More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3363 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3363  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 701 aa  1391    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.826515 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  39.38 
 
 		 1656 aa  453  1.0000000000000001e-126  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1961  Beta-ketoacyl synthase  43.22 
 
 		 2103 aa  451  1e-125  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.771786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1649  AMP-dependent synthetase and ligase  44.18 
 
 		 602 aa  434  1e-120  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.443768 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  39.05 
 
 		 2762 aa  429  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6478  beta-ketoacyl synthase  38.59 
 
 		 1474 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651287  normal  0.801281 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4037  AMP-dependent synthetase and ligase  42.12 
 
 		 597 aa  413  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4074  AMP-dependent synthetase and ligase  42.3 
 
 		 597 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3741  AMP-dependent synthetase and ligase  34.79 
 
 		 725 aa  412  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.101405 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3687  AMP-dependent synthetase and ligase  34.64 
 
 		 725 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5757  amino acid adenylation domain protein  40.54 
 
 		 2997 aa  404  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  39.9 
 
 		 2791 aa  401  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2108  amino acid adenylation domain-containing protein  40.53 
 
 		 2820 aa  399  1e-109  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  39.82 
 
 		 6889 aa  393  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1602  AMP-dependent synthetase and ligase  41.95 
 
 		 578 aa  390  1e-107  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.484756 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2109  AMP-dependent synthetase and ligase  34.32 
 
 		 991 aa  380  1e-104  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.911479  normal  0.633615 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1714  AMP-binding domain-containing protein  43.67 
 
 		 610 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399616  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1800  AMP-binding domain-containing protein  43.67 
 
 		 610 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0293  AMP-binding domain-containing protein  43.49 
 
 		 599 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.117519  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1016  AMP-binding domain-containing protein  43.49 
 
 		 599 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.322447  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0277  AMP-binding domain-containing protein  43.67 
 
 		 599 aa  375  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.48343  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2736  AMP-dependent synthetase and ligase  37.68 
 
 		 611 aa  375  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1302  AMP-binding domain-containing protein  43.49 
 
 		 610 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.679407  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6170  thioester reductase domain protein  37.65 
 
 		 1067 aa  374  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701835  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  38.66 
 
 		 6403 aa  372  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3458  amino acid adenylation domain protein  37.88 
 
 		 2250 aa  371  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000913323 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1972  AMP-dependent synthetase and ligase  36.67 
 
 		 614 aa  369  1e-101  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1903  AMP-dependent synthetase and ligase  40.93 
 
 		 599 aa  372  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0999  AMP-dependent synthetase and ligase  36.88 
 
 		 706 aa  365  1e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.771586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2453  putative acyl-CoA synthase  35.33 
 
 		 588 aa  362  1e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0769746  normal  0.973713 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1746  AMP-dependent synthetase and ligase  39.41 
 
 		 592 aa  360  6e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.689088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  38.92 
 
 		 579 aa  358  1.9999999999999998e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5528  AMP-dependent synthetase and ligase  38.35 
 
 		 1272 aa  357  5e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1832  amino acid adenylation  38.54 
 
 		 1801 aa  356  8.999999999999999e-97  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2181  hypothetical protein  35.78 
 
 		 581 aa  355  2e-96  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2876  AMP-dependent synthetase and ligase  35.84 
 
 		 586 aa  353  5.9999999999999994e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.359525 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2154  hypothetical protein  35.41 
 
 		 581 aa  353  7e-96  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1930  AMP-binding domain-containing protein  38.73 
 
 		 1323 aa  353  7e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.301565  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2786  amino acid adenylation domain-containing protein  38.17 
 
 		 3208 aa  350  4e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0705629 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  36.51 
 
 		 4336 aa  349  8e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3181  AMP-dependent synthetase and ligase  36.38 
 
 		 596 aa  349  9e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.111663 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7308  polyketide synthetase  35.81 
 
 		 755 aa  347  4e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.39684  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0658  acyl-CoA dehydrogenase  38.69 
 
 		 1283 aa  347  6e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.523537  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2039  polyketide synthase  38.69 
 
 		 1276 aa  346  8.999999999999999e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0750  acyl-CoA dehydrogenase  38.69 
 
 		 1291 aa  346  1e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4518  non-ribosomal peptide synthetase, initiating component  33.04 
 
 		 1753 aa  344  4e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5768  AMP-dependent synthetase and ligase  38.49 
 
 		 1292 aa  342  2e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6561  AMP-binding domain-containing protein  38.62 
 
 		 609 aa  340  4e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0102107 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2025  putative syringomycin synthetase  36.81 
 
 		 6272 aa  340  4e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2161  hypothetical protein  36.81 
 
 		 6274 aa  340  5.9999999999999996e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  37.94 
 
 		 4342 aa  340  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  36.53 
 
 		 4336 aa  339  9e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2005  putative syringomycin synthetase  36.81 
 
 		 6271 aa  339  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6306  AMP-dependent synthetase and ligase  38.1 
 
 		 595 aa  339  9.999999999999999e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.580679 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2870  amino acid adenylation domain-containing protein  36.51 
 
 		 3231 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.812927 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3733  amino acid adenylation domain-containing protein  40.07 
 
 		 1779 aa  335  2e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279948 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4760  AMP-dependent synthetase and ligase  39.41 
 
 		 597 aa  335  2e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2099  AMP-binding domain-containing protein  38.65 
 
 		 622 aa  330  6e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.335161  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  37.76 
 
 		 4317 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  36.54 
 
 		 4342 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  38.21 
 
 		 4332 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  37.93 
 
 		 4318 aa  328  2.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1218  AMP-binding domain-containing protein  39.67 
 
 		 606 aa  326  7e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3680  amino acid adenylation domain protein  38 
 
 		 2721 aa  326  1e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  37.76 
 
 		 4317 aa  325  2e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  38.29 
 
 		 4317 aa  324  4e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3036  amino acid adenylation  34.05 
 
 		 4165 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.585184 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  37.11 
 
 		 4317 aa  319  9e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6079  AMP-dependent synthetase and ligase  39.32 
 
 		 555 aa  319  1e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.789001  hitchhiker  0.00908459 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3746  amino acid adenylation domain protein  40.3 
 
 		 1776 aa  319  1e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4756  amino acid adenylation domain-containing protein  38.27 
 
 		 1789 aa  317  3e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1849  AMP-binding domain-containing protein  38.46 
 
 		 621 aa  316  9e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0427  AMP-binding enzyme  38.46 
 
 		 621 aa  316  9e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2154  AMP-binding domain-containing protein  38.76 
 
 		 621 aa  316  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1459  AMP-binding domain-containing protein  38.76 
 
 		 621 aa  316  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0838  AMP-binding domain-containing protein  38.76 
 
 		 621 aa  316  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0523  AMP-binding enzyme  38.27 
 
 		 621 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.746199  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5330  AMP-dependent synthetase and ligase  35.79 
 
 		 608 aa  315  1.9999999999999998e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.611061 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4860  AMP-dependent synthetase and ligase  38.15 
 
 		 582 aa  313  5.999999999999999e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41238  predicted protein  35.23 
 
 		 738 aa  313  6.999999999999999e-84  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3109  aspartate racemase  35.22 
 
 		 1981 aa  311  2e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2367  dihydroaeruginoic acid synthetase  38.39 
 
 		 1699 aa  312  2e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71689  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1087  putative non-ribosomal peptide synthase  33.67 
 
 		 3235 aa  311  4e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2943  Acyl-CoA synthetases  36.41 
 
 		 617 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1161  saframycin Mx1 synthetase B  36.52 
 
 		 617 aa  307  3e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2789  AMP-binding domain-containing protein  36.52 
 
 		 617 aa  307  3e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.472303  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0276  AMP-binding domain-containing protein  36.22 
 
 		 620 aa  307  5.0000000000000004e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1806  polyketide synthase protein  38.28 
 
 		 4268 aa  303  6.000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0723509 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5641  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.72 
 
 		 629 aa  303  8.000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1168  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.49 
 
 		 629 aa  298  2e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3404  AMP-dependent synthetase and ligase  34.85 
 
 		 551 aa  297  4e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.469336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1670  AMP-binding domain-containing protein  39.29 
 
 		 605 aa  295  2e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0181  peptide synthetase NRPS5-4-3  39.29 
 
 		 1005 aa  294  4e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.757784  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5392  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.49 
 
 		 629 aa  294  4e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.117566 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1588  AMP-binding domain-containing protein  39.46 
 
 		 605 aa  294  5e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5297  KR domain protein  31.59 
 
 		 2727 aa  293  7e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0222593 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5011  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.32 
 
 		 629 aa  292  2e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.934148  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5099  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.32 
 
 		 629 aa  292  2e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.383876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8830  peptide synthetase  36.75 
 
 		 574 aa  291  3e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.426227  decreased coverage  0.000549729 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3604  putative fatty-acid--CoA ligase  35.53 
 
 		 593 aa  290  7e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.698537  normal  0.297666 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>