More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3739 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1889  major facilitator superfamily MFS_1  82.96 
 
 		 411 aa  684    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1676  major facilitator transporter  85.19 
 
 		 411 aa  700    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3739  major facilitator transporter  100 
 
 		 413 aa  806    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.101854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3622  major facilitator transporter  84.2 
 
 		 411 aa  696    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.769068  normal  0.781308 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1797  major facilitator transporter  52.58 
 
 		 389 aa  357  2.9999999999999997e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1682  major facilitator transporter  51.18 
 
 		 411 aa  338  9.999999999999999e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000413695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2522  major facilitator transporter  44.92 
 
 		 403 aa  319  5e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.957719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4676  major facilitator superfamily MFS_1  46.6 
 
 		 416 aa  310  4e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0951  major facilitator transporter  46.49 
 
 		 416 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.161729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2297  hypothetical protein  45.36 
 
 		 528 aa  301  1e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2359  major facilitator transporter  44.67 
 
 		 425 aa  300  3e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.313379  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  43.64 
 
 		 407 aa  296  4e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2637  major facilitator transporter  41.15 
 
 		 414 aa  295  9e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0898  major facilitator transporter  41.24 
 
 		 410 aa  295  1e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1282  major facilitator transporter  44.39 
 
 		 400 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800461 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2004  hypothetical protein  45.83 
 
 		 398 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4035  major facilitator transporter  44.64 
 
 		 400 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1027  major facilitator family transporter  45.63 
 
 		 417 aa  290  3e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.492633  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1314  major facilitator family transporter  45.63 
 
 		 417 aa  290  3e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3057  major facilitator family transporter  45.63 
 
 		 417 aa  290  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1401  oxalate/formate antiporter  45.63 
 
 		 417 aa  290  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3184  major facilitator family transporter  45.63 
 
 		 417 aa  290  3e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.965464  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2293  major facilitator family transporter  45.63 
 
 		 417 aa  290  3e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3109  major facilitator transporter  45.61 
 
 		 414 aa  287  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953505  normal  0.200859 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1013  major facilitator superfamily transporter  41.5 
 
 		 405 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0927  major facilitator superfamily MFS_1  41.5 
 
 		 405 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3167  major facilitator transporter  40.4 
 
 		 417 aa  285  1.0000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16310  major facilitator superfamily transporter  44.9 
 
 		 402 aa  285  1.0000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1684  major facilitator transporter  43.88 
 
 		 406 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.926861 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3671  major facilitator transporter  43.51 
 
 		 402 aa  282  7.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112178  normal  0.0907085 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1718  transporter, putative  44.42 
 
 		 402 aa  282  9e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149984  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0839  major facilitator transporter  41.65 
 
 		 402 aa  281  1e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0258567 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2363  putative MFS permease  40.21 
 
 		 414 aa  282  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1093  major facilitator transporter  41.52 
 
 		 410 aa  281  1e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.121635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5487  major facilitator transporter  41.45 
 
 		 410 aa  281  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1198  major facilitator superfamily transporter  40.86 
 
 		 413 aa  280  3e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3808  major facilitator transporter  39.95 
 
 		 406 aa  278  1e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1339  major facilitator superfamily transporter  38.9 
 
 		 412 aa  278  1e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627078 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47560  putative MFS transporter  45.34 
 
 		 399 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.973553 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1242  major facilitator transporter  44.71 
 
 		 400 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.346574  normal  0.494101 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1609  major facilitator superfamily MFS_1  43.88 
 
 		 405 aa  276  4e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283587  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2099  major facilitator transporter  40.1 
 
 		 406 aa  276  6e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2216  major facilitator transporter  41.04 
 
 		 410 aa  276  6e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744121  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4104  MFS family transporter  44.84 
 
 		 399 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2194  major facilitator transporter  41.1 
 
 		 410 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5585  major facilitator protein family permease  42.86 
 
 		 480 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5900  major facilitator transporter  41.71 
 
 		 410 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00598208  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2279  major facilitator transporter  38.65 
 
 		 404 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47059  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2177  major facilitator transporter  41.71 
 
 		 410 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.404965  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2093  major facilitator transporter  41.01 
 
 		 410 aa  273  3e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1652  major facilitator transporter  43.81 
 
 		 402 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579086 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05284  hypothetical protein  39.36 
 
 		 404 aa  273  6e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0953  major facilitator transporter  38.78 
 
 		 412 aa  272  6e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2920  major facilitator transporter  44.5 
 
 		 410 aa  271  2e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.493534  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5086  major facilitator transporter  40.41 
 
 		 408 aa  270  2.9999999999999997e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.90358  hitchhiker  0.0097128 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4144  major facilitator transporter  36.69 
 
 		 404 aa  269  8e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0444016  hitchhiker  0.00345151 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3111  major facilitator superfamily MFS_1  43.99 
 
 		 408 aa  268  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3004  major facilitator superfamily MFS_1  44.11 
 
 		 408 aa  268  2e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0030  major facilitator transporter  39.56 
 
 		 433 aa  266  5e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0716  major facilitator superfamily MFS_1  41.81 
 
 		 409 aa  265  8e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.449869 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0703  major facilitator transporter  42.05 
 
 		 409 aa  265  1e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0698  major facilitator transporter  39.23 
 
 		 412 aa  258  2e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.733103  normal  0.933566 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1372  major facilitator transporter  37.19 
 
 		 412 aa  257  3e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1761  major facilitator transporter  42.53 
 
 		 401 aa  256  5e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0133349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0040  major facilitator transporter  37.19 
 
 		 412 aa  256  8e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2770  major facilitator transporter  37.93 
 
 		 414 aa  254  1.0000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.824791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1369  major facilitator transporter  40.15 
 
 		 417 aa  254  2.0000000000000002e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919983  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1392  major facilitator superfamily MFS_1  43.9 
 
 		 405 aa  254  3e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.306054  normal  0.12691 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1663  major facilitator superfamily transporter  38.42 
 
 		 430 aa  252  7e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.145421  normal  0.283107 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3503  major facilitator transporter  40.26 
 
 		 436 aa  251  2e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.993279  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1328  major facilitator superfamily MFS_1  43.64 
 
 		 405 aa  251  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0933962 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2047  major facilitator superfamily transporter  35.78 
 
 		 421 aa  248  1e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.341858  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3429  major facilitator superfamily MFS_1  38.19 
 
 		 407 aa  244  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0055  major facilitator transporter  35.89 
 
 		 415 aa  240  4e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2672  major facilitator transporter  35.01 
 
 		 412 aa  239  6.999999999999999e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0111  transmembrane transporter  34.75 
 
 		 411 aa  226  7e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3544  major facilitator transporter  37.06 
 
 		 415 aa  213  3.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.773676  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3581  major facilitator transporter  35.16 
 
 		 405 aa  210  3e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2977  major facilitator superfamily transporter  36.6 
 
 		 412 aa  203  4e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.719308  normal  0.188598 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2922  transmembrane transport protein  36.48 
 
 		 421 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1698  major facilitator transporter  36 
 
 		 427 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.418951  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0314  major facilitator transporter  32.61 
 
 		 403 aa  191  2e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.330821  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  30.48 
 
 		 442 aa  129  7.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2011  major facilitator superfamily MFS_1  27.7 
 
 		 452 aa  124  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.805115  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  28.92 
 
 		 433 aa  125  2e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1692  major facilitator superfamily transporter  27.36 
 
 		 452 aa  124  3e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.183372 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0738  major facilitator transporter  31.12 
 
 		 422 aa  124  4e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3053  major facilitator transporter  29.04 
 
 		 414 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0592542 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1521  putative transporter  28.18 
 
 		 429 aa  108  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488674  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3203  major facilitator superfamily MFS_1  27.32 
 
 		 405 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  unclonable  0.000000000018384 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7202  major facilitator transporter  29.02 
 
 		 431 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.63867  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_004310  BR1573  transporter, putative  28.66 
 
 		 430 aa  106  7e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3859  major facilitator transporter  30.52 
 
 		 402 aa  106  8e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.526422 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1594  major facilitator transporter  26.98 
 
 		 457 aa  103  7e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224646  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1789  major facilitator transporter  31.1 
 
 		 400 aa  101  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.790734  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1994  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 411 aa  99.8  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.392153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2923  major facilitator superfamily MFS_1  27.19 
 
 		 438 aa  99  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000215921  hitchhiker  0.0000549805 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6790  major facilitator superfamily MFS_1  29.65 
 
 		 404 aa  99.4  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1958  major facilitator transporter  29.27 
 
 		 409 aa  99.4  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716163  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4323  major facilitator transporter  27.41 
 
 		 436 aa  99  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>