More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3803 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1714  CheA signal transduction histidine kinase  56.3 
 
 		 921 aa  990    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1872  CheA signal transduction histidine kinase  79.53 
 
 		 937 aa  1447    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134352  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1809  CheA signal transduction histidine kinase  57.1 
 
 		 916 aa  998    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.45414  normal  0.161294 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1906  ATP-binding region ATPase domain protein  43.9 
 
 		 910 aa  706    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1817  CheA signal transduction histidine kinase  78.63 
 
 		 937 aa  1434    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0520  CheA kinase  78.27 
 
 		 888 aa  1430    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.691832 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1691  CheA signal transduction histidine kinase  58.65 
 
 		 878 aa  1039    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4035  CheA signal transduction histidine kinase  56.69 
 
 		 921 aa  995    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.703964  normal  0.275969 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4838  CheA signal transduction histidine kinase  56.91 
 
 		 935 aa  1010    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.552774  hitchhiker  0.00614515 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0521  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  59.18 
 
 		 942 aa  805    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.58429  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0524  chemotaxis protein cheA  76.57 
 
 		 927 aa  1394    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3920  CheA-like signal transduction histidine kinase  81.11 
 
 		 934 aa  1469    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.690282 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3803  CheA signal transduction histidine kinases  100 
 
 		 934 aa  1879    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4247  CheA signal transduction histidine kinases  96.57 
 
 		 922 aa  1771    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.63903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6559  chemotaxis protein cheA  76.13 
 
 		 927 aa  1382    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.834779 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3678  ATP-binding region, ATPase-like  79.89 
 
 		 925 aa  1457    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0781071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3376  CheA signal transduction histidine kinase  78.36 
 
 		 911 aa  1431    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.163998  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0658  CheA signal transduction histidine kinases  49.32 
 
 		 928 aa  802    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.231862  normal  0.831096 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1529  ATPase domain-containing protein  56.99 
 
 		 916 aa  996    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.777004  normal  0.0499469 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1524  CheA signal transduction histidine kinases  39.75 
 
 		 766 aa  536  1e-151  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.82922 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1793  CheA signal transduction histidine kinases  38.38 
 
 		 870 aa  483  1e-135  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.63759  normal  0.833682 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0868  CheA signal transduction histidine kinase  38.26 
 
 		 1063 aa  473  1e-132  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3604  ATPase domain-containing protein  46.13 
 
 		 742 aa  464  1e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.864883  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30990  chemotaxis protein histidine kinase-like protein  44.96 
 
 		 819 aa  443  1e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0314  CheA signal transduction histidine kinase  44.46 
 
 		 822 aa  439  9.999999999999999e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.181126  normal  0.183908 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4224  CheA signal transduction histidine kinases  39.73 
 
 		 801 aa  433  1e-120  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.424073  normal  0.980488 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2325  CheA signal transduction histidine kinase  42.83 
 
 		 760 aa  436  1e-120  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2004  CheA signal transduction histidine kinase  41.95 
 
 		 796 aa  421  1e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.370377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0212  CheA signal transduction histidine kinase  40.86 
 
 		 728 aa  414  1e-114  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.432304  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  39.02 
 
 		 769 aa  404  1e-111  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  39.14 
 
 		 769 aa  404  1e-111  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  39.12 
 
 		 769 aa  403  9.999999999999999e-111  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3576  CheA signal transduction histidine kinases  35.03 
 
 		 1104 aa  393  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  37.31 
 
 		 770 aa  389  1e-106  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  36.39 
 
 		 770 aa  387  1e-106  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  37.91 
 
 		 785 aa  384  1e-105  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  37.24 
 
 		 803 aa  382  1e-104  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  36.88 
 
 		 774 aa  377  1e-103  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  36.74 
 
 		 783 aa  378  1e-103  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4420  CheA signal transduction histidine kinase  37.25 
 
 		 598 aa  376  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0197  CheA signal transduction histidine kinase  34.66 
 
 		 687 aa  372  1e-101  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.13068  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3266  CheA signal transduction histidine kinase  36.48 
 
 		 607 aa  362  2e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000540814 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0750  CheA signal transduction histidine kinase  34.33 
 
 		 650 aa  361  3e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0720  CheA signal transduction histidine kinase  35.28 
 
 		 719 aa  361  3e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.905691  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0877  CheA signal transduction histidine kinases  34.62 
 
 		 601 aa  357  5e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00846405  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0926  CheA signal transduction histidine kinase  34.05 
 
 		 652 aa  356  1e-96  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4026  CheA signal transduction histidine kinase  35.68 
 
 		 604 aa  352  1e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000112235 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2149  CheA signal transduction histidine kinase  31.01 
 
 		 666 aa  351  3e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3942  CheA signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 		 603 aa  348  4e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.160012  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0166  CheA signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 		 677 aa  338  2.9999999999999997e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0113  CheA signal transduction histidine kinase  31.47 
 
 		 686 aa  337  9e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0228  CheA signal transduction histidine kinase  31.55 
 
 		 671 aa  334  4e-90  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2027  CheA signal transduction histidine kinase  30.89 
 
 		 691 aa  333  9e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0738  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  34.55 
 
 		 639 aa  328  4.0000000000000003e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0186  CheA signal transduction histidine kinase  31.45 
 
 		 688 aa  327  5e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0742  CheA signal transduction histidine kinases  31.96 
 
 		 685 aa  326  1e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2440  CheA signal transduction histidine kinase  30.69 
 
 		 696 aa  325  3e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.267459  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1343  CheA signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 		 653 aa  323  7e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0441377  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1612  CheA signal transduction histidine kinase  32.8 
 
 		 694 aa  323  8e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0166152  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1547  CheA signal transduction histidine kinase  30.51 
 
 		 656 aa  322  1.9999999999999998e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  44.33 
 
 		 770 aa  322  1.9999999999999998e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  40.46 
 
 		 660 aa  321  3e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3107  putative CheA signal transduction histidine kinases  39.29 
 
 		 806 aa  321  3.9999999999999996e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1518  chemotaxis protein  30.23 
 
 		 667 aa  320  7e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1728  chemotaxis protein CheA  30.23 
 
 		 667 aa  320  7e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1507  chemotaxis protein  30.23 
 
 		 667 aa  320  9e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0831836  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2218  CheA signal transduction histidine kinases  32.15 
 
 		 704 aa  320  9e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3650  chemotaxis protein CheA  30.48 
 
 		 667 aa  320  1e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1696  chemotaxis protein CheA  30.55 
 
 		 672 aa  319  2e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3046  CheA signal transduction histidine kinase  44.04 
 
 		 733 aa  318  3e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0699777 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1341  CheA signal transduction histidine kinase  43.24 
 
 		 691 aa  318  3e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2277  putative CheA signal transduction histidine kinase  40.62 
 
 		 759 aa  318  4e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1512  chemotaxis protein CheA  33.14 
 
 		 681 aa  318  4e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0308171  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3027  CheA signal transduction histidine kinases  39.38 
 
 		 754 aa  317  5e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2466  chemotaxis protein CheA  33.92 
 
 		 674 aa  317  5e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.406126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0065  CheA signal transduction histidine kinase  31.92 
 
 		 812 aa  317  7e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0264  CheA signal transduction histidine kinase  32.79 
 
 		 654 aa  317  8e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.555417 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1390  CheA signal transduction histidine kinase  39.95 
 
 		 673 aa  315  1.9999999999999998e-84  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2082  chemotaxis protein CheA  34.47 
 
 		 669 aa  315  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.5408699999999997e-20 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1302  CheA signal transduction histidine kinases  39.04 
 
 		 760 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.345231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2137  chemotaxis protein CheA  34.47 
 
 		 669 aa  315  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.959484  hitchhiker  1.08474e-24 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1178  CheA signal transduction histidine kinase  43.12 
 
 		 715 aa  315  2.9999999999999996e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.72434  normal  0.652884 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3425  CheA signal transduction histidine kinase  40.09 
 
 		 745 aa  315  2.9999999999999996e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.630026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  41.37 
 
 		 681 aa  315  3.9999999999999997e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02867  chemotaxis protein cheA  40.13 
 
 		 751 aa  314  4.999999999999999e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1200  chemotaxis protein CheA  34.47 
 
 		 669 aa  314  5.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.485544  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2077  chemotaxis protein CheA  34.47 
 
 		 669 aa  314  5.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0516763  hitchhiker  0.0000338271 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1323  chemotaxis protein CheA  34.52 
 
 		 669 aa  313  7.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.565549999999999e-20 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1202  CheA signal transduction histidine kinases  37.42 
 
 		 736 aa  313  1e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120847  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2181  chemotaxis protein CheA  33.84 
 
 		 654 aa  313  1e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.21887  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0249  CheA signal transduction histidine kinase  31.66 
 
 		 649 aa  312  2e-83  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.818648  normal  0.0240332 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1638  CheA signal transduction histidine kinase  43.01 
 
 		 733 aa  312  2e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01859  fused chemotactic sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CheB and CheY: sensory histidine kinase/signal sensing protein  33.54 
 
 		 654 aa  311  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00492896  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01848  hypothetical protein  33.54 
 
 		 654 aa  311  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0113897  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1855  chemotaxis protein CheA  33.98 
 
 		 662 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.110168  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1744  chemotaxis protein CheA  33.54 
 
 		 654 aa  311  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1296  chemotaxis protein CheA  33.54 
 
 		 652 aa  311  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.182817  hitchhiker  0.0000116445 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2121  chemotaxis protein CheA  33.69 
 
 		 654 aa  311  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000407704  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1752  CheA signal transduction histidine kinase  33.54 
 
 		 654 aa  311  4e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.025847  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2906  CheA signal transduction histidine kinase  37.88 
 
 		 747 aa  311  4e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>