152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3807 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1069  Phosphoketolase  64.74 
 
 		 783 aa  1068    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00313682  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1822  putative phosphoketolase  65.3 
 
 		 796 aa  1082    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1587  putative phosphoketolase  61.1 
 
 		 811 aa  986    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1799  putative phosphoketolase  47.66 
 
 		 792 aa  749    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0441648  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0385  putative phosphoketolase  66.88 
 
 		 789 aa  1100    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.990323  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1219  putative phosphoketolase  50.69 
 
 		 823 aa  801    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.514131  normal  0.618192 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1670  xylulose-5-phosphate/fructose-6-phosphate phosphoketolase  58.24 
 
 		 835 aa  944    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.924354  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00070  phosphoketolase, putative  56.05 
 
 		 834 aa  929    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2063  putative phosphoketolase  68.33 
 
 		 788 aa  1103    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2970  putative phosphoketolase  64.66 
 
 		 792 aa  1028    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.319467  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36257  phosphoketolase  57.28 
 
 		 835 aa  924    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0831  putative phosphoketolase  68.72 
 
 		 812 aa  1115    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.124547  normal  0.616937 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1677  putative phosphoketolase  61.09 
 
 		 802 aa  1031    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1947  putative phosphoketolase  64.86 
 
 		 795 aa  1067    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0496  putative phosphoketolase  70.17 
 
 		 793 aa  1167    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.227875 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0502  putative phosphoketolase  67.05 
 
 		 811 aa  1090    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2717  putative phosphoketolase  70.66 
 
 		 804 aa  1160    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1522  putative phosphoketolase  69.26 
 
 		 809 aa  1141    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2080  putative phosphoketolase  63.23 
 
 		 796 aa  996    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0993  putative phosphoketolase  68.43 
 
 		 807 aa  1139    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3116  acetate kinase  61.1 
 
 		 1228 aa  956    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3546  putative phosphoketolase  69.94 
 
 		 802 aa  1105    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.252555  normal  0.409021 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3858  putative phosphoketolase  84.57 
 
 		 784 aa  1334    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3807  putative phosphoketolase  100 
 
 		 784 aa  1614    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0893  putative phosphoketolase  64.87 
 
 		 791 aa  1065    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.45622 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1037  putative phosphoketolase  64.87 
 
 		 791 aa  1065    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1345  putative phosphoketolase  61.63 
 
 		 797 aa  1000    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.29823  normal  0.0175244 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28490  phosphoketolase  64.26 
 
 		 837 aa  1040    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.179927 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1492  putative phosphoketolase  83.12 
 
 		 784 aa  1335    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4367  putative phosphoketolase  66.62 
 
 		 793 aa  1108    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1896  putative phosphoketolase  67.35 
 
 		 802 aa  1107    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2793  putative phosphoketolase  65.94 
 
 		 806 aa  1061    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.99336  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2236  putative phosphoketolase  66.54 
 
 		 800 aa  1086    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3310  putative phosphoketolase  61.22 
 
 		 1230 aa  960    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3368  putative phosphoketolase  50.06 
 
 		 782 aa  753    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02820  putative phosphoketolase  60.41 
 
 		 820 aa  950    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22210  putative phosphoketolase  63.42 
 
 		 823 aa  1027    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1589  putative phosphoketolase  62.13 
 
 		 810 aa  1010    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0362  putative phosphoketolase  54.46 
 
 		 792 aa  850    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1283  putative phosphoketolase  70.36 
 
 		 811 aa  1146    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.260899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1183  putative phosphoketolase  48.36 
 
 		 794 aa  751    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.837402  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1812  putative phosphoketolase  43.44 
 
 		 817 aa  671    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0562  putative phosphoketolase  46.61 
 
 		 818 aa  746    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000340609 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1456  putative phosphoketolase  47.9 
 
 		 788 aa  753    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1961  putative phosphoketolase  44.43 
 
 		 813 aa  692    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0143  putative phosphoketolase  60.61 
 
 		 811 aa  983    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1358  putative phosphoketolase  69.19 
 
 		 797 aa  1128    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0521  putative phosphoketolase  67.22 
 
 		 797 aa  1071    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.544074 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3620  putative phosphoketolase  67.53 
 
 		 798 aa  1083    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6387  putative phosphoketolase  60.87 
 
 		 787 aa  988    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2837  putative phosphoketolase  65.94 
 
 		 806 aa  1061    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.902964 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3069  putative phosphoketolase  63.26 
 
 		 832 aa  1017    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.665044 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2053  putative phosphoketolase  59.9 
 
 		 815 aa  979    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4497  putative phosphoketolase  77.26 
 
 		 790 aa  1261    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2009  putative phosphoketolase  61.8 
 
 		 821 aa  1017    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.476426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1849  putative phosphoketolase  59.39 
 
 		 813 aa  983    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6198  putative phosphoketolase  66.5 
 
 		 800 aa  1082    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.692341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2820  putative phosphoketolase  65.81 
 
 		 806 aa  1060    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.1074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1271  Phosphoketolase  67.18 
 
 		 792 aa  1057    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.103908  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3341  putative phosphoketolase  63.1 
 
 		 823 aa  1029    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0136973 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1582  putative phosphoketolase  66.37 
 
 		 800 aa  1075    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.240934  normal  0.774313 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1694  putative phosphoketolase  61.09 
 
 		 802 aa  1030    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8717  putative phosphoketolase  64.8 
 
 		 833 aa  1049    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3376  putative phosphoketolase  58.93 
 
 		 820 aa  945    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2340  putative phosphoketolase  68.25 
 
 		 805 aa  1104    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.329763 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0333  putative phosphoketolase  66.75 
 
 		 792 aa  1099    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2459  putative phosphoketolase  68.11 
 
 		 791 aa  1111    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.203497  normal  0.834465 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1686  putative phosphoketolase  46.61 
 
 		 803 aa  748    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2995  putative phosphoketolase  68.61 
 
 		 790 aa  1123    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.836339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1950  putative phosphoketolase  66.37 
 
 		 797 aa  1089    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.966352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0303  putative phosphoketolase  60.51 
 
 		 820 aa  976    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3047  putative phosphoketolase  64.29 
 
 		 824 aa  1035    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00599418 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4654  putative phosphoketolase  65.3 
 
 		 795 aa  1083    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.251699  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2138  putative phosphoketolase  61.61 
 
 		 1305 aa  970    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0981949  normal  0.111283 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3782  putative phosphoketolase  63.16 
 
 		 802 aa  1044    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.478109 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2826  putative phosphoketolase  67.65 
 
 		 783 aa  1075    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0035882  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3471  putative phosphoketolase  67.26 
 
 		 794 aa  1097    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.992442 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1196  putative phosphoketolase  67.64 
 
 		 802 aa  1073    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.297701 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6931  putative phosphoketolase  54.79 
 
 		 811 aa  826    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.281308 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1533  putative phosphoketolase  67.01 
 
 		 800 aa  1071    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465946 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1918  putative phosphoketolase  65.68 
 
 		 789 aa  1066    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.943189  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0040  putative phosphoketolase  70.36 
 
 		 811 aa  1149    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0567  putative phosphoketolase  66.92 
 
 		 811 aa  1090    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0423  putative phosphoketolase  65.69 
 
 		 851 aa  1049    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.978301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2611  putative phosphoketolase  65.65 
 
 		 860 aa  1063    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.151632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6176  putative phosphoketolase  65.31 
 
 		 832 aa  1061    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3572  putative phosphoketolase  63.27 
 
 		 832 aa  1013    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.928145  normal  0.201424 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2204  putative phosphoketolase  65.86 
 
 		 795 aa  1093    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.221992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5497  putative phosphoketolase  62.01 
 
 		 794 aa  994    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.59258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5273  putative phosphoketolase  62.13 
 
 		 797 aa  1011    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.425435 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0538  putative phosphoketolase  67.14 
 
 		 811 aa  1083    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1324  putative phosphoketolase  67.43 
 
 		 791 aa  1127    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.971397  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0701  putative phosphoketolase  50 
 
 		 825 aa  793    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1869  putative phosphoketolase  86.48 
 
 		 783 aa  1422    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf448  putative phosphoketolase  47.9 
 
 		 793 aa  781    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1620  putative phosphoketolase  68.58 
 
 		 798 aa  1140    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1914  putative phosphoketolase  69.13 
 
 		 795 aa  1153    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.457834  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3225  acetate kinase  61.35 
 
 		 1230 aa  962    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3180  putative phosphoketolase  67.22 
 
 		 794 aa  1098    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.822424  normal  0.179179 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1712  putative phosphoketolase  59.9 
 
 		 815 aa  979    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.531952  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>