 330 aa  241  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3086  hypothetical protein  43.1 
 
 		 332 aa  241  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  40.81 
 
 		 328 aa  240  2e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  44.97 
 
 		 339 aa  240  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  38.41 
 
 		 331 aa  240  2.9999999999999997e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>