12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3580 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007925  RPC_3580  hypothetical protein  100 
 
 
213 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0847  membrane protein-like  31.61 
 
 
255 aa  67  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0336  hypothetical protein  28.97 
 
 
177 aa  52  0.000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0308  hypothetical protein  28.97 
 
 
177 aa  52  0.000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.301685  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3781  membrane protein of uknown function UCP014873  27.59 
 
 
172 aa  48.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.579535 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1622  membrane protein of uknown function UCP014873  29.01 
 
 
166 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1649  membrane protein of uknown function UCP014873  29.01 
 
 
166 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.983052  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2386  hypothetical protein  30.2 
 
 
166 aa  47  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3618  hypothetical protein  29.45 
 
 
172 aa  43.9  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0504408  normal  0.0132377 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1480  hypothetical protein  27.66 
 
 
301 aa  42.4  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.900362 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5486  membrane protein of uknown function UCP014873  24.52 
 
 
176 aa  41.6  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.648729  normal  0.796721 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1291  hypothetical protein  25 
 
 
169 aa  41.6  0.009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>